RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428892.1

APOBEC3C-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

TSL 3

Gene APOBEC3C, Length 1,056 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-202ENST00000428892 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 CKS2P33552 79 aa7.42□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 LINC00315P59091 139 aa7.42□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 ORMDL3Q8N138 153 aa7.42□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 SYT8Q8NBV8 401 aa7.42□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR4C5Q8NGB2 326 aa7.42□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR10AG1Q8NH19 301 aa7.42□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 SAMD10Q9BYL1 202 aa7.42□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa7.41□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 HSBP1O75506 76 aa7.41□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 SERF1AO75920 110 aa7.41□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 SMIM17P0DL12 118 aa7.41□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 ESDP10768 282 aa7.41□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 AMN1Q8IY45 258 aa7.41□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR10D4PQ8NGN7 298 aa7.41□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 C18orf32Q8TCD1 76 aa7.41□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 ICOSQ9Y6W8 199 aa7.41□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 K7EQD1 137 aa7.4□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 M0R381 172 aa7.4□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 CIDEAO60543 219 aa7.4□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 UFSP1Q6NVU6 142 aa7.4□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 NIT1Q86X76 327 aa7.4□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa7.4□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRELID3AQ96N28 172 aa7.4□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 AP1S3Q96PC3 154 aa7.4□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.4□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa7.4□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 D6R8Y8 96 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 LINC00614P0C842 121 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 RAB4AP20338 218 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 PMCHP20382 165 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 FA2HQ7L5A8 372 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 DPH3P1Q9H4G8 78 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 MSRB1Q9NZV6 116 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 A8MWV9 139 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 SIVA1O15304 175 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 NXPH4O95158 308 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 PPP1R17O96001 155 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 SMIM6P0DI80 62 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 EVI2AP22794 236 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 AMTP48728 403 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 IQCJQ1A5X6 159 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 LYPD5Q6UWN5 251 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZFP2Q6ZN57 461 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 Q6ZSN1 163 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC25A29Q8N8R3 303 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 MRAP2Q96G30 205 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 JPT2Q9H910 190 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 IFITM10A6NMD0 228 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 GAGE13Q4V321 117 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 NEGR1Q7Z3B1 354 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 NFE4Q86UQ8 179 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 MAP1LC3AQ9H492 121 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 NUPR1O60356 82 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 MGPP08493 103 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 LINC00694P0DN24 101 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 XGP55808 180 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 TIRAPP58753 221 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 RHOHQ15669 191 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 LINC00518Q8N0U6 118 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 RNF185Q96GF1 192 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa7.35□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa7.35□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 F5H697 171 aa7.35□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 TNFRSF6BO95407 300 aa7.35□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 CRYGDP07320 174 aa7.35□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 C12orf57Q99622 126 aa7.35□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 SMKR1H3BMG3 65 aa7.34□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 RHODO00212 210 aa7.34□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 NPYP01303 97 aa7.34□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.34□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 LINC00310P59036 64 aa7.34□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 SH2D6Q7Z4S9 175 aa7.34□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRADC1Q9BSG0 188 aa7.34□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 Q9UF83 564 aa7.34□□□□□ -1.23
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A087WWL8 130 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 NCR2O95944 276 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 SCGB1D1O95968 90 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 GCSHP23434 173 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 C20orf78Q9BR46 151 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3C-202ENST00000428892 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.33□□□□□ -1.24
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