RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591856.1

EFTUD2-221, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-221ENST00000591856 TSHBP01222 138 aa5.51□□□□□ -1.53
EFTUD2-221ENST00000591856 SMCO4Q9NRQ5 59 aa5.51□□□□□ -1.53
EFTUD2-221ENST00000591856 DNAH6Q9C0G6 4158 aa5.5□□□□□ -1.53
EFTUD2-221ENST00000591856 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa5.5□□□□□ -1.53
EFTUD2-221ENST00000591856 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa5.5□□□□□ -1.53
EFTUD2-221ENST00000591856 H7C423 109 aa5.5□□□□□ -1.53
EFTUD2-221ENST00000591856 TCAPO15273 167 aa5.5□□□□□ -1.53
EFTUD2-221ENST00000591856 ESDP10768 282 aa5.5□□□□□ -1.53
EFTUD2-221ENST00000591856 AMTP48728 403 aa5.5□□□□□ -1.53
EFTUD2-221ENST00000591856 CBLN2Q8IUK8 224 aa5.5□□□□□ -1.53
EFTUD2-221ENST00000591856 PRELID3AQ96N28 172 aa5.5□□□□□ -1.53
EFTUD2-221ENST00000591856 TMEM243Q9BU79 118 aa5.5□□□□□ -1.53
EFTUD2-221ENST00000591856 SACSQ9NZJ4 4579 aa5.5□□□□□ -1.53
EFTUD2-221ENST00000591856 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-221ENST00000591856 A0A1B0GUV1 79 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-221ENST00000591856 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-221ENST00000591856 VCYO14598 125 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-221ENST00000591856 APCSP02743 223 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-221ENST00000591856 MPV17L2Q567V2 206 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-221ENST00000591856 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-221ENST00000591856 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-221ENST00000591856 Q8N3U1 123 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-221ENST00000591856 KIR2DL4Q99706 377 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-221ENST00000591856 RYR2Q92736 4967 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-221ENST00000591856 K7EMI3 77 aa5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-221ENST00000591856 RTL8CO15255 209 aa5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-221ENST00000591856 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-221ENST00000591856 C6orf223Q8N319 242 aa5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-221ENST00000591856 CHCHD5Q9BSY4 110 aa5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-221ENST00000591856 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-221ENST00000591856 PRR34Q9NV39 138 aa5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-221ENST00000591856 A0A087WX48 190 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-221ENST00000591856 LINC01546A6NGU7 62 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-221ENST00000591856 M0R2N4 97 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-221ENST00000591856 PMCHP20382 165 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-221ENST00000591856 RBX1P62877 108 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-221ENST00000591856 C1orf134Q5TEV5 83 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-221ENST00000591856 NFE4Q86UQ8 179 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-221ENST00000591856 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-221ENST00000591856 MAP1LC3AQ9H492 121 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-221ENST00000591856 ATP6V1G1O75348 118 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 IGHV3-30P01768 117 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 IGHV3-33P01772 117 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 FCER1GP30273 86 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 GAGE6Q13070 117 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 LINC00336Q6ZUF6 198 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 Q8N8P6 123 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 Q8N976 141 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 C20orf203Q8NBC4 194 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 TIMM21Q9BVV7 248 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa5.45□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 COLCA2A8K830 154 aa5.45□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 UBE2L6O14933 153 aa5.45□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 FGF6P10767 208 aa5.45□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 S100A1P23297 94 aa5.45□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 Q0VG73 95 aa5.45□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 FABP9Q0Z7S8 132 aa5.45□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 KIAA1644Q3SXP7 199 aa5.45□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa5.45□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 RYR3Q15413 4870 aa5.45□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa5.44□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 SMAGPQ0VAQ4 97 aa5.44□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 MIAQ16674 131 aa5.44□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 ORMDL2Q53FV1 153 aa5.44□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 C18orf32Q8TCD1 76 aa5.44□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 SPANXA1Q9NS26 97 aa5.44□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 KLK12Q9UKR0 248 aa5.44□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa5.44□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 COX11Q9Y6N1 276 aa5.44□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 A0A1B0GVY2 172 aa5.43□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 TMEM262E9PQX1 116 aa5.43□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 CRPP02741 224 aa5.43□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 ANGP03950 147 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 NPSP0C0P6 89 aa5.43□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 RAB5AP20339 215 aa5.43□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa5.43□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 ENHOQ6UWT2 76 aa5.43□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa5.43□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 FAM104AQ969W3 186 aa5.43□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 TMEM18Q96B42 140 aa5.43□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 RMI2Q96E14 147 aa5.43□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa5.43□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 HYDINQ4G0P3 5121 aa5.43□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa5.42□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 LINC01549A6NIU2 74 aa5.42□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 SCO1O75880 301 aa5.42□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 RPL39P62891 51 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 REG3AQ06141 175 aa5.42□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa5.42□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 LINC00269Q8N2A0 174 aa5.42□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 OR5A1Q8NGJ0 315 aa5.42□□□□□ -1.54
EFTUD2-221ENST00000591856 UBE2WQ96B02 151 aa5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.1 ms