RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563387.5

C15orf40-210, Transcript of chromosome 15 open reading frame 40, humanhuman

TSL 3

Gene C15orf40, Length 419 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40-210ENST00000563387 Q8N2B8 174 aa3.32□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 CLEC2BQ92478 149 aa3.32□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa3.32□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 CCL13Q99616 98 aa3.32□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 SDK2Q58EX2 2172 aa3.32□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 CSPG4Q6UVK1 2322 aa3.31□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 LRRK1Q38SD2 2015 aa3.31□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa3.31□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 C4orf51C9J302 202 aa3.31□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 E7EUB6 86 aa3.31□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 I3L3M4 83 aa3.31□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 M0R1W7 72 aa3.31□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 ERC2-IT1O76042 136 aa3.31□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 WISP2O76076 250 aa3.31□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 IGKV1D-12P01611 117 aa3.31□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 STATHP02808 62 aa3.31□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 BAALC-AS2P0C853 105 aa3.31□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 MP68P56378 58 aa3.31□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 Q0VFX4 171 aa3.31□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 SPANXN1Q5VSR9 72 aa3.31□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 CLEC19AQ6UXS0 136 aa3.31□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa3.31□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 Q6ZPA2 131 aa3.31□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 MUSTN1Q8IVN3 82 aa3.31□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 ZNF524Q96C55 264 aa3.31□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 IMMP1LQ96LU5 166 aa3.31□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 PRR25Q96S07 402 aa3.31□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 UBL5Q9BZL1 73 aa3.31□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa3.3□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa3.3□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa3.3□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 IGLV2-14P01704 120 aa3.3□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 Q8IYB0 196 aa3.3□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 Q8N6K4 173 aa3.3□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 WFDC5Q8TCV5 224 aa3.3□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 CCL17Q92583 94 aa3.3□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 RMI2Q96E14 147 aa3.3□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 TMEM141Q96I45 108 aa3.3□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 SMIM2Q9BVW6 85 aa3.3□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 CTSZQ9UBR2 303 aa3.3□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 TACC2O95359 2948 aa3.29□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa3.29□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa3.29□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa3.29□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa3.29□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 C17orf98A8MV24 154 aa3.29□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 PRYO14603 147 aa3.29□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 TRBV12-3P01733 135 aa3.29□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 NNATQ16517 81 aa3.29□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 MIAQ16674 131 aa3.29□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 DEFB134Q4QY38 66 aa3.29□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 CLLU1OSQ5K130 101 aa3.29□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa3.29□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa3.29□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 LINC00269Q8N2A0 174 aa3.29□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 LYPD1Q8N2G4 141 aa3.29□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 NRACQ8N912 160 aa3.29□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 DIRC1Q969H9 104 aa3.29□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 TMEM14CQ9P0S9 112 aa3.29□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 SNURFQ9Y675 71 aa3.29□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 SHANK1Q9Y566 2161 aa3.29□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 DOCK7Q96N67 2140 aa3.29□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 ACANP16112 2415 aa3.29□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa3.29□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 CUBNO60494 3623 aa3.29□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa3.28□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa3.28□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa3.28□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 A0A0J9YXY3 114 aa3.28□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 RPL28P46779 137 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 LINC00205P59089 165 aa3.28□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 ERHP84090 104 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 PRCDQ00LT1 54 aa3.28□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 C2orf66Q6UXQ4 117 aa3.28□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 TMEM61Q8N0U2 210 aa3.28□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa3.28□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 RNF185Q96GF1 192 aa3.28□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 CNFNQ9BYD5 112 aa3.28□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa3.28□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa3.28□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa3.28□□□□□ -1.88
C15orf40-210ENST00000563387 TGP01266 2768 aa3.28□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 TRAV21A0A0B4J279 112 aa3.27□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa3.27□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 OVOL3O00110 214 aa3.27□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 C19orf54Q5BKX5 351 aa3.27□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 C10orf128Q5T292 105 aa3.27□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 ZNF491Q8N8L2 437 aa3.27□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 SPTSSBQ8NFR3 76 aa3.27□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 X6R8D5 127 aa3.27□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 FER1L5A0AVI2 2057 aa3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.1 ms