RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP4.79□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 WNK2Q9Y3S1 2297 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 NDPQ00604 133 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 DOCK7Q96N67 2140 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 ZGRF1Q86YA3 2104 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 PRO0461Q9UI25 63 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 FER1L5A0AVI2 2057 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 DENND4CQ5VZ89 1909 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 NDUFA12Q9UI09 145 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 LINC01548A6NM66 108 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 H3BRN7 92 aa4.78□□□□□ -1.64
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PTPRB-210ENST00000551525 COL4A3Q01955 1670 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 CDK2AP2O75956 126 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 C11orf53Q8IXP5 236 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa4.78□□□□□ -1.64
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PTPRB-210ENST00000551525 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa4.77□□□□□ -1.65
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PTPRB-210ENST00000551525 IGKV1-16P04430 117 aa4.77□□□□□ -1.65
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PTPRB-210ENST00000551525 C1orf158Q8N1D5 194 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF491Q8N8L2 437 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 Q8N9W7 124 aa4.77□□□□□ -1.65
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PTPRB-210ENST00000551525 IGKV1-5P01602 117 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 LRRK2Q5S007 2527 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM61Q8N0U2 210 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 C1orf159Q96HA4 380 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 LST1O00453 97 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 C11orf45Q8TAV5 145 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 C14orf132Q9NPU4 83 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 CADP27708 2225 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 OBSL1O75147 1896 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 H7C423 109 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 IGLV1-47P01700 117 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 LINC00158P58513 81 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 Q6ZRM9 215 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 MED13LQ71F56 2210 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 F8W735 103 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 SLURP1P55000 103 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 C6orf99Q4VX62 202 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRB-210ENST00000551525 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 TRAV10A0A0B4J240 114 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 SPINK13Q1W4C9 94 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 ODF3L1Q8IXM7 274 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 C16orf95Q9H693 158 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 GTF3C1Q12789 2109 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 A0A087WW49 117 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1B0GXF2 115 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 SUMO4Q6EEV6 95 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 Q6ZSV7 163 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 Q8N7P7 452 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 SMIM2Q9BVW6 85 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 LINC00574Q9H8X3 128 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 C11orf86A6NJI1 115 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV3-53P01767 116 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC168Q8NDH2 2452 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 EBI3Q14213 229 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 C8orf87E5RJ46 101 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 PRR20EP86478 221 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 PRR20CP86479 221 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 PRR20DP86480 221 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 PRR20BP86481 221 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 PRR20AP86496 221 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 MUC7Q8TAX7 377 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 RETNLBQ9BQ08 111 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 SDHAF1A6NFY7 115 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 CDSNQ15517 529 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 Q5XG85 94 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 CELA1Q9UNI1 258 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 DCANP1Q8TF63 244 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF580Q9UK33 172 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 FAM229AH3BQW9 127 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 I3L3M4 83 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF524Q96C55 264 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 NREPQ16612 68 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 C11orf1Q9H5F2 150 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 UBE2D1P51668 147 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
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