RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 S100ZQ8WXG8 99 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 HYLS1Q96M11 299 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 MLST8Q9BVC4 326 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 V9GYH0 126 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 TMBIM6P55061 237 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 S100A10P60903 97 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 CMTM2Q8TAZ6 248 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 NMES1Q9C002 83 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 C11orf1Q9H5F2 150 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 J3KT08 172 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 LINC00694P0DN24 101 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 SMAGPQ0VAQ4 97 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 Q0VG73 95 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF506Q5JVG8 444 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 OR2T35Q8NGX2 323 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 THAP6Q8TBB0 222 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 TNFSF18Q9UNG2 199 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 PGPA6NDG6 321 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 AMTP48728 403 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 FABP9Q0Z7S8 132 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 FAM74A1Q5RGS3 127 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 ZFP2Q6ZN57 461 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 LINC01561Q8N1V8 128 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 MBD3L1Q8WWY6 194 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 TVP23CQ96ET8 276 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 C9orf85Q96MD7 179 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 CHCHD7Q9BUK0 85 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 SAMD10Q9BYL1 202 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 PARLQ9H300 379 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 OTORQ9NRC9 128 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 KCNIP2Q9NS61 270 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 Q9UF83 564 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 A0A1B0GX51 115 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 H3BMQ9 156 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 SMIM17P0DL12 118 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 C9orf163Q8N9P6 203 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 NDFIP1Q9BT67 221 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 SMIM3Q9BZL3 60 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 A8MWV9 139 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM262E9PQX1 116 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 C17orf112F2Z3M2 114 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 PANO1I0J062 215 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 GAS8-AS1O95177 125 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 HLA-DQA1P01909 254 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 CRPP02741 224 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 PRSS1P07477 247 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 TAS2R45P59539 299 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 KHDC3LQ587J8 217 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 PYY3Q5JQD4 70 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 OR5A1Q8NGJ0 315 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 OR10G7Q8NGN6 311 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 OR5C1Q8NGR4 320 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 BORCS7Q96B45 105 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 DPH3Q96FX2 82 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 LINC00479Q96M42 142 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 C11orf21Q9P2W6 132 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 NAT8BQ9UHF3 227 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 BTCP35070 178 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 GNG5P63218 68 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 RPL24P83731 157 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM241Q24JQ0 296 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM75Q8N9X5 138 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 OR2G3Q8NGZ4 309 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 OR5AL1P0C617 328 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 S100A4P26447 101 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 ENHOQ6UWT2 76 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 SDIM1Q6ZPB5 146 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 C15orf54Q8N8G6 183 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 LINC01600Q96MT4 127 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 RHODO00212 210 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 IL15RAQ13261 267 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 TCTE3Q8IZS6 198 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 PRO1933Q9H354 126 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 JPT2Q9H910 190 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 OR5AC2Q9NZP5 309 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 NAT8Q9UHE5 227 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 FABP5P3A8MUU1 101 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 ANGP03950 147 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 GNG4P50150 75 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 FAM74A4Q5TZK3 123 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 UFSP1Q6NVU6 142 aa5.79□□□□□ -1.48
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