RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa10.33□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COTL1Q14019 142 aa10.33□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CHCHD5Q9BSY4 110 aa10.33□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ST20Q9HBF5 79 aa10.33□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa10.32□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SDHAF1A6NFY7 115 aa10.32□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RHEBQ15382 184 aa10.32□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NDUFA5Q16718 116 aa10.32□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NACAE9PAV3 2078 aa10.32□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa10.31□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM262E9PQX1 116 aa10.31□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPBPP02775 128 aa10.31□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM243Q9BU79 118 aa10.31□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 I3L3M4 83 aa10.3□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM70Q9BUB7 260 aa10.3□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa10.29□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa10.29□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 S100PP25815 95 aa10.29□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CKS2P33552 79 aa10.29□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AMTP48728 403 aa10.29□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C20orf78Q9BR46 151 aa10.29□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DNAH17Q9UFH2 4485 aa10.28□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAT2Q9NYQ8 4349 aa10.28□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A1B0GVY2 172 aa10.28□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C7orf77A4D0Y5 90 aa10.28□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VCYO14598 125 aa10.28□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PHOX2AO14813 284 aa10.28□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PMCHP20382 165 aa10.28□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RPS10P46783 165 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q0VG73 95 aa10.28□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SVBPQ8N300 66 aa10.28□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q8N3U1 123 aa10.28□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NRACQ8N912 160 aa10.28□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RMI2Q96E14 147 aa10.28□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TM2D2Q9BX73 214 aa10.28□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COX11Q9Y6N1 276 aa10.28□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A1B0GUV1 79 aa10.27□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 H7C423 109 aa10.27□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UBE2L6O14933 153 aa10.27□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GAS8-AS1O95177 125 aa10.27□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 APCSP02743 223 aa10.27□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RPL32P62910 135 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ODF1Q14990 250 aa10.27□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MPV17L2Q567V2 206 aa10.27□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SMKR1H3BMG3 65 aa10.26□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TCAPO15273 167 aa10.26□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SNAPINO95295 136 aa10.26□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RBX1P62877 108 aa10.26□□□□□ -0.77
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATRAIDQ6UW56 229 aa10.26□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ORMDL3Q8N138 153 aa10.26□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RPS10P5Q9NQ39 176 aa10.26□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KLK12Q9UKR0 248 aa10.26□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa10.26□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 D6R8Y8 96 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 APOC3P02656 99 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ANGP03950 147 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIR2DL4Q99706 377 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q9HAA7 133 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FRAS1Q86XX4 4008 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PSCAO43653 123 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TNFRSF6BO95407 300 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TSHBP01222 138 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CRPP02741 224 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COX19Q49B96 90 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM136Q6ZRR5 245 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UBE2WQ96B02 151 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRR34Q9NV39 138 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BIRC6Q9NR09 4857 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ESDP10768 282 aa10.23□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q8N976 141 aa10.23□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SVIPQ8NHG7 77 aa10.23□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FCER1GP30273 86 aa10.22□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SMAGPQ0VAQ4 97 aa10.22□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MIAQ16674 131 aa10.22□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRELID3AQ96N28 172 aa10.22□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRSS47A8MTI9 375 aa10.21□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NPYP01303 97 aa10.21□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HLA-DQA1P01909 254 aa10.21□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ENHOQ6UWT2 76 aa10.21□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa10.21□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SMIM2Q9BVW6 85 aa10.21□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GNB1LQ9BYB4 327 aa10.21□□□□□ -0.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A087WTM6 91 aa10.2□□□□□ -0.78
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa10.2□□□□□ -0.78
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LINC00269Q8N2A0 174 aa10.2□□□□□ -0.78
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C20orf203Q8NBC4 194 aa10.2□□□□□ -0.78
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C1orf43Q9BWL3 253 aa10.2□□□□□ -0.78
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa10.2□□□□□ -0.78
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa10.19□□□□□ -0.78
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa10.19□□□□□ -0.78
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
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