RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 A0A1B0GUV1 79 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-227ENST00000551441 UBE2L6O14933 153 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-227ENST00000551441 AMTP48728 403 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-227ENST00000551441 LINC00526Q96FQ7 95 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-227ENST00000551441 TCEAL7Q9BRU2 100 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-227ENST00000551441 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-227ENST00000551441 CYTL1Q9NRR1 136 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-227ENST00000551441 H7C1H1 209 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-227ENST00000551441 GIPP09681 153 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
CS-227ENST00000551441 CFAP161Q6P656 301 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-227ENST00000551441 RASL11AQ6T310 242 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-227ENST00000551441 REG3GQ6UW15 175 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-227ENST00000551441 SPINK6Q6UWN8 80 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-227ENST00000551441 SFT2D1Q8WV19 159 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-227ENST00000551441 S100A9P06702 114 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CS-227ENST00000551441 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa10□□□□□ -0.81
CS-227ENST00000551441 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CS-227ENST00000551441 PFDN1O60925 122 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-227ENST00000551441 COTL1Q14019 142 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-227ENST00000551441 TMUB2Q71RG4 321 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-227ENST00000551441 FAM213BQ8TBF2 198 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-227ENST00000551441 ARPC5O15511 151 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-227ENST00000551441 IGLC6P0CF74 106 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-227ENST00000551441 OR2D3Q8NGH3 330 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-227ENST00000551441 NIT2Q9NQR4 276 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-227ENST00000551441 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
CS-227ENST00000551441 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
CS-227ENST00000551441 RPL35P42766 123 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
CS-227ENST00000551441 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP9.97□□□□□ -0.81
CS-227ENST00000551441 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
CS-227ENST00000551441 PGLYRP4Q96LB8 373 aa9.97□□□□□ -0.81
CS-227ENST00000551441 G3V3Q6 166 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-227ENST00000551441 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-227ENST00000551441 KCNRGQ8N5I3 272 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-227ENST00000551441 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CS-227ENST00000551441 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-227ENST00000551441 SMLR1H3BR10 107 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-227ENST00000551441 CACNG7P62955 275 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-227ENST00000551441 FOXI1Q12951 378 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-227ENST00000551441 C4orf48Q5BLP8 95 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-227ENST00000551441 LYZL1Q6UWQ5 148 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-227ENST00000551441 Q6ZNX1 250 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-227ENST00000551441 RAB19A4D1S5 217 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-227ENST00000551441 NTF3P20783 257 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-227ENST00000551441 XCL1P47992 114 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-227ENST00000551441 CENPWQ5EE01 88 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-227ENST00000551441 Q6ZRP5 223 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-227ENST00000551441 MBD3L1Q8WWY6 194 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-227ENST00000551441 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
CS-227ENST00000551441 TRGC1P0CF51 173 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-227ENST00000551441 RPS20P60866 119 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CS-227ENST00000551441 CCL20P78556 96 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-227ENST00000551441 GATD1Q8NB37 220 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-227ENST00000551441 CARD19Q96LW7 228 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-227ENST00000551441 C19orf71A6NCJ1 209 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-227ENST00000551441 GAGE2BQ13066 116 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-227ENST00000551441 CCL25O15444 150 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-227ENST00000551441 IFNA1P01562 189 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-227ENST00000551441 H2AFB1P0C5Y9 115 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-227ENST00000551441 FGF6P10767 208 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-227ENST00000551441 GNG13Q9P2W3 67 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-227ENST00000551441 A0A1W2PNN7 141 aa9.89□□□□□ -0.83
CS-227ENST00000551441 APCSP02743 223 aa9.89□□□□□ -0.83
CS-227ENST00000551441 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
CS-227ENST00000551441 TWIST1Q15672 202 aa9.89□□□□□ -0.83
CS-227ENST00000551441 LINC00474Q9P2X8 69 aa9.89□□□□□ -0.83
CS-227ENST00000551441 F2Z2F3 143 aa9.88□□□□□ -0.83
CS-227ENST00000551441 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa9.87□□□□□ -0.83
CS-227ENST00000551441 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa9.87□□□□□ -0.83
CS-227ENST00000551441 SYCNQ0VAF6 134 aa9.87□□□□□ -0.83
CS-227ENST00000551441 OR5A1Q8NGJ0 315 aa9.87□□□□□ -0.83
CS-227ENST00000551441 XKRY2A2RUG3 117 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-227ENST00000551441 FAM231BA6NCW3 169 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-227ENST00000551441 BCL2P10415 239 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-227ENST00000551441 GNG4P50150 75 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-227ENST00000551441 PTTG1IPP53801 180 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-227ENST00000551441 C11orf52Q96A22 123 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-227ENST00000551441 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-227ENST00000551441 UMAD1C9J7I0 102 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-227ENST00000551441 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-227ENST00000551441 MT-ND6P03923 174 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-227ENST00000551441 PRR26Q8N8Z3 221 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-227ENST00000551441 MUC2Q02817 5179 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-227ENST00000551441 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-227ENST00000551441 SDHAF1A6NFY7 115 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-227ENST00000551441 C1orf137Q5JT78 98 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-227ENST00000551441 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CS-227ENST00000551441 C9orf62Q8N4C0 152 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-227ENST00000551441 NUDT10Q8NFP7 164 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-227ENST00000551441 NUDT11Q96G61 164 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-227ENST00000551441 BTF3L4Q96K17 158 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-227ENST00000551441 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-227ENST00000551441 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CS-227ENST00000551441 NCR2O95944 276 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-227ENST00000551441 PMCHP20382 165 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-227ENST00000551441 CTRLP40313 264 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-227ENST00000551441 TMEM101Q96IK0 257 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-227ENST00000551441 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-227ENST00000551441 MANBALQ9NQG1 85 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-227ENST00000551441 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa9.82□□□□□ -0.84
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