RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498280.1

RBM39-242, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 3

Gene RBM39, Length 444 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-242ENST00000498280 ZNF815PA8K554 130 aa-0.11□□□□□ -2.43
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RBM39-242ENST00000498280 NCR2O95944 276 aa-0.11□□□□□ -2.43
RBM39-242ENST00000498280 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa-0.11□□□□□ -2.43
RBM39-242ENST00000498280 S100A7L2Q5SY68 101 aa-0.11□□□□□ -2.43
RBM39-242ENST00000498280 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa-0.11□□□□□ -2.43
RBM39-242ENST00000498280 SPTSSBQ8NFR3 76 aa-0.11□□□□□ -2.43
RBM39-242ENST00000498280 WFDC6Q9BQY6 131 aa-0.11□□□□□ -2.43
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RBM39-242ENST00000498280 TEX15Q9BXT5 2789 aa-0.11□□□□□ -2.43
RBM39-242ENST00000498280 FHAD1B1AJZ9 1412 aa-0.12□□□□□ -2.43
RBM39-242ENST00000498280 STARD9Q9P2P6 4700 aa-0.12□□□□□ -2.43
RBM39-242ENST00000498280 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa-0.12□□□□□ -2.43
RBM39-242ENST00000498280 MYO15AQ9UKN7 3530 aa-0.12□□□□□ -2.43
RBM39-242ENST00000498280 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa-0.12□□□□□ -2.43
RBM39-242ENST00000498280 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa-0.12□□□□□ -2.43
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RBM39-242ENST00000498280 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa-0.12□□□□□ -2.43
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RBM39-242ENST00000498280 TPT1P8Q9HAU6 139 aa-0.12□□□□□ -2.43
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RBM39-242ENST00000498280 TMEM2Q9UHN6 1383 aa-0.12□□□□□ -2.43
RBM39-242ENST00000498280 ZFHX4Q86UP3 3567 aa-0.12□□□□□ -2.43
RBM39-242ENST00000498280 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP-0.12□□□□□ -2.43
RBM39-242ENST00000498280 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa-0.13□□□□□ -2.43
RBM39-242ENST00000498280 LRP1BQ9NZR2 4599 aa-0.13□□□□□ -2.43
RBM39-242ENST00000498280 LAMA5O15230 3695 aa-0.13□□□□□ -2.43
RBM39-242ENST00000498280 UNC80Q8N2C7 3258 aa-0.13□□□□□ -2.43
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RBM39-242ENST00000498280 PIPP12273 146 aaPredicted RBP-0.13□□□□□ -2.43
RBM39-242ENST00000498280 CBLN1P23435 193 aa-0.13□□□□□ -2.43
RBM39-242ENST00000498280 SMIM21Q3B7S5 101 aa-0.13□□□□□ -2.43
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RBM39-242ENST00000498280 SPTSSAQ969W0 71 aa-0.13□□□□□ -2.43
RBM39-242ENST00000498280 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP-0.13□□□□□ -2.43
RBM39-242ENST00000498280 CEP295Q9C0D2 2601 aa-0.13□□□□□ -2.43
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RBM39-242ENST00000498280 CEP152O94986 1710 aa-0.13□□□□□ -2.43
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RBM39-242ENST00000498280 CFAP46Q8IYW2 2715 aa-0.14□□□□□ -2.43
RBM39-242ENST00000498280 FAT1Q14517 4588 aa-0.14□□□□□ -2.43
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RBM39-242ENST00000498280 ALX1Q15699 326 aa-0.14□□□□□ -2.43
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RBM39-242ENST00000498280 SPG11Q96JI7 2443 aa-0.15□□□□□ -2.43
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RBM39-242ENST00000498280 C2CD3Q4AC94 2353 aa-0.15□□□□□ -2.43
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RBM39-242ENST00000498280 SEC11CQ9BY50 192 aa-0.16□□□□□ -2.44
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RBM39-242ENST00000498280 CCL8P80075 99 aa-0.17□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 CFAP126Q5VTH2 177 aa-0.17□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 Q5VV11 94 aa-0.17□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 BAGE3Q86Y29 109 aa-0.17□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa-0.17□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 LRRC37A3O60309 1634 aa-0.17□□□□□ -2.44
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RBM39-242ENST00000498280 A0A0D9SFI3 127 aa-0.18□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 C10orf142B7Z368 130 aa-0.18□□□□□ -2.44
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