RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556869.1

LINC00871-203, long intergenic non-protein coding RNA 871, humanhuman

TSL 2

Gene LINC00871, Length 456 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00871-203ENST00000556869 Q5VSD8 79 aa-0.27□□□□□ -2.45
LINC00871-203ENST00000556869 MAFIPQ8WZ33 124 aa-0.27□□□□□ -2.45
LINC00871-203ENST00000556869 TCEAL4Q96EI5 215 aa-0.27□□□□□ -2.45
LINC00871-203ENST00000556869 CEP152O94986 1710 aa-0.27□□□□□ -2.45
LINC00871-203ENST00000556869 PRDM2Q13029 1718 aa-0.27□□□□□ -2.45
LINC00871-203ENST00000556869 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
LINC00871-203ENST00000556869 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa-0.28□□□□□ -2.45
LINC00871-203ENST00000556869 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa-0.28□□□□□ -2.45
LINC00871-203ENST00000556869 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa-0.28□□□□□ -2.45
LINC00871-203ENST00000556869 BCE1O60756 84 aa-0.28□□□□□ -2.45
LINC00871-203ENST00000556869 SPRR1AP35321 89 aa-0.28□□□□□ -2.45
LINC00871-203ENST00000556869 SMCO1Q147U7 214 aa-0.28□□□□□ -2.45
LINC00871-203ENST00000556869 SMIM21Q3B7S5 101 aa-0.28□□□□□ -2.45
LINC00871-203ENST00000556869 SMIM4Q8WVI0 70 aa-0.28□□□□□ -2.45
LINC00871-203ENST00000556869 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
LINC00871-203ENST00000556869 AQP10Q96PS8 301 aa-0.28□□□□□ -2.45
LINC00871-203ENST00000556869 TMEM191AQ9H0A3 160 aa-0.28□□□□□ -2.45
LINC00871-203ENST00000556869 KDM3BQ7LBC6 1761 aa-0.28□□□□□ -2.45
LINC00871-203ENST00000556869 ERCC6L2Q5T890 1561 aa-0.28□□□□□ -2.45
LINC00871-203ENST00000556869 PXDNQ92626 1479 aa-0.29□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 IFT140Q96RY7 1462 aa-0.29□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 PLXNB2O15031 1838 aa-0.29□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa-0.29□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa-0.29□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 M0R135 149 aa-0.29□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 SIX6O95475 246 aa-0.29□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 SPRR2DP22532 72 aa-0.29□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 ALX1Q15699 326 aa-0.29□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 C10orf128Q5T292 105 aa-0.29□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 LRP6O75581 1613 aa-0.29□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 MRC1P22897 1456 aa-0.29□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 MYOM3Q5VTT5 1437 aa-0.3□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 HCG22E2RYF7 251 aa-0.3□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 DCDP81605 110 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 RBM3P98179 157 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 SDF2Q99470 211 aa-0.3□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 PDCD10Q9BUL8 212 aa-0.3□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa-0.3□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa-0.3□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 CCDC167Q9P0B6 97 aa-0.3□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 V9GYH0 126 aa-0.3□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 HSPG2P98160 4391 aa-0.31□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 USF3Q68DE3 2245 aa-0.31□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 PRM1P04553 51 aa-0.31□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 SPAG11AQ6PDA7 123 aa-0.31□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 TTC9CQ8N5M4 171 aa-0.31□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 DPH3Q96FX2 82 aa-0.31□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 PFDN5Q99471 154 aa-0.31□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 LENEPQ9Y5L5 61 aa-0.31□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 LRRC37A2A6NM11 1700 aa-0.31□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 C10orf71Q711Q0 1435 aa-0.31□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 MYCBP2O75592 4640 aa-0.31□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 ARAP2Q8WZ64 1704 aa-0.32□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 UNC13AQ9UPW8 1703 aa-0.32□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 PI4KAP42356 2102 aa-0.32□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 ZNF292O60281 2723 aa-0.32□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa-0.32□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 COX17Q14061 63 aa-0.32□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 TMEM170BQ5T4T1 132 aa-0.32□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 COPS9Q8WXC6 57 aa-0.32□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 ZNF236Q9UL36 1845 aa-0.32□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 LAMC1P11047 1609 aa-0.32□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 DOCK1Q14185 1865 aa-0.33□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 STAB1Q9NY15 2570 aa-0.33□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 DOCK2Q92608 1830 aa-0.33□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 GRIN2AQ12879 1464 aa-0.33□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 BCL9LQ86UU0 1499 aa-0.33□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 ARPC4P59998 168 aa-0.33□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 PIGYQ3MUY2 71 aa-0.33□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa-0.33□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 LPAP08519 4548 aa-0.33□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 CHD9Q3L8U1 2897 aa-0.33□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 PATJQ8NI35 1801 aa-0.34□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 LRP2P98164 4655 aa-0.34□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa-0.34□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 C12orf73Q69YU5 71 aa-0.34□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 Q6JHZ5 121 aa-0.34□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 CSPG4Q6UVK1 2322 aa-0.34□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 BAGE2Q86Y30 109 aa-0.34□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 MYO7BQ6PIF6 2116 aa-0.34□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 TENM4Q6N022 2769 aa-0.34□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 CFTRP13569 1480 aa-0.35□□□□□ -2.46
LINC00871-203ENST00000556869 SBF2Q86WG5 1849 aa-0.35□□□□□ -2.47
LINC00871-203ENST00000556869 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa-0.35□□□□□ -2.47
LINC00871-203ENST00000556869 FAM25AB3EWG3 89 aa-0.35□□□□□ -2.47
LINC00871-203ENST00000556869 FAM25CB3EWG5 89 aa-0.35□□□□□ -2.47
LINC00871-203ENST00000556869 FAM25GB3EWG6 89 aa-0.35□□□□□ -2.47
LINC00871-203ENST00000556869 I3L2K1 104 aa-0.35□□□□□ -2.47
LINC00871-203ENST00000556869 K7EQZ3 153 aa-0.35□□□□□ -2.47
LINC00871-203ENST00000556869 TNFP01375 233 aa-0.35□□□□□ -2.47
LINC00871-203ENST00000556869 APOC3P02656 99 aa-0.35□□□□□ -2.47
LINC00871-203ENST00000556869 Q8N8P6 123 aa-0.35□□□□□ -2.47
LINC00871-203ENST00000556869 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
LINC00871-203ENST00000556869 AMELXQ99217 191 aa-0.35□□□□□ -2.47
LINC00871-203ENST00000556869 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa-0.35□□□□□ -2.47
LINC00871-203ENST00000556869 CSMD3Q7Z407 3707 aa-0.35□□□□□ -2.47
LINC00871-203ENST00000556869 PAPPAQ13219 1627 aa-0.35□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms