RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579358.1

MKS1-208, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 4

Gene MKS1, Length 567 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-208ENST00000579358 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
MKS1-208ENST00000579358 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
MKS1-208ENST00000579358 GAS8-AS1O95177 125 aa6.72□□□□□ -1.33
MKS1-208ENST00000579358 RPS10P46783 165 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
MKS1-208ENST00000579358 AMTP48728 403 aa6.72□□□□□ -1.33
MKS1-208ENST00000579358 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
MKS1-208ENST00000579358 RMI2Q96E14 147 aa6.72□□□□□ -1.33
MKS1-208ENST00000579358 BTF3L4Q96K17 158 aa6.72□□□□□ -1.33
MKS1-208ENST00000579358 TMEM70Q9BUB7 260 aa6.72□□□□□ -1.33
MKS1-208ENST00000579358 TM2D2Q9BX73 214 aa6.72□□□□□ -1.33
MKS1-208ENST00000579358 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.72□□□□□ -1.33
MKS1-208ENST00000579358 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.72□□□□□ -1.33
MKS1-208ENST00000579358 Q9HAA7 133 aa6.72□□□□□ -1.33
MKS1-208ENST00000579358 KLK12Q9UKR0 248 aa6.72□□□□□ -1.33
MKS1-208ENST00000579358 COX11Q9Y6N1 276 aa6.72□□□□□ -1.33
MKS1-208ENST00000579358 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.72□□□□□ -1.33
MKS1-208ENST00000579358 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.71□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 A0A1B0GUV1 79 aa6.71□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 I3L3M4 83 aa6.71□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 PSCAO43653 123 aa6.71□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 APCSP02743 223 aa6.71□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 PMCHP20382 165 aa6.71□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 RBX1P62877 108 aa6.71□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 Q0VG73 95 aa6.71□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 GAGE6Q13070 117 aa6.71□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 ATRAIDQ6UW56 229 aa6.71□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 NRACQ8N912 160 aa6.71□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 TMEM242Q9NWH2 141 aa6.71□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.7□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa6.7□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 A0A087WTM6 91 aa6.7□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 SMKR1H3BMG3 65 aa6.7□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 H7C423 109 aa6.7□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 J3QL48 77 aa6.7□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 UBE2L6O14933 153 aa6.7□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 CRPP02741 224 aa6.7□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 PPBPP02775 128 aa6.7□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 CKS2P33552 79 aa6.7□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 RHEBQ15382 184 aa6.7□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.7□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 Q8N976 141 aa6.7□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 UBE2WQ96B02 151 aa6.7□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 C20orf78Q9BR46 151 aa6.7□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 PRR34Q9NV39 138 aa6.7□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.69□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 VCYO14598 125 aa6.69□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 PHOX2AO14813 284 aa6.69□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 TSHBP01222 138 aa6.69□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 ENHOQ6UWT2 76 aa6.69□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.69□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 PKD1P98161 4303 aa6.68□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 C7orf77A4D0Y5 90 aa6.68□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 D6R8Y8 96 aa6.68□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 TNFRSF6BO95407 300 aa6.68□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 ESDP10768 282 aa6.68□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 S100PP25815 95 aa6.68□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 MIAQ16674 131 aa6.68□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.68□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 ORMDL3Q8N138 153 aa6.68□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.68□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.68□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 KIR2DL4Q99706 377 aa6.68□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.68□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa6.68□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.67□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.67□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 TCAPO15273 167 aa6.67□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.67□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.67□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 PKHD1P08F94 4074 aa6.66□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 C16orf90A8MZG2 172 aa6.66□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 NPYP01303 97 aa6.66□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 FGF6P10767 208 aa6.66□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 FCER1GP30273 86 aa6.66□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 KRTAP10-2P60368 255 aa6.66□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 REG3AQ06141 175 aa6.66□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.66□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.66□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 SVBPQ8N300 66 aa6.66□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 PRELID3AQ96N28 172 aa6.66□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.66□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 RPS10P5Q9NQ39 176 aa6.66□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.65□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 PRSS47A8MTI9 375 aa6.65□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 SNAPINO95295 136 aa6.65□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 APOC3P02656 99 aa6.65□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.65□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 COX19Q49B96 90 aa6.65□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.65□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 Q8N814 137 aa6.65□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.65□□□□□ -1.34
MKS1-208ENST00000579358 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
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