RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa7.9□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 APCSP02743 223 aa7.9□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 CRYGDP07320 174 aa7.9□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP10-1P60331 282 aa7.9□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 FABP9Q0Z7S8 132 aa7.9□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 ZNF56Q15929 161 aa7.9□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 KIAA1644Q3SXP7 199 aa7.9□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 OR10J3Q5JRS4 329 aa7.9□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 RNF185Q96GF1 192 aa7.9□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa7.9□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 F5H697 171 aa7.89□□□□□ -1.15
PRAME-210ENST00000442481 TRGC2P03986 189 aa7.89□□□□□ -1.15
PRAME-210ENST00000442481 RAB4AP20338 218 aa7.89□□□□□ -1.15
PRAME-210ENST00000442481 FAM104BQ5XKR9 115 aa7.89□□□□□ -1.15
PRAME-210ENST00000442481 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa7.89□□□□□ -1.15
PRAME-210ENST00000442481 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.88□□□□□ -1.15
PRAME-210ENST00000442481 PSCAO43653 123 aa7.88□□□□□ -1.15
PRAME-210ENST00000442481 NCR2O95944 276 aa7.88□□□□□ -1.15
PRAME-210ENST00000442481 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
PRAME-210ENST00000442481 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.88□□□□□ -1.15
PRAME-210ENST00000442481 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
PRAME-210ENST00000442481 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa7.87□□□□□ -1.15
PRAME-210ENST00000442481 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.87□□□□□ -1.15
PRAME-210ENST00000442481 D6R8Y8 96 aa7.87□□□□□ -1.15
PRAME-210ENST00000442481 SMKR1H3BMG3 65 aa7.87□□□□□ -1.15
PRAME-210ENST00000442481 SUMO4Q6EEV6 95 aa7.87□□□□□ -1.15
PRAME-210ENST00000442481 UFSP1Q6NVU6 142 aa7.87□□□□□ -1.15
PRAME-210ENST00000442481 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
PRAME-210ENST00000442481 CKS2P33552 79 aa7.86□□□□□ -1.15
PRAME-210ENST00000442481 MRAP2Q96G30 205 aa7.86□□□□□ -1.15
PRAME-210ENST00000442481 GTSF1LQ9H1H1 148 aa7.86□□□□□ -1.15
PRAME-210ENST00000442481 Q9UF83 564 aa7.86□□□□□ -1.15
PRAME-210ENST00000442481 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa7.85□□□□□ -1.15
PRAME-210ENST00000442481 C1orf196B1AJZ1 125 aa7.85□□□□□ -1.15
PRAME-210ENST00000442481 GAS8-AS1O95177 125 aa7.85□□□□□ -1.15
PRAME-210ENST00000442481 IGHV3-30P01768 117 aa7.85□□□□□ -1.15
PRAME-210ENST00000442481 IGHV3-33P01772 117 aa7.85□□□□□ -1.15
PRAME-210ENST00000442481 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa7.85□□□□□ -1.15
PRAME-210ENST00000442481 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.85□□□□□ -1.15
PRAME-210ENST00000442481 LELP1Q5T871 98 aa7.85□□□□□ -1.15
PRAME-210ENST00000442481 ORMDL3Q8N138 153 aa7.85□□□□□ -1.15
PRAME-210ENST00000442481 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa7.85□□□□□ -1.15
PRAME-210ENST00000442481 TIRAPP58753 221 aa7.84□□□□□ -1.15
PRAME-210ENST00000442481 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PRAME-210ENST00000442481 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PRAME-210ENST00000442481 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PRAME-210ENST00000442481 PRELID3AQ96N28 172 aa7.84□□□□□ -1.15
PRAME-210ENST00000442481 H7C1H1 209 aa7.83□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 PHOX2AO14813 284 aa7.83□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 NPYP01303 97 aa7.83□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 PPBPP02775 128 aa7.83□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.83□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa7.82□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 M0QY20 66 aa7.82□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 LINC00694P0DN24 101 aa7.82□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 RAB5BP61020 215 aa7.82□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 HAMPP81172 84 aa7.82□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 NRACQ8N912 160 aa7.82□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa7.82□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 Q9HAA7 133 aa7.82□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 TNFRSF6BO95407 300 aa7.81□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 IQCJQ1A5X6 159 aa7.81□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 LINC01556Q5JQF7 62 aa7.81□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 Q8N814 137 aa7.81□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 MAP1LC3AQ9H492 121 aa7.81□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa7.8□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa7.8□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 HIST1H2BKO60814 126 aa7.8□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 PPP1R17O96001 155 aa7.8□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 HIST1H2BJP06899 126 aa7.8□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 HIST1H2BOP23527 126 aa7.8□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 HIST1H2BBP33778 126 aa7.8□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 HIST1H2BDP58876 126 aa7.8□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 UBE2D3P61077 147 aa7.8□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 HIST1H2BCP62807 126 aa7.8□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 UBE2D2P62837 147 aa7.8□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 HIST2H2BEQ16778 126 aa7.8□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 Q8N3U1 123 aa7.8□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa7.8□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 C18orf32Q8TCD1 76 aa7.8□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 HIST1H2BHQ93079 126 aa7.8□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 HIST1H2BNQ99877 126 aa7.8□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 HIST1H2BMQ99879 126 aa7.8□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 TM2D2Q9BX73 214 aa7.8□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 ST20Q9HBF5 79 aa7.8□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 NIT2Q9NQR4 276 aa7.8□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa7.8□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 DNAJC30Q96LL9 226 aa7.79□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.78□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa7.78□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 C20orf78Q9BR46 151 aa7.78□□□□□ -1.16
PRAME-210ENST00000442481 A0A087WX48 190 aa7.77□□□□□ -1.17
PRAME-210ENST00000442481 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.77□□□□□ -1.17
PRAME-210ENST00000442481 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.77□□□□□ -1.17
PRAME-210ENST00000442481 TMEM262E9PQX1 116 aa7.77□□□□□ -1.17
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