RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551984.5

FGD4-215, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4, human

TSL 5

Gene FGD4, Length 2,435 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FGD4-215	ENST00000551984	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	TEX22	C9J3V5	150 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	SYNJ2BP	P57105	145 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	CD7	P09564	240 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	APELA	P0DMC3	54 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	WT1-AS	Q06250	92 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	ODF3	Q96PU9	254 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	LINC01587	Q99440	93 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984		U3KQE9	123 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	MUC7	Q8TAX7	377 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	RNF185	Q96GF1	192 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	C8orf49	Q96NF6	230 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	CGB1	A6NKQ9	187 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	SLC25A20	O43772	301 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	PLN	P26678	52 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	PEMT	Q9UBM1	199 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	TNFRSF6B	O95407	300 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	LINC00694	P0DN24	101 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	CASC10	Q5T4H9	136 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	LGALS9	O00182	355 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	C15orf32	Q32M92	178 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	GPHB5	Q86YW7	130 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984		C9JAW5	83 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	SH2D1A	O60880	128 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	4.78	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	CCDC140	Q96MF4	163 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	C17orf77	Q96MU5	243 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984		F8VRH5	84 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.78	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984		Q8N8P6	123 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FGD4-215	ENST00000551984	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF815P	A8K554	130 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FGD4-215	ENST00000551984		M0R3E3	92 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FGD4-215	ENST00000551984	IGLC6	P0CF74	106 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FGD4-215	ENST00000551984	EDN2	P20800	178 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FGD4-215	ENST00000551984	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FGD4-215	ENST00000551984	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
FGD4-215	ENST00000551984	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FGD4-215	ENST00000551984	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FGD4-215	ENST00000551984	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FGD4-215	ENST00000551984	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FGD4-215	ENST00000551984	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FGD4-215	ENST00000551984	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FGD4-215	ENST00000551984		H7C1H1	209 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FGD4-215	ENST00000551984	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
FGD4-215	ENST00000551984	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FGD4-215	ENST00000551984	CFC1	P0CG37	223 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FGD4-215	ENST00000551984	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
FGD4-215	ENST00000551984	LYZ	P61626	148 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FGD4-215	ENST00000551984	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF575	Q86XF7	245 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FGD4-215	ENST00000551984	BAALC	Q8WXS3	180 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FGD4-215	ENST00000551984	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FGD4-215	ENST00000551984	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FGD4-215	ENST00000551984	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FGD4-215	ENST00000551984	IGHV3-23	P01764	117 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FGD4-215	ENST00000551984	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FGD4-215	ENST00000551984	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FGD4-215	ENST00000551984	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FGD4-215	ENST00000551984	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
FGD4-215	ENST00000551984	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
FGD4-215	ENST00000551984	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
FGD4-215	ENST00000551984	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
FGD4-215	ENST00000551984	LAGE3	Q14657	143 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FGD4-215	ENST00000551984	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65

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