RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460759.1

NISCH-203, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 565 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-203ENST00000460759 ZNRF2Q8NHG8 242 aa9.11□□□□□ -0.95
NISCH-203ENST00000460759 HHLA3Q9XRX5 114 aa9.11□□□□□ -0.95
NISCH-203ENST00000460759 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
NISCH-203ENST00000460759 J3QL48 77 aa9.1□□□□□ -0.95
NISCH-203ENST00000460759 DEFB4AO15263 64 aa9.1□□□□□ -0.95
NISCH-203ENST00000460759 NPSP0C0P6 89 aa9.1□□□□□ -0.95
NISCH-203ENST00000460759 SMAGPQ0VAQ4 97 aa9.1□□□□□ -0.95
NISCH-203ENST00000460759 DEFB121Q5J5C9 76 aa9.1□□□□□ -0.95
NISCH-203ENST00000460759 ERASQ7Z444 233 aa9.1□□□□□ -0.95
NISCH-203ENST00000460759 SBSPONQ8IVN8 264 aa9.1□□□□□ -0.95
NISCH-203ENST00000460759 RETNQ9HD89 108 aa9.1□□□□□ -0.95
NISCH-203ENST00000460759 CELA1Q9UNI1 258 aa9.1□□□□□ -0.95
NISCH-203ENST00000460759 LINC00694P0DN24 101 aa9.09□□□□□ -0.95
NISCH-203ENST00000460759 CRYBA4P53673 196 aa9.09□□□□□ -0.95
NISCH-203ENST00000460759 S100A12P80511 92 aa9.09□□□□□ -0.95
NISCH-203ENST00000460759 C20orf203Q8NBC4 194 aa9.09□□□□□ -0.95
NISCH-203ENST00000460759 TMEM141Q96I45 108 aa9.09□□□□□ -0.95
NISCH-203ENST00000460759 SCGB3A1Q96QR1 104 aa9.09□□□□□ -0.95
NISCH-203ENST00000460759 TIMM17AQ99595 171 aa9.09□□□□□ -0.95
NISCH-203ENST00000460759 GTSF1LQ9H1H1 148 aa9.09□□□□□ -0.95
NISCH-203ENST00000460759 ZMAT4Q9H898 229 aa9.09□□□□□ -0.95
NISCH-203ENST00000460759 GAGE12JA6NER3 117 aa9.08□□□□□ -0.96
NISCH-203ENST00000460759 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
NISCH-203ENST00000460759 GAGE1Q13065 139 aa9.08□□□□□ -0.96
NISCH-203ENST00000460759 GAGE4Q13068 117 aa9.08□□□□□ -0.96
NISCH-203ENST00000460759 GAGE5Q13069 117 aa9.08□□□□□ -0.96
NISCH-203ENST00000460759 GAGE13Q4V321 117 aa9.08□□□□□ -0.96
NISCH-203ENST00000460759 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa9.08□□□□□ -0.96
NISCH-203ENST00000460759 LGALS9CQ6DKI2 356 aa9.08□□□□□ -0.96
NISCH-203ENST00000460759 Q6ZN92 141 aa9.08□□□□□ -0.96
NISCH-203ENST00000460759 LINC00173Q6ZV60 143 aa9.08□□□□□ -0.96
NISCH-203ENST00000460759 PAX4O43316 350 aa9.07□□□□□ -0.96
NISCH-203ENST00000460759 LINC01545Q5VT33 79 aa9.07□□□□□ -0.96
NISCH-203ENST00000460759 SH2D6Q7Z4S9 175 aa9.07□□□□□ -0.96
NISCH-203ENST00000460759 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa9.07□□□□□ -0.96
NISCH-203ENST00000460759 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa9.06□□□□□ -0.96
NISCH-203ENST00000460759 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa9.06□□□□□ -0.96
NISCH-203ENST00000460759 PRSS1P07477 247 aa9.06□□□□□ -0.96
NISCH-203ENST00000460759 TEX43Q6ZNM6 134 aa9.06□□□□□ -0.96
NISCH-203ENST00000460759 Q8N976 141 aa9.06□□□□□ -0.96
NISCH-203ENST00000460759 MRAPQ8TCY5 172 aa9.06□□□□□ -0.96
NISCH-203ENST00000460759 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
NISCH-203ENST00000460759 SPANXA1Q9NS26 97 aa9.06□□□□□ -0.96
NISCH-203ENST00000460759 Q9UF83 564 aa9.06□□□□□ -0.96
NISCH-203ENST00000460759 A0A0J9YWU9 116 aa9.05□□□□□ -0.96
NISCH-203ENST00000460759 IGIPA6NJ69 53 aa9.05□□□□□ -0.96
NISCH-203ENST00000460759 F5H768 121 aa9.05□□□□□ -0.96
NISCH-203ENST00000460759 H3BNG1 76 aa9.05□□□□□ -0.96
NISCH-203ENST00000460759 H7C423 109 aa9.05□□□□□ -0.96
NISCH-203ENST00000460759 GYPEP15421 78 aa9.05□□□□□ -0.96
NISCH-203ENST00000460759 C12orf74Q32Q52 190 aa9.05□□□□□ -0.96
NISCH-203ENST00000460759 B9D2Q9BPU9 175 aa9.05□□□□□ -0.96
NISCH-203ENST00000460759 CHCHD7Q9BUK0 85 aa9.05□□□□□ -0.96
NISCH-203ENST00000460759 TIMM21Q9BVV7 248 aa9.05□□□□□ -0.96
NISCH-203ENST00000460759 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa9.04□□□□□ -0.96
NISCH-203ENST00000460759 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa9.04□□□□□ -0.96
NISCH-203ENST00000460759 C11orf45Q8TAV5 145 aa9.04□□□□□ -0.96
NISCH-203ENST00000460759 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa9.03□□□□□ -0.96
NISCH-203ENST00000460759 H0Y8G0 127 aa9.03□□□□□ -0.96
NISCH-203ENST00000460759 RPL39P62891 51 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
NISCH-203ENST00000460759 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
NISCH-203ENST00000460759 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa9.03□□□□□ -0.96
NISCH-203ENST00000460759 TMEM243Q9BU79 118 aa9.03□□□□□ -0.96
NISCH-203ENST00000460759 VAMP8Q9BV40 100 aa9.03□□□□□ -0.96
NISCH-203ENST00000460759 ICOSQ9Y6W8 199 aa9.03□□□□□ -0.96
NISCH-203ENST00000460759 A0A087WX48 190 aa9.02□□□□□ -0.97
NISCH-203ENST00000460759 ODF1Q14990 250 aa9.02□□□□□ -0.97
NISCH-203ENST00000460759 BAALCQ8WXS3 180 aa9.02□□□□□ -0.97
NISCH-203ENST00000460759 VSIG2Q96IQ7 327 aa9.02□□□□□ -0.97
NISCH-203ENST00000460759 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
NISCH-203ENST00000460759 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa9.02□□□□□ -0.97
NISCH-203ENST00000460759 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa9.01□□□□□ -0.97
NISCH-203ENST00000460759 HSBP1L1C9JCN9 74 aa9.01□□□□□ -0.97
NISCH-203ENST00000460759 UBE2L6O14933 153 aa9.01□□□□□ -0.97
NISCH-203ENST00000460759 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
NISCH-203ENST00000460759 HTN3P15516 51 aa9.01□□□□□ -0.97
NISCH-203ENST00000460759 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
NISCH-203ENST00000460759 PLNP26678 52 aa9.01□□□□□ -0.97
NISCH-203ENST00000460759 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
NISCH-203ENST00000460759 PMVKQ15126 192 aa9.01□□□□□ -0.97
NISCH-203ENST00000460759 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
NISCH-203ENST00000460759 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa9.01□□□□□ -0.97
NISCH-203ENST00000460759 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa9□□□□□ -0.97
NISCH-203ENST00000460759 F8VRH5 84 aa9□□□□□ -0.97
NISCH-203ENST00000460759 DPM2O94777 84 aa9□□□□□ -0.97
NISCH-203ENST00000460759 PKIAP61925 76 aa9□□□□□ -0.97
NISCH-203ENST00000460759 CDPF1Q6NVV7 123 aa9□□□□□ -0.97
NISCH-203ENST00000460759 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa9□□□□□ -0.97
NISCH-203ENST00000460759 Q6ZTC4 211 aa9□□□□□ -0.97
NISCH-203ENST00000460759 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa8.99□□□□□ -0.97
NISCH-203ENST00000460759 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
NISCH-203ENST00000460759 A0A0J9YY99 117 aa8.99□□□□□ -0.97
NISCH-203ENST00000460759 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
NISCH-203ENST00000460759 IGKCP01834 107 aa8.99□□□□□ -0.97
NISCH-203ENST00000460759 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa8.99□□□□□ -0.97
NISCH-203ENST00000460759 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa8.99□□□□□ -0.97
NISCH-203ENST00000460759 VCX2Q9H322 139 aa8.99□□□□□ -0.97
NISCH-203ENST00000460759 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
NISCH-203ENST00000460759 TRAV10A0A0B4J240 114 aa8.98□□□□□ -0.97
NISCH-203ENST00000460759 TSTD3H0UI37 97 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms