RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 CHAC1Q9BUX1 264 aa5.94□□□□□ -1.46
GGA3-218ENST00000584243 LINC00527Q9UJ94 153 aa5.94□□□□□ -1.46
GGA3-218ENST00000584243 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa5.93□□□□□ -1.46
GGA3-218ENST00000584243 J3QR89 54 aa5.93□□□□□ -1.46
GGA3-218ENST00000584243 CIDEAO60543 219 aa5.93□□□□□ -1.46
GGA3-218ENST00000584243 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
GGA3-218ENST00000584243 PMVKQ15126 192 aa5.93□□□□□ -1.46
GGA3-218ENST00000584243 PRR9Q5T870 116 aa5.93□□□□□ -1.46
GGA3-218ENST00000584243 NDUFA11Q86Y39 141 aa5.93□□□□□ -1.46
GGA3-218ENST00000584243 Q8N1X5 172 aa5.93□□□□□ -1.46
GGA3-218ENST00000584243 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
GGA3-218ENST00000584243 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
GGA3-218ENST00000584243 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
GGA3-218ENST00000584243 SPXQ9BT56 116 aa5.93□□□□□ -1.46
GGA3-218ENST00000584243 CSTL1Q9H114 145 aa5.93□□□□□ -1.46
GGA3-218ENST00000584243 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
GGA3-218ENST00000584243 DKK2Q9UBU2 259 aa5.93□□□□□ -1.46
GGA3-218ENST00000584243 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa5.93□□□□□ -1.46
GGA3-218ENST00000584243 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa5.92□□□□□ -1.46
GGA3-218ENST00000584243 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa5.92□□□□□ -1.46
GGA3-218ENST00000584243 CBY3A6NI87 242 aa5.92□□□□□ -1.46
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GGA3-218ENST00000584243 CCL25O15444 150 aa5.92□□□□□ -1.46
GGA3-218ENST00000584243 GCSHP23434 173 aa5.92□□□□□ -1.46
GGA3-218ENST00000584243 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
GGA3-218ENST00000584243 ZNF415Q09FC8 603 aa5.92□□□□□ -1.46
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GGA3-218ENST00000584243 RAX2Q96IS3 184 aa5.92□□□□□ -1.46
GGA3-218ENST00000584243 DNAJC30Q96LL9 226 aa5.92□□□□□ -1.46
GGA3-218ENST00000584243 ZNF702PQ9H963 129 aa5.92□□□□□ -1.46
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GGA3-218ENST00000584243 C11orf86A6NJI1 115 aa5.91□□□□□ -1.46
GGA3-218ENST00000584243 F5H697 171 aa5.91□□□□□ -1.46
GGA3-218ENST00000584243 I3L3M4 83 aa5.91□□□□□ -1.46
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GGA3-218ENST00000584243 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa5.91□□□□□ -1.46
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GGA3-218ENST00000584243 A0A1B0GWB2 263 aa5.9□□□□□ -1.46
GGA3-218ENST00000584243 GAGE12BA1L429 117 aa5.9□□□□□ -1.46
GGA3-218ENST00000584243 SDHAF1A6NFY7 115 aa5.9□□□□□ -1.46
GGA3-218ENST00000584243 INSP01308 110 aa5.9□□□□□ -1.46
GGA3-218ENST00000584243 ZNF688P0C7X2 276 aa5.9□□□□□ -1.46
GGA3-218ENST00000584243 SYNJ2BPP57105 145 aa5.9□□□□□ -1.46
GGA3-218ENST00000584243 LINC00315P59091 139 aa5.9□□□□□ -1.46
GGA3-218ENST00000584243 SUMO4Q6EEV6 95 aa5.9□□□□□ -1.46
GGA3-218ENST00000584243 ZFP2Q6ZN57 461 aa5.9□□□□□ -1.46
GGA3-218ENST00000584243 DYNLRB2Q8TF09 96 aa5.9□□□□□ -1.46
GGA3-218ENST00000584243 BAALCQ8WXS3 180 aa5.9□□□□□ -1.46
GGA3-218ENST00000584243 HIST1H4GQ99525 98 aa5.9□□□□□ -1.46
GGA3-218ENST00000584243 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
GGA3-218ENST00000584243 MDFICQ9P1T7 246 aa5.9□□□□□ -1.46
GGA3-218ENST00000584243 TP73-AS1Q9UF72 201 aa5.9□□□□□ -1.46
GGA3-218ENST00000584243 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa5.89□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 PRSS29PA6NIE9 313 aa5.89□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 IGIPA6NJ69 53 aa5.89□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 F8W1H4 67 aa5.89□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 M0QY20 66 aa5.89□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 M0R2P5 195 aa5.89□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 ZNF56Q15929 161 aa5.89□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 ZNF876PQ49A33 203 aa5.89□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa5.89□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 Q6ZVH6 145 aa5.89□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 NFE4Q86UQ8 179 aa5.89□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 PCP2Q8IVA1 136 aa5.89□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 COPS9Q8WXC6 57 aa5.89□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 PLEKHB2Q96CS7 222 aa5.89□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 SPANXA1Q9NS26 97 aa5.89□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa5.89□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.89□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 GNRH2O43555 120 aa5.88□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 UFSP1Q6NVU6 142 aa5.88□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 AMTNQ6UX39 209 aa5.88□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.88□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 GTSCR1Q86UQ5 136 aa5.88□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 Q8N1Y9 231 aa5.88□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 TM2D3Q9BRN9 247 aa5.88□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 VCX2Q9H322 139 aa5.88□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 CST9LQ9H4G1 147 aa5.88□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 SPCS1Q9Y6A9 102 aa5.88□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa5.87□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa5.87□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 F6UB75 175 aa5.87□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 H3BMM0 161 aa5.87□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 H3BUT2 72 aa5.87□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 J3KRW8 73 aa5.87□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 OCIAD2Q56VL3 154 aa5.87□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 LINC00482Q8N8I6 264 aa5.87□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 C20orf203Q8NBC4 194 aa5.87□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 PRADC1Q9BSG0 188 aa5.87□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa5.87□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa5.86□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa5.86□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 A0A1W2PRX2 142 aa5.86□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 ZNF815PA8K554 130 aa5.86□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 TMEM238C9JI98 176 aa5.86□□□□□ -1.47
GGA3-218ENST00000584243 GAS8-AS1O95177 125 aa5.86□□□□□ -1.47
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