RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487849.7

HOXB-AS3-212, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 428 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TMEM191AQ9H0A3 160 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ENHOQ6UWT2 76 aa13.11□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LINC00269Q8N2A0 174 aa13.11□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa13.11□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa13.11□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-212ENST00000487849 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa13.11□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SDHAF1A6NFY7 115 aa13.09□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NCR2O95944 276 aa13.09□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CLPSL2Q6UWE3 100 aa13.09□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-212ENST00000487849 APOBP04114 4563 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-212ENST00000487849 APCSP02743 223 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-212ENST00000487849 KRTAP10-1P60331 282 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-212ENST00000487849 WFDC2Q14508 124 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MRAP2Q96G30 205 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ST20Q9HBF5 79 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-212ENST00000487849 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-212ENST00000487849 A0A1B0GUV1 79 aa13.07□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa13.07□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PMCHP20382 165 aa13.07□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-212ENST00000487849 AMN1Q8IY45 258 aa13.07□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PRR34Q9NV39 138 aa13.07□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-212ENST00000487849 I3L3M4 83 aa13.06□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-212ENST00000487849 HLA-DQA1P01909 254 aa13.06□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RAB4AP20338 218 aa13.06□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-212ENST00000487849 REG3AQ06141 175 aa13.06□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-212ENST00000487849 C14orf177Q52M58 125 aa13.06□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-212ENST00000487849 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa13.06□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa13.05□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-212ENST00000487849 A0A1B0GW15 77 aa13.05□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PPP1R17O96001 155 aa13.05□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-212ENST00000487849 S100A8P05109 93 aa13.04□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CAMPP49913 170 aa13.04□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RNF185Q96GF1 192 aa13.04□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PPP1R2P9O14990 202 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CLLU1Q5K131 121 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-212ENST00000487849 C20orf203Q8NBC4 194 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-212ENST00000487849 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa13.02□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa13.02□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 H7C423 109 aa13.02□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TMEM70Q9BUB7 260 aa13.02□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa13.01□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 F8W036 122 aa13.01□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GAS8-AS1O95177 125 aa13.01□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 Q8N1X5 172 aa13.01□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SMKR1H3BMG3 65 aa13□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RPS10P46783 165 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 HBBP68871 147 aa13□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FAM104BQ5XKR9 115 aa13□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 BTF3L4Q96K17 158 aa13□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TMEM242Q9NWH2 141 aa13□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PCLOQ9Y6V0 5065 aa13□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 USP17L23D6RBM5 183 aa12.99□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MT-ND4LP03901 98 aa12.99□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FCER1GP30273 86 aa12.99□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TMEM101Q96IK0 257 aa12.99□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa12.98□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa12.98□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 VCYO14598 125 aa12.98□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FGF6P10767 208 aa12.98□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CKS2P33552 79 aa12.98□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LINC00862A6NCI5 91 aa12.97□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TSHBP01222 138 aa12.97□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 XGP55808 180 aa12.97□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 KIR2DL4Q99706 377 aa12.97□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa12.96□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ANAPC16Q96DE5 110 aa12.96□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 C7orf77A4D0Y5 90 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 UQCC3Q6UW78 93 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NRACQ8N912 160 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 OR5A1Q8NGJ0 315 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SMAGPQ0VAQ4 97 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 A0A1B0GXF2 115 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 EPM2AB3EWF7 344 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ESDP10768 282 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LINC01620Q4KN68 170 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CLRN3Q8NCR9 226 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 C20orf78Q9BR46 151 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 HAMPP81172 84 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 IFITM2Q01629 132 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 D6R8Y8 96 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TCAPO15273 167 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PPBPP02775 128 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PRSS1P07477 247 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ABCA13Q86UQ4 5058 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 hDV102S1A0JD36 115 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GAGE12HA6NDE8 117 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TNFRSF6BO95407 300 aa12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms