RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558666.1

TMOD3-204, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 465 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-204ENST00000558666 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 FAT2Q9NYQ8 4349 aa2.88□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa2.87□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa2.87□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 C19orf71A6NCJ1 209 aa2.87□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 C9JQL5 133 aa2.87□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 H3BNG1 76 aa2.87□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 GATCO43716 136 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 S100A9P06702 114 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 PRSS1P07477 247 aa2.87□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 IGLC6P0CF74 106 aa2.87□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 LINC00694P0DN24 101 aa2.87□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 WFDC2Q14508 124 aa2.87□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 LINC00336Q6ZUF6 198 aa2.87□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 SMIM29Q86T20 159 aa2.87□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 C15orf54Q8N8G6 183 aa2.87□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 Q8N976 141 aa2.87□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 CHCHD5Q9BSY4 110 aa2.87□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 GTSF1LQ9H1H1 148 aa2.87□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 KLK12Q9UKR0 248 aa2.87□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa2.87□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 DNAH17Q9UFH2 4485 aa2.87□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa2.86□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa2.86□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 A0A087WX48 190 aa2.86□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 TMEM262E9PQX1 116 aa2.86□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 SMKR1H3BMG3 65 aa2.86□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 SNAI2O43623 268 aa2.86□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 CDK2AP2O75956 126 aa2.86□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 GAS8-AS1O95177 125 aa2.86□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 SRP19P09132 144 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 CTRLP40313 264 aa2.86□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 UBE2D3P61077 147 aa2.86□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 UBE2D2P62837 147 aa2.86□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 SLAQ13239 276 aa2.86□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 MPV17L2Q567V2 206 aa2.86□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 LELP1Q5T871 98 aa2.86□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 UFSP1Q6NVU6 142 aa2.86□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 ZFP2Q6ZN57 461 aa2.86□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 GTSF1Q8WW33 167 aa2.86□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 UBE2WQ96B02 151 aa2.86□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 FAM210AQ96ND0 272 aa2.86□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 SCRT2Q9NQ03 307 aa2.86□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 KIAA1109Q2LD37 5005 aa2.86□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa2.85□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa2.85□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 XKRY2A2RUG3 117 aa2.85□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 CRPP02741 224 aa2.85□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 ANGP03950 147 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 OR5AL1P0C617 328 aa2.85□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 TRGC1P0CF51 173 aa2.85□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 NTF3P20783 257 aa2.85□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 RPS20P60866 119 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 DNLZQ5SXM8 178 aa2.85□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 KCNIP4Q6PIL6 250 aa2.85□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 TEX261Q6UWH6 196 aa2.85□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 COX8CQ7Z4L0 72 aa2.85□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 LINC01551Q86U37 167 aa2.85□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa2.85□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 BAALCQ8WXS3 180 aa2.85□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 BORCS7Q96B45 105 aa2.85□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 DPH3P1Q9H4G8 78 aa2.85□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa2.84□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 A0A087WTM6 91 aa2.84□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 HIGD1CA8MV81 97 aa2.84□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 TMEM250H0YL14 139 aa2.84□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 CXCL1P09341 107 aa2.84□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 RPS10P46783 165 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 RAB4BP61018 213 aa2.84□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 RPL23P62829 140 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 CACNG7P62955 275 aa2.84□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 LINC01556Q5JQF7 62 aa2.84□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 RASL11AQ6T310 242 aa2.84□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa2.84□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 NIT1Q86X76 327 aa2.84□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 AMN1Q8IY45 258 aa2.84□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 STPG4Q8N801 248 aa2.84□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 ISOC2Q96AB3 205 aa2.84□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 TMEM242Q9NWH2 141 aa2.84□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa2.84□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa2.83□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa2.83□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 SMIM1B2RUZ4 78 aa2.83□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 M0QY20 66 aa2.83□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 UBE2L6O14933 153 aa2.83□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 TSHBP01222 138 aa2.83□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 KRTAP10-1P60331 282 aa2.83□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 KIAA1644Q3SXP7 199 aa2.83□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.83□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 ATRAIDQ6UW56 229 aa2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms