RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa7.07□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 SMKR1H3BMG3 65 aa7.07□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 RAB4AP20338 218 aa7.07□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 XGP55808 180 aa7.07□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 ELOBQ15370 118 aa7.07□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.07□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 SMIM15Q7Z3B0 74 aa7.07□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.07□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 FRZBQ92765 325 aa7.07□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM243Q9BU79 118 aa7.07□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 PRR34Q9NV39 138 aa7.07□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.06□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.06□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 GCSHP23434 173 aa7.06□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 CLLU1Q5K131 121 aa7.06□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 BORCS7Q96B45 105 aa7.06□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 NAT8BQ9UHF3 227 aa7.06□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.05□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 NCR2O95944 276 aa7.05□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 AMTP48728 403 aa7.05□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 HAMPP81172 84 aa7.05□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 Q0VG73 95 aa7.05□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 RIGQ13278 110 aa7.05□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 COTL1Q14019 142 aa7.05□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 RMI2Q96E14 147 aa7.05□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 COX11Q9Y6N1 276 aa7.05□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 A0A1B0GUV1 79 aa7.04□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 CRPP02741 224 aa7.04□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 RAB14P61106 215 aa7.04□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 PKIAP61925 76 aa7.04□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 LINC01620Q4KN68 170 aa7.04□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 NRACQ8N912 160 aa7.04□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM70Q9BUB7 260 aa7.04□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.04□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.04□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa7.03□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 A0A1B0GXF2 115 aa7.03□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 I3L3M4 83 aa7.03□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 TSHBP01222 138 aa7.03□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 CAMPP49913 170 aa7.03□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 REG3AQ06141 175 aa7.03□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 MIAQ16674 131 aa7.03□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 FAM104BQ5XKR9 115 aa7.03□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 MRAP2Q96G30 205 aa7.03□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM242Q9NWH2 141 aa7.03□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa7.02□□□□□ -1.29
ATG4B-210ENST00000428861 APCSP02743 223 aa7.02□□□□□ -1.29
ATG4B-210ENST00000428861 ESDP10768 282 aa7.02□□□□□ -1.29
ATG4B-210ENST00000428861 ADCYAP1P18509 176 aa7.02□□□□□ -1.29
ATG4B-210ENST00000428861 Q8N1X5 172 aa7.02□□□□□ -1.29
ATG4B-210ENST00000428861 ST20Q9HBF5 79 aa7.02□□□□□ -1.29
ATG4B-210ENST00000428861 UBE2L6O14933 153 aa7.01□□□□□ -1.29
ATG4B-210ENST00000428861 HLA-DQA1P01909 254 aa7.01□□□□□ -1.29
ATG4B-210ENST00000428861 PMCHP20382 165 aa7.01□□□□□ -1.29
ATG4B-210ENST00000428861 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7□□□□□ -1.29
ATG4B-210ENST00000428861 USP17L23D6RBM5 183 aa7□□□□□ -1.29
ATG4B-210ENST00000428861 PRSS1P07477 247 aa7□□□□□ -1.29
ATG4B-210ENST00000428861 FGF6P10767 208 aa7□□□□□ -1.29
ATG4B-210ENST00000428861 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.99□□□□□ -1.29
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ATG4B-210ENST00000428861 HBBP68871 147 aa6.99□□□□□ -1.29
ATG4B-210ENST00000428861 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
ATG4B-210ENST00000428861 A0A1B0GW15 77 aa6.98□□□□□ -1.29
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM218A2RU14 115 aa6.98□□□□□ -1.29
ATG4B-210ENST00000428861 H7C423 109 aa6.98□□□□□ -1.29
ATG4B-210ENST00000428861 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
ATG4B-210ENST00000428861 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
ATG4B-210ENST00000428861 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.98□□□□□ -1.29
ATG4B-210ENST00000428861 Q6ZSA8 131 aa6.98□□□□□ -1.29
ATG4B-210ENST00000428861 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.97□□□□□ -1.29
ATG4B-210ENST00000428861 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.97□□□□□ -1.29
ATG4B-210ENST00000428861 D6R8Y8 96 aa6.97□□□□□ -1.29
ATG4B-210ENST00000428861 VCYO14598 125 aa6.97□□□□□ -1.29
ATG4B-210ENST00000428861 PPP1R2P9O14990 202 aa6.97□□□□□ -1.29
ATG4B-210ENST00000428861 TNFRSF6BO95407 300 aa6.97□□□□□ -1.29
ATG4B-210ENST00000428861 NPYP01303 97 aa6.97□□□□□ -1.29
ATG4B-210ENST00000428861 CKS2P33552 79 aa6.97□□□□□ -1.29
ATG4B-210ENST00000428861 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.97□□□□□ -1.29
ATG4B-210ENST00000428861 C7orf77A4D0Y5 90 aa6.96□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 LINC00862A6NCI5 91 aa6.96□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.96□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 SLPIP03973 132 aa6.96□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 UQCC3Q6UW78 93 aa6.96□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6.96□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 F8W036 122 aa6.95□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 PPP1R17O96001 155 aa6.95□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 MT-ND4LP03901 98 aa6.95□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 C14orf177Q52M58 125 aa6.95□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 COMMD7Q86VX2 200 aa6.95□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 C15orf56Q8N910 161 aa6.95□□□□□ -1.3
ATG4B-210ENST00000428861 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
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