RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498189.1

BBS9-215, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 9, human

TSL 2

Gene BBS9, Length 614 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS9-215	ENST00000498189	UPK3B	Q9BT76	320 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	PARL	Q9H300	379 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	TMEM250	H0YL14	139 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	IFITM1	P13164	125 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	ARL16	Q0P5N6	197 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	IL15RA	Q13261	267 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189		Q6AWC8	147 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189		Q6ZUT4	128 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	NFE4	Q86UQ8	179 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	C6orf223	Q8N319	242 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	C17orf77	Q96MU5	243 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	PAXX	Q9BUH6	204 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	KLLN	B2CW77	178 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	GCSH	P23434	173 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	ZNF138	P52744	262 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	DEFB1	P60022	68 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189		Q9H8V8	135 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	FAM231B	A6NCW3	169 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	TMEM262	E9PQX1	116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189		M0R2N4	97 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	H2BFS	P57053	126 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	KCNS1	Q96KK3	526 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	ZNF492	Q9P255	531 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	PRO0255	Q9UI72	69 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189		A0A1B0GVY2	172 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	RTL8C	O15255	209 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	SPINK4	O60575	86 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	IGLC6	P0CF74	106 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189		Q0VG73	95 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	GAGE2B	Q13066	116 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	VGLL1	Q99990	258 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189		Q9H3A6	140 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	OTOR	Q9NRC9	128 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	KMT2A	Q03164	3969 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189		A0A1B0GV50	99 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	ZNF727	A8MUV8	499 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	GGTLC3	B5MD39	225 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189		C9JCJ5	164 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	CDK2AP2	O75956	126 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	NDUFC2	O95298	119 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	MT-ATP8	P03928	68 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	FABP2	P12104	132 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	SERF2	P84101	59 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	KIR2DL4	Q99706	377 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS9-215	ENST00000498189	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBS9-215	ENST00000498189		H3BTX0	84 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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