RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa13.49□□□□□ -0.25
LIMS1-208ENST00000428064 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
LIMS1-208ENST00000428064 Q6ZNX1 250 aa13.49□□□□□ -0.25
LIMS1-208ENST00000428064 SLC51BQ86UW2 128 aa13.49□□□□□ -0.25
LIMS1-208ENST00000428064 SDIM1Q6ZPB5 146 aa13.48□□□□□ -0.25
LIMS1-208ENST00000428064 AKAP14Q86UN6 197 aa13.48□□□□□ -0.25
LIMS1-208ENST00000428064 NUDT10Q8NFP7 164 aa13.48□□□□□ -0.25
LIMS1-208ENST00000428064 NUDT11Q96G61 164 aa13.48□□□□□ -0.25
LIMS1-208ENST00000428064 HMCN2Q8NDA2 5059 aa13.47□□□□□ -0.25
LIMS1-208ENST00000428064 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa13.47□□□□□ -0.25
LIMS1-208ENST00000428064 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
LIMS1-208ENST00000428064 COTL1Q14019 142 aa13.47□□□□□ -0.25
LIMS1-208ENST00000428064 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
LIMS1-208ENST00000428064 UBE2L6O14933 153 aa13.46□□□□□ -0.25
LIMS1-208ENST00000428064 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa13.46□□□□□ -0.25
LIMS1-208ENST00000428064 GFRA4Q9GZZ7 299 aa13.46□□□□□ -0.25
LIMS1-208ENST00000428064 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
LIMS1-208ENST00000428064 AMTP48728 403 aa13.45□□□□□ -0.26
LIMS1-208ENST00000428064 hDV102S1A0JD36 115 aa13.44□□□□□ -0.26
LIMS1-208ENST00000428064 PANO1I0J062 215 aa13.44□□□□□ -0.26
LIMS1-208ENST00000428064 TWIST1Q15672 202 aa13.44□□□□□ -0.26
LIMS1-208ENST00000428064 K7EN84 100 aa13.43□□□□□ -0.26
LIMS1-208ENST00000428064 GATD1Q8NB37 220 aa13.43□□□□□ -0.26
LIMS1-208ENST00000428064 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
LIMS1-208ENST00000428064 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
LIMS1-208ENST00000428064 AP5S1Q9NUS5 200 aa13.42□□□□□ -0.26
LIMS1-208ENST00000428064 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa13.41□□□□□ -0.26
LIMS1-208ENST00000428064 NCR2O95944 276 aa13.41□□□□□ -0.26
LIMS1-208ENST00000428064 OCC1Q8TAD7 63 aa13.41□□□□□ -0.26
LIMS1-208ENST00000428064 RNF185Q96GF1 192 aa13.41□□□□□ -0.26
LIMS1-208ENST00000428064 TEX261Q6UWH6 196 aa13.4□□□□□ -0.26
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM250H0YL14 139 aa13.39□□□□□ -0.27
LIMS1-208ENST00000428064 H7C423 109 aa13.39□□□□□ -0.27
LIMS1-208ENST00000428064 SLPIP03973 132 aa13.39□□□□□ -0.27
LIMS1-208ENST00000428064 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
LIMS1-208ENST00000428064 ALKAL2Q6UX46 152 aa13.39□□□□□ -0.27
LIMS1-208ENST00000428064 GTSF1Q8WW33 167 aa13.39□□□□□ -0.27
LIMS1-208ENST00000428064 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa13.38□□□□□ -0.27
LIMS1-208ENST00000428064 FAM231DQ6ZW35 169 aa13.38□□□□□ -0.27
LIMS1-208ENST00000428064 SMIM15Q7Z3B0 74 aa13.38□□□□□ -0.27
LIMS1-208ENST00000428064 C15orf56Q8N910 161 aa13.38□□□□□ -0.27
LIMS1-208ENST00000428064 CFAP161Q6P656 301 aa13.37□□□□□ -0.27
LIMS1-208ENST00000428064 SPACA4Q8TDM5 124 aa13.37□□□□□ -0.27
LIMS1-208ENST00000428064 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
LIMS1-208ENST00000428064 GAGE12HA6NDE8 117 aa13.35□□□□□ -0.27
LIMS1-208ENST00000428064 APCSP02743 223 aa13.35□□□□□ -0.27
LIMS1-208ENST00000428064 CT83Q5H943 113 aa13.35□□□□□ -0.27
LIMS1-208ENST00000428064 LYPD6BQ8NI32 183 aa13.35□□□□□ -0.27
LIMS1-208ENST00000428064 A8MWL6 223 aa13.34□□□□□ -0.27
LIMS1-208ENST00000428064 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
LIMS1-208ENST00000428064 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa13.34□□□□□ -0.27
LIMS1-208ENST00000428064 FAM210AQ96ND0 272 aa13.34□□□□□ -0.27
LIMS1-208ENST00000428064 A0A087WYN8 130 aa13.33□□□□□ -0.28
LIMS1-208ENST00000428064 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa13.33□□□□□ -0.28
LIMS1-208ENST00000428064 SDHAF1A6NFY7 115 aa13.33□□□□□ -0.28
LIMS1-208ENST00000428064 GATCO43716 136 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
LIMS1-208ENST00000428064 BLOC1S1P78537 153 aa13.33□□□□□ -0.28
LIMS1-208ENST00000428064 Q6ZRU5 148 aa13.33□□□□□ -0.28
LIMS1-208ENST00000428064 FGF6P10767 208 aa13.32□□□□□ -0.28
LIMS1-208ENST00000428064 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
LIMS1-208ENST00000428064 PLAC8Q9NZF1 115 aa13.32□□□□□ -0.28
LIMS1-208ENST00000428064 I3L3M4 83 aa13.31□□□□□ -0.28
LIMS1-208ENST00000428064 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
LIMS1-208ENST00000428064 CHTF8P0CG12 524 aa13.31□□□□□ -0.28
LIMS1-208ENST00000428064 RPS10P46783 165 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
LIMS1-208ENST00000428064 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
LIMS1-208ENST00000428064 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
LIMS1-208ENST00000428064 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa13.3□□□□□ -0.28
LIMS1-208ENST00000428064 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
LIMS1-208ENST00000428064 CEBPGP53567 150 aa13.3□□□□□ -0.28
LIMS1-208ENST00000428064 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
LIMS1-208ENST00000428064 OR5A1Q8NGJ0 315 aa13.29□□□□□ -0.28
LIMS1-208ENST00000428064 ESDP10768 282 aa13.28□□□□□ -0.28
LIMS1-208ENST00000428064 FOXI1Q12951 378 aa13.28□□□□□ -0.28
LIMS1-208ENST00000428064 BORCS7Q96B45 105 aa13.28□□□□□ -0.28
LIMS1-208ENST00000428064 DPH3Q96FX2 82 aa13.28□□□□□ -0.28
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1B0GVG6 124 aa13.27□□□□□ -0.29
LIMS1-208ENST00000428064 FAM231BA6NCW3 169 aa13.27□□□□□ -0.29
LIMS1-208ENST00000428064 MT1HL1P0DM35 61 aa13.27□□□□□ -0.29
LIMS1-208ENST00000428064 PMCHP20382 165 aa13.27□□□□□ -0.29
LIMS1-208ENST00000428064 COX6A2Q02221 97 aa13.27□□□□□ -0.29
LIMS1-208ENST00000428064 HIGD2BQ4VC39 106 aa13.27□□□□□ -0.29
LIMS1-208ENST00000428064 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa13.27□□□□□ -0.29
LIMS1-208ENST00000428064 TSKUQ8WUA8 353 aa13.26□□□□□ -0.29
LIMS1-208ENST00000428064 BTF3L4Q96K17 158 aa13.26□□□□□ -0.29
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM191AQ9H0A3 160 aa13.26□□□□□ -0.29
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1B0GUT8 65 aa13.25□□□□□ -0.29
LIMS1-208ENST00000428064 LINC01551Q86U37 167 aa13.25□□□□□ -0.29
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM101Q96IK0 257 aa13.25□□□□□ -0.29
LIMS1-208ENST00000428064 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
LIMS1-208ENST00000428064 ST20Q9HBF5 79 aa13.25□□□□□ -0.29
LIMS1-208ENST00000428064 UBR4Q5T4S7 5183 aa13.25□□□□□ -0.29
LIMS1-208ENST00000428064 HIGD1CA8MV81 97 aa13.24□□□□□ -0.29
LIMS1-208ENST00000428064 TSHBP01222 138 aa13.24□□□□□ -0.29
LIMS1-208ENST00000428064 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
LIMS1-208ENST00000428064 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa13.24□□□□□ -0.29
LIMS1-208ENST00000428064 C7orf33Q8WU49 177 aa13.24□□□□□ -0.29
LIMS1-208ENST00000428064 MRAP2Q96G30 205 aa13.24□□□□□ -0.29
LIMS1-208ENST00000428064 SMIM7Q9BQ49 75 aa13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 108.8 ms