RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495787.1

ECHDC3-204, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene ECHDC3, Length 505 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-204ENST00000495787 DEFB4AO15263 64 aa7.59□□□□□ -1.19
ECHDC3-204ENST00000495787 TSHBP01222 138 aa7.59□□□□□ -1.19
ECHDC3-204ENST00000495787 SPART-AS1P0CW21 52 aa7.59□□□□□ -1.19
ECHDC3-204ENST00000495787 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.59□□□□□ -1.19
ECHDC3-204ENST00000495787 C2orf66Q6UXQ4 117 aa7.59□□□□□ -1.19
ECHDC3-204ENST00000495787 SPATA12Q7Z6I5 190 aa7.59□□□□□ -1.19
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNRF2Q8NHG8 242 aa7.59□□□□□ -1.19
ECHDC3-204ENST00000495787 MUC7Q8TAX7 377 aa7.59□□□□□ -1.19
ECHDC3-204ENST00000495787 Q9UF83 564 aa7.59□□□□□ -1.19
ECHDC3-204ENST00000495787 CYSLTR1Q9Y271 337 aa7.59□□□□□ -1.19
ECHDC3-204ENST00000495787 DNAH1Q9P2D7 4330 aa7.58□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 LCE6AA0A183 80 aa7.58□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 C20orf202A1L168 122 aa7.58□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 DAD1P61803 113 aa7.58□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 PRADC1Q9BSG0 188 aa7.58□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 RETNQ9HD89 108 aa7.58□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 UBE2D3P61077 147 aa7.57□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 UBE2D2P62837 147 aa7.57□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 S100A12P80511 92 aa7.57□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 LINC01545Q5VT33 79 aa7.57□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 TEX43Q6ZNM6 134 aa7.57□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.57□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 CELA1Q9UNI1 258 aa7.57□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 GAGE12JA6NER3 117 aa7.56□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 ATP5G1P05496 136 aa7.56□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 GAGE1Q13065 139 aa7.56□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 GAGE4Q13068 117 aa7.56□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 GAGE5Q13069 117 aa7.56□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 COTL1Q14019 142 aa7.56□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 GAGE13Q4V321 117 aa7.56□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 LGALS9CQ6DKI2 356 aa7.56□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 ERASQ7Z444 233 aa7.56□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 SBSPONQ8IVN8 264 aa7.56□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 C20orf203Q8NBC4 194 aa7.56□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa7.56□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 HHLA3Q9XRX5 114 aa7.56□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 DNAH7Q8WXX0 4024 aa7.55□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa7.55□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 H0Y8G0 127 aa7.55□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 PRSS1P07477 247 aa7.55□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 CRYBA4P53673 196 aa7.55□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 Q6ZN92 141 aa7.55□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM141Q96I45 108 aa7.55□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 TIMM17AQ99595 171 aa7.55□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 SPATA25Q9BR10 227 aa7.55□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 ZMAT4Q9H898 229 aa7.55□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 PRO0255Q9UI72 69 aa7.55□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.54□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 IGIPA6NJ69 53 aa7.54□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 LINC00694P0DN24 101 aa7.54□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 RPL39P62891 51 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 TM2D3Q9BRN9 247 aa7.54□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.54□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.53□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 VAMP8Q9BV40 100 aa7.53□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.53□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 GTSF1LQ9H1H1 148 aa7.53□□□□□ -1.2
ECHDC3-204ENST00000495787 LYSTQ99698 3801 aa7.52□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 HYDINQ4G0P3 5121 aa7.52□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 A0A087WX48 190 aa7.52□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 PAX4O43316 350 aa7.52□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 GYPEP15421 78 aa7.52□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 ODF1Q14990 250 aa7.52□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 C12orf74Q32Q52 190 aa7.52□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM97Q5BJF2 176 aa7.52□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 BAALCQ8WXS3 180 aa7.52□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.52□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa7.51□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 F5H768 121 aa7.51□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 NPSP0C0P6 89 aa7.51□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 ATOH7Q8N100 152 aa7.51□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF664Q8N3J9 261 aa7.51□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 PMCHL2Q9BQD1 86 aa7.51□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 SPANXA1Q9NS26 97 aa7.51□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 STARD9Q9P2P6 4700 aa7.51□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 A0A0J9YWU9 116 aa7.5□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 PKIAP61925 76 aa7.5□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 PMVKQ15126 192 aa7.5□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa7.5□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.5□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa7.5□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.5□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 TIMM21Q9BVV7 248 aa7.5□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 PRSS29PA6NIE9 313 aa7.49□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.49□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 H7C423 109 aa7.49□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 DPM2O94777 84 aa7.49□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 HTN3P15516 51 aa7.49□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.49□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 SPATA45Q537H7 98 aa7.49□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM243Q9BU79 118 aa7.49□□□□□ -1.21
ECHDC3-204ENST00000495787 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.4 ms