RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528484.5

CMTM1-211, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CMTM1, Length 726 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-211ENST00000528484 RPS20P60866 119 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CMTM1-211ENST00000528484 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.25□□□□□ -1.25
CMTM1-211ENST00000528484 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa7.25□□□□□ -1.25
CMTM1-211ENST00000528484 C15orf56Q8N910 161 aa7.25□□□□□ -1.25
CMTM1-211ENST00000528484 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa7.25□□□□□ -1.25
CMTM1-211ENST00000528484 MLST8Q9BVC4 326 aa7.25□□□□□ -1.25
CMTM1-211ENST00000528484 SCO2A0A1W2PP80 73 aa7.24□□□□□ -1.25
CMTM1-211ENST00000528484 ODF1Q14990 250 aa7.24□□□□□ -1.25
CMTM1-211ENST00000528484 Q6ZRP5 223 aa7.24□□□□□ -1.25
CMTM1-211ENST00000528484 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa7.24□□□□□ -1.25
CMTM1-211ENST00000528484 NIT2Q9NQR4 276 aa7.24□□□□□ -1.25
CMTM1-211ENST00000528484 GAS8-AS1O95177 125 aa7.23□□□□□ -1.25
CMTM1-211ENST00000528484 SFT2D1Q8WV19 159 aa7.23□□□□□ -1.25
CMTM1-211ENST00000528484 GFRA4Q9GZZ7 299 aa7.23□□□□□ -1.25
CMTM1-211ENST00000528484 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CMTM1-211ENST00000528484 F2Z2F3 143 aa7.22□□□□□ -1.25
CMTM1-211ENST00000528484 Q5BKY6 102 aa7.22□□□□□ -1.25
CMTM1-211ENST00000528484 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CMTM1-211ENST00000528484 TMUB2Q71RG4 321 aa7.22□□□□□ -1.25
CMTM1-211ENST00000528484 OR2D3Q8NGH3 330 aa7.22□□□□□ -1.25
CMTM1-211ENST00000528484 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CMTM1-211ENST00000528484 A0A096LNI7 61 aa7.21□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 A0A1B0GV50 99 aa7.21□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 FAM231BA6NCW3 169 aa7.21□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 UMAD1C9J7I0 102 aa7.21□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 RPL35P42766 123 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 KRTAP10-8P60410 259 aa7.21□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 KCNRGQ8N5I3 272 aa7.21□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 FAM213BQ8TBF2 198 aa7.21□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 LPAP08519 4548 aa7.2□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 IGLC6P0CF74 106 aa7.2□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 CARD19Q96LW7 228 aa7.2□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.19□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 H7C423 109 aa7.19□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.19□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 ARPC5O15511 151 aa7.19□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 IFNA1P01562 189 aa7.19□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 APCSP02743 223 aa7.19□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 SMIM15Q7Z3B0 74 aa7.19□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 MBD3L1Q8WWY6 194 aa7.19□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 TMEM101Q96IK0 257 aa7.19□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 BTF3L4Q96K17 158 aa7.19□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 BIN3Q9NQY0 253 aa7.19□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 NCR2O95944 276 aa7.18□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 ISOC2Q96AB3 205 aa7.18□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 MANBALQ9NQG1 85 aa7.18□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 H2AFB1P0C5Y9 115 aa7.17□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 NTF3P20783 257 aa7.17□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 XCL1P47992 114 aa7.17□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 GNG4P50150 75 aa7.17□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 TWIST1Q15672 202 aa7.17□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 CENPWQ5EE01 88 aa7.17□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 ZNF664Q8N3J9 261 aa7.17□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 SMIM12Q96EX1 92 aa7.17□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 CYTL1Q9NRR1 136 aa7.17□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 TEX46H3BTG2 121 aa7.16□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 FGF6P10767 208 aa7.16□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 FOXI1Q12951 378 aa7.16□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 LYZL1Q6UWQ5 148 aa7.16□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 OR5A1Q8NGJ0 315 aa7.16□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.15□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 MT-ND6P03923 174 aa7.15□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 SYCNQ0VAF6 134 aa7.15□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 GAGE2BQ13066 116 aa7.15□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 SS18Q15532 418 aa7.15□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 TEX261Q6UWH6 196 aa7.15□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 C11orf52Q96A22 123 aa7.15□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 GNG13Q9P2W3 67 aa7.15□□□□□ -1.26
CMTM1-211ENST00000528484 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.14□□□□□ -1.27
CMTM1-211ENST00000528484 C19orf71A6NCJ1 209 aa7.14□□□□□ -1.27
CMTM1-211ENST00000528484 CCL25O15444 150 aa7.14□□□□□ -1.27
CMTM1-211ENST00000528484 MALP21145 153 aa7.14□□□□□ -1.27
CMTM1-211ENST00000528484 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CMTM1-211ENST00000528484 Q6ZNX1 250 aa7.14□□□□□ -1.27
CMTM1-211ENST00000528484 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.14□□□□□ -1.27
CMTM1-211ENST00000528484 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CMTM1-211ENST00000528484 A0A0U1RQV1 116 aa7.13□□□□□ -1.27
CMTM1-211ENST00000528484 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa7.13□□□□□ -1.27
CMTM1-211ENST00000528484 PMCHP20382 165 aa7.13□□□□□ -1.27
CMTM1-211ENST00000528484 CTRLP40313 264 aa7.13□□□□□ -1.27
CMTM1-211ENST00000528484 CAMPP49913 170 aa7.13□□□□□ -1.27
CMTM1-211ENST00000528484 PTTG1IPP53801 180 aa7.13□□□□□ -1.27
CMTM1-211ENST00000528484 CCL20P78556 96 aa7.13□□□□□ -1.27
CMTM1-211ENST00000528484 C9orf62Q8N4C0 152 aa7.13□□□□□ -1.27
CMTM1-211ENST00000528484 GATD1Q8NB37 220 aa7.13□□□□□ -1.27
CMTM1-211ENST00000528484 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.13□□□□□ -1.27
CMTM1-211ENST00000528484 MUC2Q02817 5179 aa7.13□□□□□ -1.27
CMTM1-211ENST00000528484 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.12□□□□□ -1.27
CMTM1-211ENST00000528484 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.12□□□□□ -1.27
CMTM1-211ENST00000528484 I3L3M4 83 aa7.12□□□□□ -1.27
CMTM1-211ENST00000528484 PDE6DO43924 150 aa7.12□□□□□ -1.27
CMTM1-211ENST00000528484 ZNF345Q14585 488 aa7.12□□□□□ -1.27
CMTM1-211ENST00000528484 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.12□□□□□ -1.27
CMTM1-211ENST00000528484 MRAP2Q96G30 205 aa7.12□□□□□ -1.27
CMTM1-211ENST00000528484 FAM210AQ96ND0 272 aa7.12□□□□□ -1.27
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