RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550661.1

PTPRR-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, human

TSL 3

Gene PTPRR, Length 1,024 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRR-210	ENST00000550661	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRR-210	ENST00000550661	GAGE12J	A6NER3	117 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRR-210	ENST00000550661	CCL18	P55774	89 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRR-210	ENST00000550661	UBE2D3	P61077	147 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRR-210	ENST00000550661	UBE2D2	P62837	147 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRR-210	ENST00000550661	GAGE1	Q13065	139 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRR-210	ENST00000550661	GAGE4	Q13068	117 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRR-210	ENST00000550661	GAGE5	Q13069	117 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRR-210	ENST00000550661	ELOB	Q15370	118 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRR-210	ENST00000550661	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRR-210	ENST00000550661	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRR-210	ENST00000550661	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRR-210	ENST00000550661	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRR-210	ENST00000550661	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRR-210	ENST00000550661	YPEL4	Q96NS1	127 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRR-210	ENST00000550661	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRR-210	ENST00000550661	NIT2	Q9NQR4	276 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRR-210	ENST00000550661	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRR-210	ENST00000550661	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRR-210	ENST00000550661	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRR-210	ENST00000550661	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRR-210	ENST00000550661		D6R8Y8	96 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRR-210	ENST00000550661	PHOX2A	O14813	284 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRR-210	ENST00000550661	NCR2	O95944	276 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRR-210	ENST00000550661	NPS	P0C0P6	89 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRR-210	ENST00000550661	CKS2	P33552	79 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRR-210	ENST00000550661	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PTPRR-210	ENST00000550661	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRR-210	ENST00000550661	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRR-210	ENST00000550661	ORMDL3	Q8N138	153 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRR-210	ENST00000550661	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRR-210	ENST00000550661	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRR-210	ENST00000550661	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PTPRR-210	ENST00000550661	UPK3B	Q9BT76	320 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRR-210	ENST00000550661	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRR-210	ENST00000550661	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PTPRR-210	ENST00000550661	NACA	E9PAV3	2078 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	SMKR1	H3BMG3	65 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	APCS	P02743	223 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	LELP1	Q5T871	98 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	NRAC	Q8N912	160 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	C20orf78	Q9BR46	151 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	ST20	Q9HBF5	79 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661		Q9UF83	564 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	RYR3	Q15413	4870 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	LCE6A	A0A183	80 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	TCAP	O15273	167 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	TNFRSF6B	O95407	300 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	PKIA	P61925	76 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	COTL1	Q14019	142 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	ESRG	Q1W209	222 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	PRELID3A	Q96N28	172 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	KIR2DL4	Q99706	377 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661		I3L3M4	83 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661		K7EP13	123 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	VCY	O14598	125 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	SCO1	O75880	301 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	GAS8-AS1	O95177	125 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	LY6G6C	O95867	125 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	NPY	P01303	97 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	TTC32	Q5I0X7	151 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	KMT2A	Q03164	3969 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	PRSS47	A8MTI9	375 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661		K7EMI3	77 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	SIVA1	O15304	175 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	TSHB	P01222	138 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	RAB5A	P20339	215 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	PMCH	P20382	165 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	FCER1G	P30273	86 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	AMT	P48728	403 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PTPRR-210	ENST00000550661	DNAH2	Q9P225	4427 aa		4.04	□□□□□ -1.76

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