RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM262E9PQX1 116 aa22.37■■□□□ 1.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNAH2Q9P225 4427 aa22.37■■□□□ 1.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 AMTP48728 403 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM136Q6ZRR5 245 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM243Q9BU79 118 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 TNFRSF6BO95407 300 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 C20orf78Q9BR46 151 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 PHOX2AO14813 284 aa22.35■■□□□ 1.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 LINC00336Q6ZUF6 198 aa22.35■■□□□ 1.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 VCYO14598 125 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 LAGE3Q14657 143 aa22.33■■□□□ 1.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 MPV17L2Q567V2 206 aa22.33■■□□□ 1.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 APCSP02743 223 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 COX19Q49B96 90 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 NPYP01303 97 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 GAGE6Q13070 117 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATRAIDQ6UW56 229 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 NFE4Q86UQ8 179 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRELID3AQ96N28 172 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 HLA-DQA1P01909 254 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPL32P62910 135 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 ELOBQ15370 118 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 GNB1LQ9BYB4 327 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 FRAS1Q86XX4 4008 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 TSHBP01222 138 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNAH10Q8IVF4 4471 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 UBE2L6O14933 153 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIR2DL4Q99706 377 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLK12Q9UKR0 248 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q8N976 141 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 RBX1P62877 108 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 SMIM2Q9BVW6 85 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRSS29PA6NIE9 313 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 MT-ND6P03923 174 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 FCER1GP30273 86 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1B0GUV1 79 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 H7C423 109 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANGP03950 147 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 ESDP10768 282 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q9HAA7 133 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 TCAPO15273 167 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRSS47A8MTI9 375 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIAA1644Q3SXP7 199 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1-209ENST00000574205 UBE2WQ96B02 151 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAP1LC3AQ9H492 121 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1-209ENST00000574205 SMCO4Q9NRQ5 59 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1-209ENST00000574205 TNP2Q05952 138 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q0VG73 95 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1-209ENST00000574205 C20orf203Q8NBC4 194 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1-209ENST00000574205 YPEL4Q96NS1 127 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1-209ENST00000574205 CRPP02741 224 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1-209ENST00000574205 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1-209ENST00000574205 CBLN2Q8IUK8 224 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNAH17Q9UFH2 4485 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1-209ENST00000574205 FGF6P10767 208 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRR34Q9NV39 138 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAT2Q9NYQ8 4349 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CTDNEP1-209ENST00000574205 ENHOQ6UWT2 76 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDNEP1-209ENST00000574205 LINC00269Q8N2A0 174 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDNEP1-209ENST00000574205 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 FABP9Q0Z7S8 132 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 TM2D2Q9BX73 214 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 RMI2Q96E14 147 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 PSCAO43653 123 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB5AP20339 215 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 COX11Q9Y6N1 276 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 REG3AQ06141 175 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 MIAQ16674 131 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q8N8P6 123 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM18Q96B42 140 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLPSL2Q6UWE3 100 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM101Q96IK0 257 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 SMAGPQ0VAQ4 97 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1B0GVY2 172 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 C1orf43Q9BWL3 253 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR5A1Q8NGJ0 315 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 K7EMI3 77 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 TIMM21Q9BVV7 248 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPL39P62891 51 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
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