RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480171.7

PKP4-210, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 2

Gene PKP4, Length 2,772 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-210ENST00000480171 ZFHX3Q15911 3703 aa6.42□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 TRAV2A0A0B4J234 112 aa6.42□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 P0DMU3 169 aa6.42□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 FAM231AP0DMU4 169 aa6.42□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 FAM231CP0DMU5 169 aa6.42□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.42□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 PRORYQ9H606 182 aa6.42□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.42□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 MYO18BQ8IUG5 2567 aa6.42□□□□□ -1.38
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PKP4-210ENST00000480171 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 A0A0J9YXV3 536 aa6.41□□□□□ -1.38
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PKP4-210ENST00000480171 RNF183Q96D59 192 aa6.41□□□□□ -1.38
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PKP4-210ENST00000480171 IGHV4-59P01825 116 aa6.4□□□□□ -1.38
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PKP4-210ENST00000480171 DUX3Q96PT4 197 aa6.4□□□□□ -1.38
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PKP4-210ENST00000480171 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.4□□□□□ -1.38
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PKP4-210ENST00000480171 CD28P10747 220 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 TMEM262E9PQX1 116 aa6.4□□□□□ -1.39
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PKP4-210ENST00000480171 Q1RN00 199 aa6.4□□□□□ -1.39
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PKP4-210ENST00000480171 Q96MF0 132 aa6.4□□□□□ -1.39
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PKP4-210ENST00000480171 M0R2P5 195 aa6.39□□□□□ -1.39
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PKP4-210ENST00000480171 H7C2G1 150 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-210ENST00000480171 SLC25A20O43772 301 aa6.39□□□□□ -1.39
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PKP4-210ENST00000480171 A0A0J9YXY3 114 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-210ENST00000480171 C9JAW5 83 aa6.38□□□□□ -1.39
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PKP4-210ENST00000480171 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-210ENST00000480171 HTN1P15515 57 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-210ENST00000480171 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PKP4-210ENST00000480171 Q6ZUT4 128 aa6.38□□□□□ -1.39
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PKP4-210ENST00000480171 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.36□□□□□ -1.39
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PKP4-210ENST00000480171 PRSS2P07478 247 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-210ENST00000480171 XGP55808 180 aa6.36□□□□□ -1.39
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PKP4-210ENST00000480171 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.35□□□□□ -1.39
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PKP4-210ENST00000480171 SPANXCQ9NY87 97 aa6.35□□□□□ -1.39
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PKP4-210ENST00000480171 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.392e-6■■□□□ 14.2
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PKP4-210ENST00000480171 A8MTW9 85 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-210ENST00000480171 H3BMM0 161 aa6.35□□□□□ -1.39
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PKP4-210ENST00000480171 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-210ENST00000480171 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-210ENST00000480171 PROK1P58294 105 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-210ENST00000480171 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PKP4-210ENST00000480171 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-210ENST00000480171 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.34□□□□□ -1.39
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PKP4-210ENST00000480171 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.4
PKP4-210ENST00000480171 LITAFQ99732 161 aa6.34□□□□□ -1.4
PKP4-210ENST00000480171 ZNF702PQ9H963 129 aa6.34□□□□□ -1.4
PKP4-210ENST00000480171 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.34□□□□□ -1.4
PKP4-210ENST00000480171 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.33□□□□□ -1.4
PKP4-210ENST00000480171 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PKP4-210ENST00000480171 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.33□□□□□ -1.4
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