RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577256.5

ATG13-223, Transcript of autophagy related 13, human

TSL 4

Gene ATG13, Length 613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG13-223	ENST00000577256	MRAP2	Q96G30	205 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ATG13-223	ENST00000577256	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ATG13-223	ENST00000577256		A0A1B0GUV1	79 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ATG13-223	ENST00000577256	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ATG13-223	ENST00000577256	UBE2L6	O14933	153 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ATG13-223	ENST00000577256	RAB4A	P20338	218 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ATG13-223	ENST00000577256	RNF185	Q96GF1	192 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ATG13-223	ENST00000577256	PRR34	Q9NV39	138 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ATG13-223	ENST00000577256		A0A1B0GW15	77 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ATG13-223	ENST00000577256	GCSH	P23434	173 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ATG13-223	ENST00000577256	WFDC2	Q14508	124 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ATG13-223	ENST00000577256	AMN1	Q8IY45	258 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ATG13-223	ENST00000577256	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ATG13-223	ENST00000577256	BAALC	Q8WXS3	180 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ATG13-223	ENST00000577256	LECT2	O14960	151 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ATG13-223	ENST00000577256	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
ATG13-223	ENST00000577256	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ATG13-223	ENST00000577256	ST20	Q9HBF5	79 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ATG13-223	ENST00000577256		I3L3M4	83 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ATG13-223	ENST00000577256	PPP1R2P9	O14990	202 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ATG13-223	ENST00000577256	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ATG13-223	ENST00000577256	GAS8-AS1	O95177	125 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATG13-223	ENST00000577256	PPP1R17	O96001	155 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATG13-223	ENST00000577256	APCS	P02743	223 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATG13-223	ENST00000577256	S100A8	P05109	93 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATG13-223	ENST00000577256	PMCH	P20382	165 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATG13-223	ENST00000577256	KRTAP10-1	P60331	282 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATG13-223	ENST00000577256	IFITM2	Q01629	132 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATG13-223	ENST00000577256	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATG13-223	ENST00000577256	HSPG2	P98160	4391 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATG13-223	ENST00000577256		H7C423	109 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ATG13-223	ENST00000577256	CAMP	P49913	170 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ATG13-223	ENST00000577256	REG3A	Q06141	175 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ATG13-223	ENST00000577256	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ATG13-223	ENST00000577256	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ATG13-223	ENST00000577256	RYR1	P21817	5038 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ATG13-223	ENST00000577256	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
ATG13-223	ENST00000577256	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ATG13-223	ENST00000577256	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
ATG13-223	ENST00000577256	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
ATG13-223	ENST00000577256	C14orf177	Q52M58	125 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ATG13-223	ENST00000577256	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ATG13-223	ENST00000577256	HLA-DQA1	P01909	254 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ATG13-223	ENST00000577256	HBB	P68871	147 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ATG13-223	ENST00000577256	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ATG13-223	ENST00000577256	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
ATG13-223	ENST00000577256	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ATG13-223	ENST00000577256		F8W036	122 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ATG13-223	ENST00000577256	SMKR1	H3BMG3	65 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ATG13-223	ENST00000577256	TSHB	P01222	138 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ATG13-223	ENST00000577256	MT-ND4L	P03901	98 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ATG13-223	ENST00000577256	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
ATG13-223	ENST00000577256	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
ATG13-223	ENST00000577256	UQCC3	Q6UW78	93 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ATG13-223	ENST00000577256	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ATG13-223	ENST00000577256	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
ATG13-223	ENST00000577256		A0A1B0GXF2	115 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ATG13-223	ENST00000577256	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
ATG13-223	ENST00000577256	LINC00862	A6NCI5	91 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ATG13-223	ENST00000577256	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
ATG13-223	ENST00000577256	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ATG13-223	ENST00000577256	NRAC	Q8N912	160 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ATG13-223	ENST00000577256	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ATG13-223	ENST00000577256	VCY	O14598	125 aa		11.57	□□□□□ -0.56
ATG13-223	ENST00000577256	FGF6	P10767	208 aa		11.57	□□□□□ -0.56
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	11.57	□□□□□ -0.56
ATG13-223	ENST00000577256	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	11.57	□□□□□ -0.56
ATG13-223	ENST00000577256	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		11.57	□□□□□ -0.56
ATG13-223	ENST00000577256	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		11.56	□□□□□ -0.56
ATG13-223	ENST00000577256	ESD	P10768	282 aa		11.56	□□□□□ -0.56
ATG13-223	ENST00000577256	CKS2	P33552	79 aa		11.56	□□□□□ -0.56
ATG13-223	ENST00000577256	XG	P55808	180 aa		11.56	□□□□□ -0.56
ATG13-223	ENST00000577256	USP17L23	D6RBM5	183 aa		11.55	□□□□□ -0.56
ATG13-223	ENST00000577256		Q8N1X5	172 aa		11.55	□□□□□ -0.56
ATG13-223	ENST00000577256	BTF3L4	Q96K17	158 aa		11.55	□□□□□ -0.56
ATG13-223	ENST00000577256	KIR2DL4	Q99706	377 aa		11.55	□□□□□ -0.56
ATG13-223	ENST00000577256	C20orf78	Q9BR46	151 aa		11.55	□□□□□ -0.56
ATG13-223	ENST00000577256	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		11.54	□□□□□ -0.56
ATG13-223	ENST00000577256	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		11.54	□□□□□ -0.56
ATG13-223	ENST00000577256	FCER1G	P30273	86 aa		11.54	□□□□□ -0.56
ATG13-223	ENST00000577256	TMEM101	Q96IK0	257 aa		11.54	□□□□□ -0.56
ATG13-223	ENST00000577256	TMEM218	A2RU14	115 aa		11.53	□□□□□ -0.56
ATG13-223	ENST00000577256	PPBP	P02775	128 aa		11.53	□□□□□ -0.56
ATG13-223	ENST00000577256	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	11.53	□□□□□ -0.56
ATG13-223	ENST00000577256		D6R8Y8	96 aa		11.52	□□□□□ -0.57
ATG13-223	ENST00000577256	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	11.52	□□□□□ -0.57
ATG13-223	ENST00000577256	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		11.52	□□□□□ -0.57
ATG13-223	ENST00000577256	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ATG13-223	ENST00000577256	PHOX2A	O14813	284 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ATG13-223	ENST00000577256	TCAP	O15273	167 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ATG13-223	ENST00000577256	TNFRSF6B	O95407	300 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ATG13-223	ENST00000577256	ADCYAP1	P18509	176 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ATG13-223	ENST00000577256	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ATG13-223	ENST00000577256	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ATG13-223	ENST00000577256	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ATG13-223	ENST00000577256	PRSS1	P07477	247 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ATG13-223	ENST00000577256	COMMD7	Q86VX2	200 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ATG13-223	ENST00000577256	ORMDL3	Q8N138	153 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ATG13-223	ENST00000577256	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ATG13-223	ENST00000577256	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		11.49	□□□□□ -0.57

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