RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561136.1

TMOD3-209, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 803 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-209ENST00000561136 OR8B3Q8NGG8 313 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF702PQ9H963 129 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 CYTL1Q9NRR1 136 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 ZNRD1Q9P1U0 126 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 EPDR1Q9UM22 224 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 FRAS1Q86XX4 4008 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 TRAV2A0A0B4J234 112 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF823P16415 610 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 KRTDAPP60985 99 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 SCXQ7RTU7 201 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 VMO1Q7Z5L0 202 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 POM121L12Q8N7R1 296 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 PFN4Q8NHR9 129 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 CST11Q9H112 138 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF581Q9P0T4 197 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 hADV29S1A0JD25 119 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 H3BUX3 64 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 K7ERJ3 54 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 LTAP01374 205 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 PRM2P04554 102 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 PTHLHP12272 177 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 ELK1P19419 428 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 C12orf73Q69YU5 71 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 C10orf99Q6UWK7 81 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 C7orf65Q6ZTY9 151 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 C5orf38Q86SI9 138 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 Q8N2B8 174 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 FAM216BQ8N7L0 139 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 C11orf52Q96A22 123 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF714Q96N38 554 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 OR8B2Q96RD0 313 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 MSRB1Q9NZV6 116 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF492Q9P255 531 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa3.98□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 A0A1B0GW54 56 aa3.98□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 C9JCJ5 164 aa3.98□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 IGHV3-43DP0DP04 118 aa3.98□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 S100A3P33764 101 aa3.98□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa3.98□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 LINC01554Q52M75 96 aa3.98□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 PSMG4Q5JS54 123 aa3.98□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF826PQ6ZT77 177 aa3.98□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 SLC25A29Q8N8R3 303 aa3.98□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 NPCDR1Q9BY65 106 aa3.98□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 MANBALQ9NQG1 85 aa3.98□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 ALMS1Q8TCU4 4167 aa3.98□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 KIAA1109Q2LD37 5005 aa3.98□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 TIMM17BO60830 172 aa3.97□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 PRSS1P07477 247 aa3.97□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 PRSS2P07478 247 aa3.97□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 PCBD1P61457 104 aa3.97□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 UBE2G1P62253 170 aa3.97□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 RPL30P62888 115 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 DEFB121Q5J5C9 76 aa3.97□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 C10orf128Q5T292 105 aa3.97□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 CASC10Q5T4H9 136 aa3.97□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 CFAP126Q5VTH2 177 aa3.97□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 HCP5Q6MZN7 132 aa3.97□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 Q6ZQT7 251 aa3.97□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 DYNAPQ8N1N2 210 aa3.97□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 TOMM5Q8N4H5 51 aa3.97□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 SERP2Q8N6R1 65 aa3.97□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 Q8N7P7 452 aa3.97□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 DIRC1Q969H9 104 aa3.97□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 TRGV9Q99603 122 aa3.97□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 B9D2Q9BPU9 175 aa3.97□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 SCRT1Q9BWW7 348 aa3.97□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 SLC25A2Q9BXI2 301 aa3.97□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 IL36BQ9NZH7 164 aa3.97□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 RYR1P21817 5038 aa3.96□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa3.96□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa3.96□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 LCE6AA0A183 80 aa3.96□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 K7EQD1 137 aa3.96□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 ACYP1P07311 99 aa3.96□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 ASAH2BP0C7U1 165 aa3.96□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 UBE2AP49459 152 aa3.96□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 LINC00205P59089 165 aa3.96□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 C18orf65Q6ZTR6 163 aa3.96□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 NFE4Q86UQ8 179 aa3.96□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 TMEM256Q8N2U0 113 aa3.96□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 CD177Q8N6Q3 437 aa3.96□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 SPTSSAQ969W0 71 aa3.96□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 Q9H3A6 140 aa3.96□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 SCRT2Q9NQ03 307 aa3.96□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa3.96□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms