RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 C1orf43Q9BWL3 253 aa11.66□□□□□ -0.54
CS-219ENST00000550655 SMDT1Q9H4I9 107 aa11.66□□□□□ -0.54
CS-219ENST00000550655 NAT8Q9UHE5 227 aa11.66□□□□□ -0.54
CS-219ENST00000550655 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CS-219ENST00000550655 COTL1Q14019 142 aa11.65□□□□□ -0.54
CS-219ENST00000550655 ADIRFQ15847 76 aa11.65□□□□□ -0.54
CS-219ENST00000550655 MIAQ16674 131 aa11.65□□□□□ -0.54
CS-219ENST00000550655 CLPSL2Q6UWE3 100 aa11.65□□□□□ -0.54
CS-219ENST00000550655 LINC00269Q8N2A0 174 aa11.65□□□□□ -0.54
CS-219ENST00000550655 C20orf203Q8NBC4 194 aa11.65□□□□□ -0.54
CS-219ENST00000550655 BORCS7Q96B45 105 aa11.65□□□□□ -0.54
CS-219ENST00000550655 TMEM70Q9BUB7 260 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-219ENST00000550655 TMEM191AQ9H0A3 160 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-219ENST00000550655 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-219ENST00000550655 GAS8-AS1O95177 125 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-219ENST00000550655 AMTP48728 403 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-219ENST00000550655 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-219ENST00000550655 NUP35Q8NFH5 326 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-219ENST00000550655 RNF185Q96GF1 192 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-219ENST00000550655 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa11.62□□□□□ -0.55
CS-219ENST00000550655 A0A1B0GUV1 79 aa11.62□□□□□ -0.55
CS-219ENST00000550655 SDHAF1A6NFY7 115 aa11.62□□□□□ -0.55
CS-219ENST00000550655 FAM30AQ9NZY2 134 aa11.62□□□□□ -0.55
CS-219ENST00000550655 DNAH8Q96JB1 4490 aa11.61□□□□□ -0.55
CS-219ENST00000550655 HAMPP81172 84 aa11.61□□□□□ -0.55
CS-219ENST00000550655 REG3AQ06141 175 aa11.61□□□□□ -0.55
CS-219ENST00000550655 NCR2O95944 276 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-219ENST00000550655 HLA-DQA1P01909 254 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-219ENST00000550655 AMN1Q8IY45 258 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-219ENST00000550655 NAT8BQ9UHF3 227 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-219ENST00000550655 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-219ENST00000550655 UBE2L6O14933 153 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-219ENST00000550655 RAB4AP20338 218 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-219ENST00000550655 RPS10P46783 165 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CS-219ENST00000550655 RIGQ13278 110 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-219ENST00000550655 Q6ZSA8 131 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-219ENST00000550655 USP17L23D6RBM5 183 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-219ENST00000550655 LINC01620Q4KN68 170 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-219ENST00000550655 MRAP2Q96G30 205 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-219ENST00000550655 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-219ENST00000550655 APCSP02743 223 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-219ENST00000550655 C14orf177Q52M58 125 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-219ENST00000550655 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
CS-219ENST00000550655 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
CS-219ENST00000550655 EPM2AB3EWF7 344 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-219ENST00000550655 I3L3M4 83 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-219ENST00000550655 TSHBP01222 138 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-219ENST00000550655 ST20Q9HBF5 79 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-219ENST00000550655 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-219ENST00000550655 SMKR1H3BMG3 65 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-219ENST00000550655 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
CS-219ENST00000550655 FAT1Q14517 4588 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-219ENST00000550655 H7C423 109 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-219ENST00000550655 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
CS-219ENST00000550655 PRSS1P07477 247 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-219ENST00000550655 ESDP10768 282 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-219ENST00000550655 PMCHP20382 165 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-219ENST00000550655 Q5VSD8 79 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-219ENST00000550655 NRACQ8N912 160 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-219ENST00000550655 TMEM242Q9NWH2 141 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-219ENST00000550655 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-219ENST00000550655 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-219ENST00000550655 FGF6P10767 208 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-219ENST00000550655 FAM104BQ5XKR9 115 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-219ENST00000550655 CAMPP49913 170 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-219ENST00000550655 RAB14P61106 215 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-219ENST00000550655 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
CS-219ENST00000550655 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-219ENST00000550655 A0A1B0GW15 77 aa11.51□□□□□ -0.57
CS-219ENST00000550655 A0A1B0GXF2 115 aa11.51□□□□□ -0.57
CS-219ENST00000550655 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
CS-219ENST00000550655 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
CS-219ENST00000550655 CLLU1Q5K131 121 aa11.5□□□□□ -0.57
CS-219ENST00000550655 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
CS-219ENST00000550655 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
CS-219ENST00000550655 HBBP68871 147 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-219ENST00000550655 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-219ENST00000550655 PPP1R17O96001 155 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-219ENST00000550655 IFITM2Q01629 132 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-219ENST00000550655 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-219ENST00000550655 SCXQ7RTU7 201 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-219ENST00000550655 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
CS-219ENST00000550655 C7orf77A4D0Y5 90 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-219ENST00000550655 GAGE12HA6NDE8 117 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-219ENST00000550655 VCYO14598 125 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-219ENST00000550655 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
CS-219ENST00000550655 CLRN3Q8NCR9 226 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-219ENST00000550655 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
CS-219ENST00000550655 LINC00862A6NCI5 91 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-219ENST00000550655 PPP1R2P9O14990 202 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-219ENST00000550655 C15orf56Q8N910 161 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-219ENST00000550655 C9orf163Q8N9P6 203 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-219ENST00000550655 OR5A1Q8NGJ0 315 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-219ENST00000550655 CHAC1Q9BUX1 264 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-219ENST00000550655 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa11.45□□□□□ -0.58
CS-219ENST00000550655 hDV102S1A0JD36 115 aa11.45□□□□□ -0.58
CS-219ENST00000550655 FAM229AH3BQW9 127 aa11.45□□□□□ -0.58
CS-219ENST00000550655 S100A8P05109 93 aa11.45□□□□□ -0.58
CS-219ENST00000550655 CNBPP62633 177 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
CS-219ENST00000550655 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
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