RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515147.1

ITGA3-215, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-215ENST00000515147 MANBALQ9NQG1 85 aa11.4□□□□□ -0.58
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ITGA3-215ENST00000515147 HMSDA8MTL9 139 aa11.39□□□□□ -0.59
ITGA3-215ENST00000515147 F2Z2F3 143 aa11.39□□□□□ -0.59
ITGA3-215ENST00000515147 UBE2L6O14933 153 aa11.39□□□□□ -0.59
ITGA3-215ENST00000515147 C15orf56Q8N910 161 aa11.39□□□□□ -0.59
ITGA3-215ENST00000515147 PLAC8Q9NZF1 115 aa11.39□□□□□ -0.59
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ITGA3-215ENST00000515147 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
ITGA3-215ENST00000515147 APCSP02743 223 aa11.25□□□□□ -0.61
ITGA3-215ENST00000515147 SDHAF1A6NFY7 115 aa11.24□□□□□ -0.61
ITGA3-215ENST00000515147 K7EN84 100 aa11.24□□□□□ -0.61
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ITGA3-215ENST00000515147 A0A0J9YXV3 536 aa11.23□□□□□ -0.61
ITGA3-215ENST00000515147 XCL1P47992 114 aa11.23□□□□□ -0.61
ITGA3-215ENST00000515147 OCC1Q8TAD7 63 aa11.23□□□□□ -0.61
ITGA3-215ENST00000515147 LINC00526Q96FQ7 95 aa11.23□□□□□ -0.61
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ITGA3-215ENST00000515147 KRTAP10-8P60410 259 aa11.22□□□□□ -0.61
ITGA3-215ENST00000515147 TEX261Q6UWH6 196 aa11.22□□□□□ -0.61
ITGA3-215ENST00000515147 SMIM15Q7Z3B0 74 aa11.22□□□□□ -0.61
ITGA3-215ENST00000515147 LINC00474Q9P2X8 69 aa11.22□□□□□ -0.61
ITGA3-215ENST00000515147 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa11.21□□□□□ -0.61
ITGA3-215ENST00000515147 CCL25O15444 150 aa11.21□□□□□ -0.61
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ITGA3-215ENST00000515147 BTF3L4Q96K17 158 aa11.2□□□□□ -0.62
ITGA3-215ENST00000515147 GAS8-AS1O95177 125 aa11.19□□□□□ -0.62
ITGA3-215ENST00000515147 ESDP10768 282 aa11.19□□□□□ -0.62
ITGA3-215ENST00000515147 TCTE3Q8IZS6 198 aa11.19□□□□□ -0.62
ITGA3-215ENST00000515147 TMEM101Q96IK0 257 aa11.19□□□□□ -0.62
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ITGA3-215ENST00000515147 PKIGQ9Y2B9 76 aa11.19□□□□□ -0.62
ITGA3-215ENST00000515147 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa11.18□□□□□ -0.62
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