RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449575.6

CCDC171-203, Transcript of coiled-coil domain containing 171, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC171, Length 2,628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171-203ENST00000449575 PDE6HQ13956 83 aa7.18□□□□□ -1.26
CCDC171-203ENST00000449575 TEN1Q86WV5 123 aa7.18□□□□□ -1.26
CCDC171-203ENST00000449575 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa7.17□□□□□ -1.26
CCDC171-203ENST00000449575 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CCDC171-203ENST00000449575 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CCDC171-203ENST00000449575 ERCC8Q13216 396 aa7.17□□□□□ -1.26
CCDC171-203ENST00000449575 DEFB135Q30KP9 77 aa7.17□□□□□ -1.26
CCDC171-203ENST00000449575 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.17□□□□□ -1.26
CCDC171-203ENST00000449575 PLNP26678 52 aa7.17□□□□□ -1.26
CCDC171-203ENST00000449575 XCL2Q9UBD3 114 aa7.16□□□□□ -1.26
CCDC171-203ENST00000449575 B5MCH6 92 aa7.16□□□□□ -1.26
CCDC171-203ENST00000449575 CRIP1P50238 77 aa7.16□□□□□ -1.26
CCDC171-203ENST00000449575 NFE4Q86UQ8 179 aa7.16□□□□□ -1.26
CCDC171-203ENST00000449575 TM2D3Q9BRN9 247 aa7.16□□□□□ -1.26
CCDC171-203ENST00000449575 AAMDCQ9H7C9 122 aa7.16□□□□□ -1.26
CCDC171-203ENST00000449575 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-203ENST00000449575 GAGE12JA6NER3 117 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-203ENST00000449575 PRSS29PA6NIE9 313 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-203ENST00000449575 GAGE7O76087 117 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-203ENST00000449575 GAGE12FP0CL80 117 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-203ENST00000449575 GAGE12GP0CL81 117 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-203ENST00000449575 GAGE12IP0CL82 117 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-203ENST00000449575 GAGE4Q13068 117 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-203ENST00000449575 SPINK13Q1W4C9 94 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-203ENST00000449575 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-203ENST00000449575 A8MTW9 85 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-203ENST00000449575 ASIPP42127 132 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-203ENST00000449575 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-203ENST00000449575 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-203ENST00000449575 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-203ENST00000449575 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-203ENST00000449575 A0A087WX48 190 aa7.14□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.14□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 A8MWV9 139 aa7.14□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 PSMB2P49721 201 aa7.14□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 APOC4P55056 127 aa7.14□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 Q8N8P6 123 aa7.14□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa7.14□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 Q8TAT8 98 aa7.14□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 OVOL2Q9BRP0 275 aa7.14□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 SMKR1H3BMG3 65 aa7.14□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.14□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 SH2D1AO60880 128 aa7.14□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 PRM2P04554 102 aa7.14□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 COX8CQ7Z4L0 72 aa7.14□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa7.14□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 RHODO00212 210 aa7.14□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 RBMY1CP0DJD4 496 aa7.14□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 GAGE2BQ13066 116 aa7.14□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 GAGE2EQ4V326 116 aa7.14□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 Q6ZQT7 251 aa7.14□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 OR10J6PQ8NGY7 276 aa7.14□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.14□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 K7EMI3 77 aa7.13□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 Q6Q795 121 aa7.13□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 CARD19Q96LW7 228 aa7.13□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa7.13□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.13□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 SNCGO76070 127 aa7.13□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 UBE2D3P61077 147 aa7.13□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 UBE2D2P62837 147 aa7.13□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 TTC32Q5I0X7 151 aa7.13□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.13□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 H7C1H1 209 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 IGLC6P0CF74 106 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 RPL32P62910 135 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 PRR9Q5T870 116 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 RNF185Q96GF1 192 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 C8orf49Q96NF6 230 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 LINC01549A6NIU2 74 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 C1orf158Q8N1D5 194 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 CNFNQ9BYD5 112 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 CSMD3Q7Z407 3707 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 F8VRH5 84 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 DEFB4AO15263 64 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 SPRY2O43597 315 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 IFITM1P13164 125 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 UBE2D1P51668 147 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 LAGE3Q14657 143 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 FABP5P3A8MUU1 101 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 X6R8D5 127 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 SMIM20Q8N5G0 67 aa7.1□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa7.1□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 DNAH7Q8WXX0 4024 aa7.1□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 A0A0U1RRA0 63 aa7.1□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 TMEM78Q5T7P6 136 aa7.1□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 LINC00477Q96M19 166 aa7.1□□□□□ -1.27
CCDC171-203ENST00000449575 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms