RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519815.5

TRPS1-210, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRPS1, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-210ENST00000519815 ORMDL2Q53FV1 153 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 ZNRF2Q8NHG8 242 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 Q9UF83 564 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 PRO0255Q9UI72 69 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 G0S2P27469 103 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 FCER1GP30273 86 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 CRYBA4P53673 196 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 PMCHL1Q16048 86 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 C12orf74Q32Q52 190 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 NEGR1Q7Z3B1 354 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 OR10D4PQ8NGN7 298 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 GAGE12JA6NER3 117 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 F5H768 121 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 PAX4O43316 350 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 NUDT3O95989 172 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 HBDP02042 147 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 GAGE1Q13065 139 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 GAGE4Q13068 117 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 GAGE5Q13069 117 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 GAGE13Q4V321 117 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 C11orf45Q8TAV5 145 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa7.34□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 A0A096LNJ9 63 aa7.33□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 LEPROTL1O95214 131 aa7.33□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 TSHBP01222 138 aa7.33□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 HTN3P15516 51 aa7.33□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 BTF3P20290 206 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 UBE2D3P61077 147 aa7.33□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 UBE2D2P62837 147 aa7.33□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 DEFA6Q01524 100 aa7.33□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 HSPB8Q9UJY1 196 aa7.33□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 DNAH3Q8TD57 4116 aa7.33□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 NACAE9PAV3 2078 aa7.32□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.32□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 LINC01549A6NIU2 74 aa7.32□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 GYPEP15421 78 aa7.32□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 MALP21145 153 aa7.32□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 COTL1Q14019 142 aa7.32□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa7.32□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 C2orf66Q6UXQ4 117 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 TOMM6Q96B49 74 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 A0A0J9YY99 117 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 LINC00694P0DN24 101 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 KRTDAPP60985 99 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 Q6ZTC4 211 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 GTSF1LQ9H1H1 148 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 CYSLTR1Q9Y271 337 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 ATP5LO75964 103 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 C3orf79P0CE67 100 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 TMEM97Q5BJF2 176 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 LINC00173Q6ZV60 143 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 C20orf203Q8NBC4 194 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 H3BNG1 76 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 ERASQ7Z444 233 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 SH2D6Q7Z4S9 175 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 ICOSQ9Y6W8 199 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-210ENST00000519815 TRAV10A0A0B4J240 114 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 RPL39P62891 51 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 PET117Q6UWS5 81 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 TMEM141Q96I45 108 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 IGIPA6NJ69 53 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 SCGB1D1O95968 90 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 PRSS1P07477 247 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 Q6ZN92 141 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 SPATA12Q7Z6I5 190 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 TIMM17AQ99595 171 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 TMEM243Q9BU79 118 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 C20orf202A1L168 122 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 H7C423 109 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 NPSP0C0P6 89 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms