RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472760.1

PRPF40A-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF40A, Length 243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-208ENST00000472760 SMIM4Q8WVI0 70 aa-0.22□□□□□ -2.44
PRPF40A-208ENST00000472760 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa-0.22□□□□□ -2.44
PRPF40A-208ENST00000472760 SPEF2Q9C093 1822 aa-0.22□□□□□ -2.45
PRPF40A-208ENST00000472760 MRC1P22897 1456 aa-0.22□□□□□ -2.45
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PRPF40A-208ENST00000472760 FAM25GB3EWG6 89 aa-0.23□□□□□ -2.45
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PRPF40A-208ENST00000472760 LAMC1P11047 1609 aa-0.38□□□□□ -2.47
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PRPF40A-208ENST00000472760 APOC2P02655 101 aa-0.39□□□□□ -2.47
PRPF40A-208ENST00000472760 FGF7P21781 194 aa-0.39□□□□□ -2.47
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PRPF40A-208ENST00000472760 C10orf71Q711Q0 1435 aa-0.39□□□□□ -2.47
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