RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597259.1

HERC3-212, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 313 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-212ENST00000597259 OR10G8Q8NGN5 311 aa3.46□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 OR10AG1Q8NH19 301 aa3.46□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 FMC1Q96HJ9 113 aa3.46□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 DERL1Q9BUN8 251 aa3.46□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa3.45□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa3.45□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 MUC21A0A140T8X8 626 aa3.45□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 A0A1B0GV50 99 aa3.45□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 C1QBP02746 253 aa3.45□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 CXCL1P09341 107 aa3.45□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 FAM162BQ5T6X4 162 aa3.45□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa3.45□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 BAALCQ8WXS3 180 aa3.45□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 C11orf52Q96A22 123 aa3.45□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 GFRA4Q9GZZ7 299 aa3.45□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa3.44□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 C19orf71A6NCJ1 209 aa3.44□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 M0R381 172 aa3.44□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 BCL2L11O43521 198 aa3.44□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 IGLC6P0CF74 106 aa3.44□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 GZMBP10144 247 aa3.44□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 S100A4P26447 101 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 GAGE2BQ13066 116 aa3.44□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 GAGE2EQ4V326 116 aa3.44□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 MPV17L2Q567V2 206 aa3.44□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 FAM74A4Q5TZK3 123 aa3.44□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 GAGE2AQ6NT46 116 aa3.44□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 SCXQ7RTU7 201 aa3.44□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 STOML3Q8TAV4 291 aa3.44□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 FAM213BQ8TBF2 198 aa3.44□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 SFT2D1Q8WV19 159 aa3.44□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 TCEAL7Q9BRU2 100 aa3.44□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 GAGE2DQ9UEU5 116 aa3.44□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 KLK12Q9UKR0 248 aa3.44□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa3.43□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 A0A087X002 238 aa3.43□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa3.43□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa3.43□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa3.43□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 RAB19A4D1S5 217 aa3.43□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 RBFOX3A6NFN3 312 aa3.43□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 UMAD1C9J7I0 102 aa3.43□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 PANO1I0J062 215 aa3.43□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 PSCAO43653 123 aa3.43□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 OR5AL1P0C617 328 aa3.43□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 TPT1P13693 172 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 AKR1C3P42330 323 aa3.43□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 RPL35P42766 123 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 RAB4BP61018 213 aa3.43□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 UBE2G1P62253 170 aa3.43□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 CST9LP1Q5W188 147 aa3.43□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 TMUB2Q71RG4 321 aa3.43□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 ZFP82Q8N141 532 aa3.43□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 Q8N976 141 aa3.43□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 FRZBQ92765 325 aa3.43□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 PRAC1Q96KF2 57 aa3.43□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 PRR34Q9NV39 138 aa3.43□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 VAX2Q9UIW0 290 aa3.43□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa3.43□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 A0A087WWC5 75 aa3.42□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 A0A0D9SG52 128 aa3.42□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 M0QY20 66 aa3.42□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 LRP2P98164 4655 aa3.42□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 KIAA1644Q3SXP7 199 aa3.42□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 BAGE2Q86Y30 109 aa3.42□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa3.42□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 CHCHD7Q9BUK0 85 aa3.42□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa3.42□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa3.41□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 K7EN84 100 aa3.41□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 S100A9P06702 114 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 SULT1A2P50226 295 aa3.41□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 CENPWQ5EE01 88 aa3.41□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 C20orf203Q8NBC4 194 aa3.41□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 UBE2WQ96B02 151 aa3.41□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 CHAC1Q9BUX1 264 aa3.41□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.41□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa3.4□□□□□ -1.87
HERC3-212ENST00000597259 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa3.4□□□□□ -1.87
HERC3-212ENST00000597259 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa3.4□□□□□ -1.87
HERC3-212ENST00000597259 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
HERC3-212ENST00000597259 SSTP61278 116 aa3.4□□□□□ -1.87
HERC3-212ENST00000597259 RBX1P62877 108 aa3.4□□□□□ -1.87
HERC3-212ENST00000597259 ZNF56Q15929 161 aa3.4□□□□□ -1.87
HERC3-212ENST00000597259 IQCJQ1A5X6 159 aa3.4□□□□□ -1.87
HERC3-212ENST00000597259 TCTE3Q8IZS6 198 aa3.4□□□□□ -1.87
HERC3-212ENST00000597259 C15orf54Q8N8G6 183 aa3.4□□□□□ -1.87
HERC3-212ENST00000597259 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa3.4□□□□□ -1.87
HERC3-212ENST00000597259 GTSF1Q8WW33 167 aa3.4□□□□□ -1.87
HERC3-212ENST00000597259 CNFNQ9BYD5 112 aa3.4□□□□□ -1.87
HERC3-212ENST00000597259 GNG13Q9P2W3 67 aa3.4□□□□□ -1.87
HERC3-212ENST00000597259 A0A087WX48 190 aa3.39□□□□□ -1.87
HERC3-212ENST00000597259 CTRLP40313 264 aa3.39□□□□□ -1.87
HERC3-212ENST00000597259 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms