RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474147.5

RBMS1-208, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, human

TSL 2

Gene RBMS1, Length 2,854 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBMS1-208	ENST00000474147	CCK	P06307	115 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RBMS1-208	ENST00000474147	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
RBMS1-208	ENST00000474147	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RBMS1-208	ENST00000474147	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RBMS1-208	ENST00000474147	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
RBMS1-208	ENST00000474147	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RBMS1-208	ENST00000474147	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RBMS1-208	ENST00000474147	CTSG	P08311	255 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RBMS1-208	ENST00000474147	CCL4	P13236	92 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RBMS1-208	ENST00000474147	PRSS33	Q8NF86	280 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RBMS1-208	ENST00000474147	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RBMS1-208	ENST00000474147	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RBMS1-208	ENST00000474147	MED13	Q9UHV7	2174 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RBMS1-208	ENST00000474147	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RBMS1-208	ENST00000474147	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RBMS1-208	ENST00000474147	GNRH2	O43555	120 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RBMS1-208	ENST00000474147	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
RBMS1-208	ENST00000474147	KLKP1	Q107X0	134 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RBMS1-208	ENST00000474147	PMAIP1	Q13794	54 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RBMS1-208	ENST00000474147	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RBMS1-208	ENST00000474147	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RBMS1-208	ENST00000474147	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	IGHV1-46	P01743	117 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	MED14OS	P0DP75	135 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	RMI2	Q96E14	147 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147		Q96MF0	132 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147		A0A087WWL8	130 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147		F8WEM9	126 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	RETN	Q9HD89	108 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	IGLV1-47	P01700	117 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	CFHR3	Q02985	330 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	ENHO	Q6UWT2	76 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	SNURF	Q9Y675	71 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	USP24	Q9UPU5	2620 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147		A0A087WYN8	130 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	NCR3	O14931	201 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	NDUFA1	O15239	70 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147		Q6ZRU5	148 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	PRR15	Q8IV56	129 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	ZNF576	Q9H609	170 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147		F5H697	171 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	COPS9	Q8WXC6	57 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	TACC2	O95359	2948 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	TMEM89	A2RUT3	159 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147		M0QY20	66 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	CCL5	P13501	91 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	RNF5	Q99942	180 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	SOCS3	O14543	225 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	BCE1	O60756	84 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	CD28	P10747	220 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	DEFB1	P60022	68 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	CD164	Q04900	197 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147		M0R1B8	84 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBMS1-208	ENST00000474147	SAA4	P35542	130 aa		3.18	□□□□□ -1.9

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms