RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437188.1

RPSAP28-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP28, Length 874 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP28-201ENST00000437188 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa7.31□□□□□ -1.24
RPSAP28-201ENST00000437188 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa7.31□□□□□ -1.24
RPSAP28-201ENST00000437188 A0A1B0GWB2 263 aa7.31□□□□□ -1.24
RPSAP28-201ENST00000437188 J3QR89 54 aa7.31□□□□□ -1.24
RPSAP28-201ENST00000437188 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RPSAP28-201ENST00000437188 C12orf74Q32Q52 190 aa7.31□□□□□ -1.24
RPSAP28-201ENST00000437188 C10orf99Q6UWK7 81 aa7.31□□□□□ -1.24
RPSAP28-201ENST00000437188 NFE4Q86UQ8 179 aa7.31□□□□□ -1.24
RPSAP28-201ENST00000437188 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa7.31□□□□□ -1.24
RPSAP28-201ENST00000437188 ZNF479Q96JC4 524 aa7.31□□□□□ -1.24
RPSAP28-201ENST00000437188 VCX2Q9H322 139 aa7.31□□□□□ -1.24
RPSAP28-201ENST00000437188 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
RPSAP28-201ENST00000437188 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.31□□□□□ -1.24
RPSAP28-201ENST00000437188 EDN2P20800 178 aa7.3□□□□□ -1.24
RPSAP28-201ENST00000437188 SLURP1P55000 103 aa7.3□□□□□ -1.24
RPSAP28-201ENST00000437188 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.3□□□□□ -1.24
RPSAP28-201ENST00000437188 C20orf203Q8NBC4 194 aa7.3□□□□□ -1.24
RPSAP28-201ENST00000437188 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa7.3□□□□□ -1.24
RPSAP28-201ENST00000437188 VPS25Q9BRG1 176 aa7.3□□□□□ -1.24
RPSAP28-201ENST00000437188 SPANXA1Q9NS26 97 aa7.3□□□□□ -1.24
RPSAP28-201ENST00000437188 IGLL5B9A064 214 aa7.29□□□□□ -1.24
RPSAP28-201ENST00000437188 F8W1H4 67 aa7.29□□□□□ -1.24
RPSAP28-201ENST00000437188 G3V4G9 280 aa7.29□□□□□ -1.24
RPSAP28-201ENST00000437188 LEPROTO15243 131 aa7.29□□□□□ -1.24
RPSAP28-201ENST00000437188 SPRY2O43597 315 aa7.29□□□□□ -1.24
RPSAP28-201ENST00000437188 NDUFA7O95182 113 aa7.29□□□□□ -1.24
RPSAP28-201ENST00000437188 RRN3P1Q2M238 152 aa7.29□□□□□ -1.24
RPSAP28-201ENST00000437188 LINC01006Q8NI28 216 aa7.29□□□□□ -1.24
RPSAP28-201ENST00000437188 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RPSAP28-201ENST00000437188 JPT2Q9H910 190 aa7.29□□□□□ -1.24
RPSAP28-201ENST00000437188 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa7.28□□□□□ -1.24
RPSAP28-201ENST00000437188 KNCNA6PVL3 124 aa7.28□□□□□ -1.24
RPSAP28-201ENST00000437188 TSHBP01222 138 aa7.28□□□□□ -1.24
RPSAP28-201ENST00000437188 RBX1P62877 108 aa7.28□□□□□ -1.24
RPSAP28-201ENST00000437188 RNF151Q2KHN1 245 aa7.28□□□□□ -1.24
RPSAP28-201ENST00000437188 DEFB114Q30KQ6 69 aa7.28□□□□□ -1.24
RPSAP28-201ENST00000437188 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RPSAP28-201ENST00000437188 NEGR1Q7Z3B1 354 aa7.28□□□□□ -1.24
RPSAP28-201ENST00000437188 TMEM61Q8N0U2 210 aa7.28□□□□□ -1.24
RPSAP28-201ENST00000437188 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RPSAP28-201ENST00000437188 LINC01587Q99440 93 aa7.28□□□□□ -1.24
RPSAP28-201ENST00000437188 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.28□□□□□ -1.24
RPSAP28-201ENST00000437188 MAP6D1Q9H9H5 199 aa7.28□□□□□ -1.24
RPSAP28-201ENST00000437188 J3QQQ9 107 aa7.27□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 RPL39P62891 51 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 STHQ8IWL8 128 aa7.27□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 SELENOKQ9Y6D0 94 aa7.27□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 TMEM238C9JI98 176 aa7.26□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 CIDEAO60543 219 aa7.26□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 CD28P10747 220 aa7.26□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 PROK1P58294 105 aa7.26□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 BEAN1Q3B7T3 259 aa7.26□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 LCE2CQ5TA81 110 aa7.26□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 Q6ZSV7 163 aa7.26□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.25□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 TMEM223A0PJW6 202 aa7.25□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 IGHV3-53P01767 116 aa7.25□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 COTL1Q14019 142 aa7.25□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 C11orf44Q8N8P7 122 aa7.25□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 SLC25A29Q8N8R3 303 aa7.25□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 TIMM21Q9BVV7 248 aa7.25□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 A0A0J9YY99 117 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 K7ERJ3 54 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 CCL24O00175 119 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 RS1O15537 224 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 HTN1P15515 57 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 UBE2D1P51668 147 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 DEFB136Q30KP8 78 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 GAGE13Q4V321 117 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 MRAPQ8TCY5 172 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 FAM110AQ9BQ89 295 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 RYR3Q15413 4870 aa7.24□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa7.23□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.23□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 FHL3Q13643 280 aa7.23□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 CFAP126Q5VTH2 177 aa7.23□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 COPS9Q8WXC6 57 aa7.23□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 AMELXQ99217 191 aa7.23□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa7.23□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 C16orf95Q9H693 158 aa7.23□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.23□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 P0DMU3 169 aa7.22□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 FAM231AP0DMU4 169 aa7.22□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 FAM231CP0DMU5 169 aa7.22□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 PCP4P48539 62 aa7.22□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.22□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa7.22□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 ZNRF2Q8NHG8 242 aa7.22□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.9 ms