RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 Q8N8P6 123 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-207ENST00000484547 HHLA3Q9XRX5 114 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-207ENST00000484547 H3BTX0 84 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-207ENST00000484547 H3BUT2 72 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-207ENST00000484547 DAD1P61803 113 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-207ENST00000484547 RNF185Q96GF1 192 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-207ENST00000484547 C17orf77Q96MU5 243 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC50A1Q9BRV3 221 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-207ENST00000484547 TP73-AS1Q9UF72 201 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-207ENST00000484547 SPCS1Q9Y6A9 102 aa8.28□□□□□ -1.08
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RABGEF1-207ENST00000484547 C8orf49Q96NF6 230 aa8.27□□□□□ -1.09
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RABGEF1-207ENST00000484547 ID1P41134 155 aa8.27□□□□□ -1.09
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RABGEF1-207ENST00000484547 C15orf53Q8NAA6 179 aa8.27□□□□□ -1.09
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RABGEF1-207ENST00000484547 A0A0J9YX75 114 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-207ENST00000484547 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-207ENST00000484547 PRM2P04554 102 aa8.23□□□□□ -1.09
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RABGEF1-207ENST00000484547 LEPP41159 167 aa8.22□□□□□ -1.09
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RABGEF1-207ENST00000484547 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
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RABGEF1-207ENST00000484547 LYRM9A8MSI8 78 aa8.21□□□□□ -1.1
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RABGEF1-207ENST00000484547 PPP1R17O96001 155 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-207ENST00000484547 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
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RABGEF1-207ENST00000484547 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.19□□□□□ -1.1
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RABGEF1-207ENST00000484547 INSP01308 110 aa8.19□□□□□ -1.1
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RABGEF1-207ENST00000484547 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-207ENST00000484547 A8MTW9 85 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-207ENST00000484547 H7C1H1 209 aa8.18□□□□□ -1.1
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RABGEF1-207ENST00000484547 KRTAP10-2P60368 255 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-207ENST00000484547 SAMD13Q5VXD3 122 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-207ENST00000484547 SIGMAR1Q99720 223 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-207ENST00000484547 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-207ENST00000484547 ATP5G1P05496 136 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-207ENST00000484547 AZU1P20160 251 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-207ENST00000484547 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa8.18□□□□□ -1.1
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