RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 NPC2P61916 151 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGEF1-210ENST00000437078 C1orf195Q5TG92 126 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM61Q8N0U2 210 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGEF1-210ENST00000437078 Q8N8P6 123 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGEF1-210ENST00000437078 ZFHX3Q15911 3703 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGEF1-210ENST00000437078 H3BMM0 161 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGEF1-210ENST00000437078 UBE2WQ96B02 151 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGEF1-210ENST00000437078 SMIM2Q9BVW6 85 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGEF1-210ENST00000437078 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
RABGEF1-210ENST00000437078 SDHAF1A6NFY7 115 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-210ENST00000437078 GPHB5Q86YW7 130 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-210ENST00000437078 LINC01545Q5VT33 79 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-210ENST00000437078 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-210ENST00000437078 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-210ENST00000437078 APCP25054 2843 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-210ENST00000437078 DNAL4O96015 105 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-210ENST00000437078 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-210ENST00000437078 PROK1P58294 105 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A096LNJ9 63 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-210ENST00000437078 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-210ENST00000437078 TEN1Q86WV5 123 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-210ENST00000437078 STHQ8IWL8 128 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-210ENST00000437078 SCRT2Q9NQ03 307 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-210ENST00000437078 RBAKDNA6NC62 111 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF493Q6ZR52 646 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-210ENST00000437078 CEND1Q8N111 149 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-210ENST00000437078 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-210ENST00000437078 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-210ENST00000437078 RRN3P1Q2M238 152 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-210ENST00000437078 ANKRD29Q8N6D5 301 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-210ENST00000437078 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-210ENST00000437078 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-210ENST00000437078 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-210ENST00000437078 LINC01619G3V211 115 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-210ENST00000437078 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-210ENST00000437078 TRAV4A0A0B4J268 109 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-210ENST00000437078 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-210ENST00000437078 HLA-DRB4P13762 266 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-210ENST00000437078 PSMB8P28062 276 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-210ENST00000437078 SUMO4Q6EEV6 95 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-210ENST00000437078 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-210ENST00000437078 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-210ENST00000437078 UNC79Q9P2D8 2635 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-210ENST00000437078 TAL2Q16559 108 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 RNF152Q8N8N0 203 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 PEMTQ9UBM1 199 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 TRGV11A0A075B6L2 103 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 ORMDL2Q53FV1 153 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 hADV29S1A0JD25 119 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 RASL10AQ92737 203 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 SPATA25Q9BR10 227 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 WFDC10AQ9H1F0 79 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 PF4P02776 101 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 LGALS9BQ3B8N2 356 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 LGALS9CQ6DKI2 356 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 H7C1H1 209 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 NDUFC2O95298 119 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 IGLV1-40P01703 118 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 DNAJC30Q96LL9 226 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF702PQ9H963 129 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 F8P00451 2351 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 CD28P10747 220 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM236CP0DP71 79 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A1B0GX51 115 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 ELANEP08246 267 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A0J9YX75 114 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 ATXN8Q156A1 80 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 TRGV2A0A075B6R0 118 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 FGF6P10767 208 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 Q6YL49 198 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 H3BUA1 57 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 J3QLI3 93 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 DSCR8Q96T75 97 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 DCANP1Q8TF63 244 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 J3QKU1 62 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 MPLKIPQ8TAP9 179 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM243Q9BU79 118 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 VCYO14598 125 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 NRACQ8N912 160 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 CCL24O00175 119 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 DEFB130BP0DP73 79 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 DEFB130AP0DP74 79 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-210ENST00000437078 MUC4Q99102 2169 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-210ENST00000437078 NDUFA7O95182 113 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-210ENST00000437078 Q6ZSV7 163 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-210ENST00000437078 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-210ENST00000437078 K7EQG2 157 aa10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms