RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492762.1

TMEM106B-208, Transcript of transmembrane protein 106B, human

TSL 4

Gene TMEM106B, Length 590 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM106B-208	ENST00000492762	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	COX7C	P15954	63 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	HLA-DMB	P28068	263 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	ASIP	P42127	132 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	CSN1S1	P47710	185 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	DYNLT3	P51808	116 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	PCBD1	P61457	104 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	HBB	P68871	147 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	QRFP	P83859	136 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	PMCHL1	Q16048	86 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	LINC01545	Q5VT33	79 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	MIC13	Q5XKP0	118 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762		Q6ZS92	163 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	TEN1	Q86WV5	123 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	MORN4	Q8NDC4	146 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	MUCL1	Q96DR8	90 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	PRELID3A	Q96N28	172 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	ZNF714	Q96N38	554 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	AMELY	Q99218	206 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	C20orf78	Q9BR46	151 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	AGL	P35573	1532 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	ATP7A	Q04656	1500 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	DEPDC5	O75140	1603 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		0.93	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	SSSCA1	O60232	199 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	NUPR1	O60356	82 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	YPEL1	O60688	119 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	TIMM17B	O60830	172 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	PROSC	O94903	275 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	IGKC	P01834	107 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	HBD	P02042	147 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	C1QA	P02745	245 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	COX6A1	P12074	109 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	CBLN1	P23435	193 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	ZNF345	Q14585	488 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	INSL4	Q14641	139 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	ETDB	Q3ZM63	59 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	LINC01554	Q52M75	96 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	XAF1	Q6GPH4	301 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	SMIM5	Q71RC9	77 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	YPEL2	Q96QA6	119 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	IL36B	Q9NZH7	164 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	RABAC1	Q9UI14	185 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762		V9GYH0	126 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	CPS1	P31327	1500 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	LRRC37A3	O60309	1634 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	EML5	Q05BV3	1969 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762		A0A0G2JMZ2	1700 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	C4A	P0C0L4	1744 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	C4B	P0C0L5	1744 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	PTPRM	P28827	1452 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	PLXNB2	O15031	1838 aa		0.92	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	LRP5	O75197	1615 aa		0.91	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	hADV29S1	A0JD25	119 aa		0.91	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		0.91	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762		J3QLW9	94 aa		0.91	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	OR1I1	O60431	355 aa		0.91	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	TCL1B	O95988	128 aa		0.91	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	PRM2	P04554	102 aa		0.91	□□□□□ -2.26
TMEM106B-208	ENST00000492762	IL5	P05113	134 aa		0.91	□□□□□ -2.26

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