RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 MAJINQ3KP22 176 aa10.72□□□□□ -0.69
CS-214ENST00000548849 C15orf56Q8N910 161 aa10.72□□□□□ -0.69
CS-214ENST00000548849 PGLYRP4Q96LB8 373 aa10.72□□□□□ -0.69
CS-214ENST00000548849 RPS10P46783 165 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
CS-214ENST00000548849 COTL1Q14019 142 aa10.71□□□□□ -0.69
CS-214ENST00000548849 HIGD2BQ4VC39 106 aa10.71□□□□□ -0.69
CS-214ENST00000548849 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa10.7□□□□□ -0.7
CS-214ENST00000548849 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
CS-214ENST00000548849 TRGC1P0CF51 173 aa10.7□□□□□ -0.7
CS-214ENST00000548849 CENPWQ5EE01 88 aa10.7□□□□□ -0.7
CS-214ENST00000548849 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa10.7□□□□□ -0.7
CS-214ENST00000548849 XKRY2A2RUG3 117 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-214ENST00000548849 F2Z2F3 143 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-214ENST00000548849 LYZL1Q6UWQ5 148 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-214ENST00000548849 LINC01600Q96MT4 127 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-214ENST00000548849 GNG13Q9P2W3 67 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-214ENST00000548849 C19orf71A6NCJ1 209 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-214ENST00000548849 NTF3P20783 257 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-214ENST00000548849 ZNF345Q14585 488 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-214ENST00000548849 STPG4Q8N801 248 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-214ENST00000548849 LYPD6BQ8NI32 183 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-214ENST00000548849 C11orf52Q96A22 123 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-214ENST00000548849 MANBALQ9NQG1 85 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-214ENST00000548849 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-214ENST00000548849 RAB19A4D1S5 217 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-214ENST00000548849 CCL20P78556 96 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-214ENST00000548849 BATF3Q9NR55 127 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-214ENST00000548849 IFNA1P01562 189 aa10.66□□□□□ -0.7
CS-214ENST00000548849 GNG4P50150 75 aa10.66□□□□□ -0.7
CS-214ENST00000548849 PRR3P79522 188 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
CS-214ENST00000548849 ODF1Q14990 250 aa10.66□□□□□ -0.7
CS-214ENST00000548849 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa10.66□□□□□ -0.7
CS-214ENST00000548849 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
CS-214ENST00000548849 BCL2L11O43521 198 aa10.65□□□□□ -0.7
CS-214ENST00000548849 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CS-214ENST00000548849 TWIST1Q15672 202 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-214ENST00000548849 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CS-214ENST00000548849 SMIM12Q96EX1 92 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-214ENST00000548849 A0A096LNI7 61 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-214ENST00000548849 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-214ENST00000548849 HMSDA8MTL9 139 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-214ENST00000548849 C9orf62Q8N4C0 152 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-214ENST00000548849 GATD1Q8NB37 220 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-214ENST00000548849 BIN3Q9NQY0 253 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-214ENST00000548849 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
CS-214ENST00000548849 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
CS-214ENST00000548849 A0A0J9YXV3 536 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-214ENST00000548849 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
CS-214ENST00000548849 RGS21Q2M5E4 152 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-214ENST00000548849 Q6ZNX1 250 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-214ENST00000548849 MED9Q9NWA0 146 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-214ENST00000548849 SPINK6Q6UWN8 80 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-214ENST00000548849 NUDT10Q8NFP7 164 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-214ENST00000548849 NUDT11Q96G61 164 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-214ENST00000548849 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-214ENST00000548849 TEX46H3BTG2 121 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-214ENST00000548849 NCR2O95944 276 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-214ENST00000548849 APCSP02743 223 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-214ENST00000548849 FGF6P10767 208 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-214ENST00000548849 CTRLP40313 264 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-214ENST00000548849 FOXI1Q12951 378 aa10.6□□□□□ -0.71
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CS-214ENST00000548849 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CS-214ENST00000548849 LINC00474Q9P2X8 69 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-214ENST00000548849 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-214ENST00000548849 H7C423 109 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-214ENST00000548849 PDE6DO43924 150 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-214ENST00000548849 KRTAP10-8P60410 259 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-214ENST00000548849 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CS-214ENST00000548849 XCL1P47992 114 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-214ENST00000548849 OR5A1Q8NGJ0 315 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-214ENST00000548849 LINC00526Q96FQ7 95 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-214ENST00000548849 SMIM15Q7Z3B0 74 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-214ENST00000548849 BTF3L4Q96K17 158 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-214ENST00000548849 CNFNQ9BYD5 112 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-214ENST00000548849 PKIGQ9Y2B9 76 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-214ENST00000548849 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-214ENST00000548849 SDHAF1A6NFY7 115 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-214ENST00000548849 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
CS-214ENST00000548849 Q6ZRP5 223 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-214ENST00000548849 TMEM101Q96IK0 257 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-214ENST00000548849 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
CS-214ENST00000548849 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
CS-214ENST00000548849 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-214ENST00000548849 CCL25O15444 150 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-214ENST00000548849 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
CS-214ENST00000548849 PMCHP20382 165 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-214ENST00000548849 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP10.55□□□□□ -0.72
CS-214ENST00000548849 TEX261Q6UWH6 196 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-214ENST00000548849 CARD19Q96LW7 228 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-214ENST00000548849 I3L3M4 83 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-214ENST00000548849 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
CS-214ENST00000548849 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-214ENST00000548849 BCL2P10415 239 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-214ENST00000548849 FAM231BA6NCW3 169 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-214ENST00000548849 K7EN84 100 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-214ENST00000548849 SYCNQ0VAF6 134 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-214ENST00000548849 SS18Q15532 418 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-214ENST00000548849 OCC1Q8TAD7 63 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-214ENST00000548849 GAGE2BQ13066 116 aa10.51□□□□□ -0.73
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