RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 AMTP48728 403 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-208ENST00000504294 CLRN3Q8NCR9 226 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-208ENST00000504294 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-208ENST00000504294 C7orf77A4D0Y5 90 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP2-208ENST00000504294 APCSP02743 223 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP2-208ENST00000504294 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
SH3BP2-208ENST00000504294 KIR2DL4Q99706 377 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP2-208ENST00000504294 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP2-208ENST00000504294 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A1B0GUV1 79 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP2-208ENST00000504294 PSCAO43653 123 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP2-208ENST00000504294 APOC3P02656 99 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP2-208ENST00000504294 CRPP02741 224 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP2-208ENST00000504294 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
SH3BP2-208ENST00000504294 RPL32P62910 135 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
SH3BP2-208ENST00000504294 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP2-208ENST00000504294 ORMDL3Q8N138 153 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP2-208ENST00000504294 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM70Q9BUB7 260 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP2-208ENST00000504294 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP2-208ENST00000504294 RPS10P5Q9NQ39 176 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP2-208ENST00000504294 DNAH6Q9C0G6 4158 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP2-208ENST00000504294 FCER1GP30273 86 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM18Q96B42 140 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP2-208ENST00000504294 ANGP03950 147 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
SH3BP2-208ENST00000504294 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM136Q6ZRR5 245 aa9.82□□□□□ -0.84
SH3BP2-208ENST00000504294 HLA-DQA1P01909 254 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-208ENST00000504294 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-208ENST00000504294 ATRAIDQ6UW56 229 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM101Q96IK0 257 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-208ENST00000504294 KLK12Q9UKR0 248 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-208ENST00000504294 HYDINQ4G0P3 5121 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-208ENST00000504294 D6R8Y8 96 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-208ENST00000504294 TNFRSF6BO95407 300 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-208ENST00000504294 MT-ND6P03923 174 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-208ENST00000504294 GAGE6Q13070 117 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-208ENST00000504294 MIAQ16674 131 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-208ENST00000504294 NRACQ8N912 160 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-208ENST00000504294 GNB1LQ9BYB4 327 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-208ENST00000504294 RPS10P46783 165 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-208ENST00000504294 RBX1P62877 108 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-208ENST00000504294 MPV17L2Q567V2 206 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-208ENST00000504294 UBE2WQ96B02 151 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-208ENST00000504294 PRELID3AQ96N28 172 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-208ENST00000504294 Q9HAA7 133 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-208ENST00000504294 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP2-208ENST00000504294 SMKR1H3BMG3 65 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP2-208ENST00000504294 RAB5AP20339 215 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP2-208ENST00000504294 G0S2P27469 103 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP2-208ENST00000504294 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
SH3BP2-208ENST00000504294 C1orf43Q9BWL3 253 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP2-208ENST00000504294 MAP1LC3AQ9H492 121 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP2-208ENST00000504294 PRSS47A8MTI9 375 aa9.77□□□□□ -0.85
SH3BP2-208ENST00000504294 K7EMI3 77 aa9.77□□□□□ -0.85
SH3BP2-208ENST00000504294 TNP2Q05952 138 aa9.77□□□□□ -0.85
SH3BP2-208ENST00000504294 TSHBP01222 138 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP2-208ENST00000504294 ESDP10768 282 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP2-208ENST00000504294 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP2-208ENST00000504294 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
SH3BP2-208ENST00000504294 Q8N976 141 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP2-208ENST00000504294 SMIM2Q9BVW6 85 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP2-208ENST00000504294 PRR34Q9NV39 138 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP2-208ENST00000504294 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP2-208ENST00000504294 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa9.75□□□□□ -0.85
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SH3BP2-208ENST00000504294 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
SH3BP2-208ENST00000504294 NPYP01303 97 aa9.74□□□□□ -0.85
SH3BP2-208ENST00000504294 FGF6P10767 208 aa9.74□□□□□ -0.85
SH3BP2-208ENST00000504294 REG3AQ06141 175 aa9.74□□□□□ -0.85
SH3BP2-208ENST00000504294 CDPF1Q6NVV7 123 aa9.74□□□□□ -0.85
SH3BP2-208ENST00000504294 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
SH3BP2-208ENST00000504294 LINC00269Q8N2A0 174 aa9.74□□□□□ -0.85
SH3BP2-208ENST00000504294 OR5A1Q8NGJ0 315 aa9.74□□□□□ -0.85
SH3BP2-208ENST00000504294 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A087WTM6 91 aa9.73□□□□□ -0.85
SH3BP2-208ENST00000504294 CCL25O15444 150 aa9.73□□□□□ -0.85
SH3BP2-208ENST00000504294 C14orf177Q52M58 125 aa9.73□□□□□ -0.85
SH3BP2-208ENST00000504294 ENHOQ6UWT2 76 aa9.73□□□□□ -0.85
SH3BP2-208ENST00000504294 TIMM21Q9BVV7 248 aa9.73□□□□□ -0.85
SH3BP2-208ENST00000504294 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
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SH3BP2-208ENST00000504294 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
SH3BP2-208ENST00000504294 LINC01549A6NIU2 74 aa9.72□□□□□ -0.85
SH3BP2-208ENST00000504294 ORMDL2Q53FV1 153 aa9.72□□□□□ -0.85
SH3BP2-208ENST00000504294 Q8N3U1 123 aa9.72□□□□□ -0.85
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SH3BP2-208ENST00000504294 C20orf203Q8NBC4 194 aa9.72□□□□□ -0.85
SH3BP2-208ENST00000504294 SMCO4Q9NRQ5 59 aa9.72□□□□□ -0.85
SH3BP2-208ENST00000504294 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
SH3BP2-208ENST00000504294 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-208ENST00000504294 FABP9Q0Z7S8 132 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-208ENST00000504294 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-208ENST00000504294 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-208ENST00000504294 SPANXA1Q9NS26 97 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-208ENST00000504294 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-208ENST00000504294 SPATA12Q7Z6I5 190 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-208ENST00000504294 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa9.68□□□□□ -0.86
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