RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449186.2

RPRD1B-202, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

TSL 4

Gene RPRD1B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-202ENST00000449186 TNFRSF6BO95407 300 aa7.37□□□□□ -1.23
RPRD1B-202ENST00000449186 PMCHP20382 165 aa7.37□□□□□ -1.23
RPRD1B-202ENST00000449186 CKS2P33552 79 aa7.37□□□□□ -1.23
RPRD1B-202ENST00000449186 AMTP48728 403 aa7.37□□□□□ -1.23
RPRD1B-202ENST00000449186 RBX1P62877 108 aa7.37□□□□□ -1.23
RPRD1B-202ENST00000449186 COTL1Q14019 142 aa7.37□□□□□ -1.23
RPRD1B-202ENST00000449186 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.37□□□□□ -1.23
RPRD1B-202ENST00000449186 TMEM136Q6ZRR5 245 aa7.37□□□□□ -1.23
RPRD1B-202ENST00000449186 IMMP2LQ96T52 175 aa7.37□□□□□ -1.23
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RPRD1B-202ENST00000449186 PKD1P98161 4303 aa7.37□□□□□ -1.23
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RPRD1B-202ENST00000449186 A0A087WX48 190 aa7.36□□□□□ -1.23
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RPRD1B-202ENST00000449186 I3L3M4 83 aa7.36□□□□□ -1.23
RPRD1B-202ENST00000449186 S100A8P05109 93 aa7.36□□□□□ -1.23
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RPRD1B-202ENST00000449186 ENHOQ6UWT2 76 aa7.35□□□□□ -1.23
RPRD1B-202ENST00000449186 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.35□□□□□ -1.23
RPRD1B-202ENST00000449186 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa7.35□□□□□ -1.23
RPRD1B-202ENST00000449186 C20orf203Q8NBC4 194 aa7.35□□□□□ -1.23
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RPRD1B-202ENST00000449186 ESDP10768 282 aa7.33□□□□□ -1.24
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RPRD1B-202ENST00000449186 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.33□□□□□ -1.24
RPRD1B-202ENST00000449186 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.32□□□□□ -1.24
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RPRD1B-202ENST00000449186 C20orf78Q9BR46 151 aa7.32□□□□□ -1.24
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RPRD1B-202ENST00000449186 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7.31□□□□□ -1.24
RPRD1B-202ENST00000449186 A0A087WTM6 91 aa7.31□□□□□ -1.24
RPRD1B-202ENST00000449186 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa7.31□□□□□ -1.24
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RPRD1B-202ENST00000449186 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa7.3□□□□□ -1.24
RPRD1B-202ENST00000449186 PPP1R17O96001 155 aa7.3□□□□□ -1.24
RPRD1B-202ENST00000449186 PPBPP02775 128 aa7.3□□□□□ -1.24
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RPRD1B-202ENST00000449186 RPL39P62891 51 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RPRD1B-202ENST00000449186 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RPRD1B-202ENST00000449186 NFE4Q86UQ8 179 aa7.3□□□□□ -1.24
RPRD1B-202ENST00000449186 BAALCQ8WXS3 180 aa7.3□□□□□ -1.24
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RPRD1B-202ENST00000449186 PRR34Q9NV39 138 aa7.3□□□□□ -1.24
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RPRD1B-202ENST00000449186 A0A1B0GUV1 79 aa7.29□□□□□ -1.24
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RPRD1B-202ENST00000449186 REG3AQ06141 175 aa7.29□□□□□ -1.24
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RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.29□□□□□ -1.24
RPRD1B-202ENST00000449186 SPATA12Q7Z6I5 190 aa7.29□□□□□ -1.24
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RPRD1B-202ENST00000449186 PHOX2AO14813 284 aa7.28□□□□□ -1.24
RPRD1B-202ENST00000449186 SCO1O75880 301 aa7.28□□□□□ -1.24
RPRD1B-202ENST00000449186 HLA-DQA1P01909 254 aa7.28□□□□□ -1.24
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RPRD1B-202ENST00000449186 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RPRD1B-202ENST00000449186 FABP9Q0Z7S8 132 aa7.28□□□□□ -1.24
RPRD1B-202ENST00000449186 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RPRD1B-202ENST00000449186 FAM104AQ969W3 186 aa7.28□□□□□ -1.24
RPRD1B-202ENST00000449186 KIR2DL4Q99706 377 aa7.28□□□□□ -1.24
RPRD1B-202ENST00000449186 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RPRD1B-202ENST00000449186 PKIAP61925 76 aa7.27□□□□□ -1.25
RPRD1B-202ENST00000449186 MAP1LC3AQ9H492 121 aa7.27□□□□□ -1.25
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