RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477700.1

RALGPS1-213, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 3

Gene RALGPS1, Length 550 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-213ENST00000477700 DEFB130BP0DP73 79 aa7.04□□□□□ -1.28
RALGPS1-213ENST00000477700 DEFB130AP0DP74 79 aa7.04□□□□□ -1.28
RALGPS1-213ENST00000477700 G0S2P27469 103 aa7.04□□□□□ -1.28
RALGPS1-213ENST00000477700 UBE2D3P61077 147 aa7.04□□□□□ -1.28
RALGPS1-213ENST00000477700 UBE2D2P62837 147 aa7.04□□□□□ -1.28
RALGPS1-213ENST00000477700 NEGR1Q7Z3B1 354 aa7.04□□□□□ -1.28
RALGPS1-213ENST00000477700 SPATA25Q9BR10 227 aa7.04□□□□□ -1.28
RALGPS1-213ENST00000477700 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa7.03□□□□□ -1.28
RALGPS1-213ENST00000477700 BTF3P20290 206 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
RALGPS1-213ENST00000477700 CRYBA4P53673 196 aa7.03□□□□□ -1.28
RALGPS1-213ENST00000477700 DAD1P61803 113 aa7.03□□□□□ -1.28
RALGPS1-213ENST00000477700 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
RALGPS1-213ENST00000477700 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
RALGPS1-213ENST00000477700 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa7.02□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 NUDT3O95989 172 aa7.02□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 ATP5G1P05496 136 aa7.02□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 PET117Q6UWS5 81 aa7.02□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 C2orf66Q6UXQ4 117 aa7.02□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 C20orf203Q8NBC4 194 aa7.02□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 ZNRF2Q8NHG8 242 aa7.02□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.02□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 ZMAT4Q9H898 229 aa7.02□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 PRO0255Q9UI72 69 aa7.02□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 HHLA3Q9XRX5 114 aa7.02□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 IGIPA6NJ69 53 aa7.01□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 ATP5LO75964 103 aa7.01□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 KRTDAPP60985 99 aa7.01□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 C12orf74Q32Q52 190 aa7.01□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 LINC01545Q5VT33 79 aa7.01□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 C12orf57Q99622 126 aa7.01□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 PRADC1Q9BSG0 188 aa7.01□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.01□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.01□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 GTSF1LQ9H1H1 148 aa7.01□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 CYSLTR1Q9Y271 337 aa7.01□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 NPSP0C0P6 89 aa7□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 COTL1Q14019 142 aa7□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 CDPF1Q6NVV7 123 aa7□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 TEX43Q6ZNM6 134 aa7□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 ERASQ7Z444 233 aa7□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 VSIG2Q96IQ7 327 aa7□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 TIMM17AQ99595 171 aa7□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 B9D2Q9BPU9 175 aa7□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 COL7A1Q02388 2944 aa7□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.99□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.99□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 GAGE12JA6NER3 117 aa6.99□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 GAGE1Q13065 139 aa6.99□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 GAGE4Q13068 117 aa6.99□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 GAGE5Q13069 117 aa6.99□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 GAGE13Q4V321 117 aa6.99□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 DEFB121Q5J5C9 76 aa6.99□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.99□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.99□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.98□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.98□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 A0A0J9YWU9 116 aa6.98□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 H3BNG1 76 aa6.98□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 SCGB1D1O95968 90 aa6.98□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.98□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 TMEM141Q96I45 108 aa6.98□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.98□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.98□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.98□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.97□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 C20orf202A1L168 122 aa6.97□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 PAX4O43316 350 aa6.97□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 GYPEP15421 78 aa6.97□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 ODF1Q14990 250 aa6.97□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 MRAPQ8TCY5 172 aa6.97□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 FAM104AQ969W3 186 aa6.97□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.97□□□□□ -1.29
RALGPS1-213ENST00000477700 H7C423 109 aa6.96□□□□□ -1.3
RALGPS1-213ENST00000477700 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RALGPS1-213ENST00000477700 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.96□□□□□ -1.3
RALGPS1-213ENST00000477700 BAALCQ8WXS3 180 aa6.96□□□□□ -1.3
RALGPS1-213ENST00000477700 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.96□□□□□ -1.3
RALGPS1-213ENST00000477700 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RALGPS1-213ENST00000477700 A0A087WX48 190 aa6.95□□□□□ -1.3
RALGPS1-213ENST00000477700 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.95□□□□□ -1.3
RALGPS1-213ENST00000477700 F5H768 121 aa6.95□□□□□ -1.3
RALGPS1-213ENST00000477700 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RALGPS1-213ENST00000477700 Q6ZN92 141 aa6.95□□□□□ -1.3
RALGPS1-213ENST00000477700 Q6ZTC4 211 aa6.95□□□□□ -1.3
RALGPS1-213ENST00000477700 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.95□□□□□ -1.3
RALGPS1-213ENST00000477700 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.95□□□□□ -1.3
RALGPS1-213ENST00000477700 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.95□□□□□ -1.3
RALGPS1-213ENST00000477700 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.94□□□□□ -1.3
RALGPS1-213ENST00000477700 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.94□□□□□ -1.3
RALGPS1-213ENST00000477700 PRSS1P07477 247 aa6.94□□□□□ -1.3
RALGPS1-213ENST00000477700 TIRAPP58753 221 aa6.94□□□□□ -1.3
RALGPS1-213ENST00000477700 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms