RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481204.5

SKAP2-204, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SKAP2, Length 513 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2-204ENST00000481204 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa4.37□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 HSPB8Q9UJY1 196 aa4.37□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 PAM16Q9Y3D7 125 aa4.37□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 COL6A5A8TX70 2615 aa4.36□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa4.36□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 hDV102S1A0JD36 115 aa4.36□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 A8MWV9 139 aa4.36□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 NUDT3O95989 172 aa4.36□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 TSHBP01222 138 aa4.36□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 PKIAP61925 76 aa4.36□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 S100A12P80511 92 aa4.36□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 RRN3P1Q2M238 152 aa4.36□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 DEFB135Q30KP9 77 aa4.36□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 OR4C5Q8NGB2 326 aa4.36□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 C16orf74Q96GX8 76 aa4.36□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 VAMP8Q9BV40 100 aa4.36□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa4.35□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 G3V4G9 280 aa4.35□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 VCYO14598 125 aa4.35□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 PPP1R17O96001 155 aa4.35□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa4.35□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 RIPPLY3P57055 190 aa4.35□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 TCTAP57738 103 aa4.35□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 RPL39P62891 51 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 SPATA45Q537H7 98 aa4.35□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa4.35□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 LINC01545Q5VT33 79 aa4.35□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 ZFP2Q6ZN57 461 aa4.35□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa4.35□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 OVOL2Q9BRP0 275 aa4.35□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 TP73-AS1Q9UF72 201 aa4.35□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa4.34□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa4.34□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa4.34□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa4.34□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa4.34□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 RHODO00212 210 aa4.34□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 PRSS1P07477 247 aa4.34□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 RPL32P62910 135 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 ORMDL2Q53FV1 153 aa4.34□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa4.34□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 C2orf66Q6UXQ4 117 aa4.34□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 KIR2DL5AQ8N109 375 aa4.34□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 OR11H2Q8NH07 326 aa4.34□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 TOMM6Q96B49 74 aa4.34□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 SCGB3A1Q96QR1 104 aa4.34□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 RETNQ9HD89 108 aa4.34□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa4.34□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 TRGV2A0A075B6R0 118 aa4.33□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 TRAV4A0A0B4J268 109 aa4.33□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa4.33□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 C20orf202A1L168 122 aa4.33□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 TSTD3H0UI37 97 aa4.33□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 H7C1H1 209 aa4.33□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 DEFB130BP0DP73 79 aa4.33□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 DEFB130AP0DP74 79 aa4.33□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 DDTP30046 118 aa4.33□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 APOC4P55056 127 aa4.33□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa4.33□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 LGALS9BQ3B8N2 356 aa4.33□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 LGALS9CQ6DKI2 356 aa4.33□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 STPG4Q8N801 248 aa4.33□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 ZNRF2Q8NHG8 242 aa4.33□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 C14orf144Q96I85 54 aa4.33□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 EDA2RQ9HAV5 297 aa4.33□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa4.33□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 GAGE12JA6NER3 117 aa4.32□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 IGIPA6NJ69 53 aa4.32□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 I3L3M4 83 aa4.32□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 K7EQD1 137 aa4.32□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 ATP5LO75964 103 aa4.32□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 GAGE1Q13065 139 aa4.32□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 GAGE4Q13068 117 aa4.32□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 GAGE5Q13069 117 aa4.32□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 FHL2Q14192 279 aa4.32□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 FAM222AQ5U5X8 452 aa4.32□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 SLC25A29Q8N8R3 303 aa4.32□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa4.32□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 KIR2DL4Q99706 377 aa4.32□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 TM2D2Q9BX73 214 aa4.32□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 CELA1Q9UNI1 258 aa4.32□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 CYSLTR1Q9Y271 337 aa4.32□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa4.31□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 A0A087WX48 190 aa4.31□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa4.31□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 SMIM9A6NGZ8 99 aa4.31□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 K7EMI3 77 aa4.31□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 IGLC3P0DOY3 106 aa4.31□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 RHOHQ15669 191 aa4.31□□□□□ -1.72
SKAP2-204ENST00000481204 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 156.6 ms