RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362858.1

RNU6-655P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 655, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-655P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-655P-201ENST00000362858 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP0.2□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 USP24Q9UPU5 2620 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 FOCADQ5VW36 1801 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 IFNGP01579 166 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 SPAG11BQ08648 103 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP0.2□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 SPAG11AQ6PDA7 123 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 C2orf88Q9BSF0 95 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 MRC1P22897 1456 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP0.2□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 PARP14Q460N5 1801 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 FSIP2Q5CZC0 6907 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 ANK2Q01484 3957 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF815PA8K554 130 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 LINC00587B1AMM8 73 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 SSSCA1O60232 199 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 Q5BKY6 102 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 COMMD6Q7Z4G1 85 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 AMELXQ99217 191 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 SPEF2Q9C093 1822 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 ABCA12Q86UK0 2595 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 CORTO00230 105 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 SNAPC5O75971 98 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 TPPP2P59282 170 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 C9orf153Q5TBE3 101 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 SMIM4Q8WVI0 70 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 TSLPQ969D9 159 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 MGST2Q99735 147 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 LINC00474Q9P2X8 69 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 V9GYH0 126 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 ARAP2Q8WZ64 1704 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 F6UZH7 168 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF609O15014 1411 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 SPINK1P00995 79 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 SPINK8P0C7L1 97 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 NPVFQ9HCQ7 196 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 DYNLRB1Q9NP97 96 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 NWD2Q9ULI1 1742 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 QRICH2Q9H0J4 1663 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 IFT172Q9UG01 1749 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 FAT4Q6V0I7 4981 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 F8VRH5 84 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 GNG4P50150 75 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 FAM213BQ8TBF2 198 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 TMEM203Q969S6 136 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 CNFNQ9BYD5 112 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 DPH3P1Q9H4G8 78 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 LINC00472Q9H8W2 130 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.38
RNU6-655P-201ENST00000362858 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-655P-201ENST00000362858 PIEZO1Q92508 2521 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-655P-201ENST00000362858 A0A0D9SFI3 127 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-655P-201ENST00000362858 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-655P-201ENST00000362858 IGLC7A0M8Q6 106 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-655P-201ENST00000362858 HMGN4O00479 90 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-655P-201ENST00000362858 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-655P-201ENST00000362858 ASXL3Q9C0F0 2248 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-655P-201ENST00000362858 MYOM2P54296 1465 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-655P-201ENST00000362858 F8P00451 2351 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-655P-201ENST00000362858 PRDM2Q13029 1718 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-655P-201ENST00000362858 NALCNQ8IZF0 1738 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-655P-201ENST00000362858 FAM24AA6NFZ4 105 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-655P-201ENST00000362858 UQCR11O14957 56 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-655P-201ENST00000362858 PPP3R1P63098 170 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-655P-201ENST00000362858 COX17Q14061 63 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-655P-201ENST00000362858 BAGE2Q86Y30 109 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-655P-201ENST00000362858 MYOZ3Q8TDC0 251 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-655P-201ENST00000362858 GNG8Q9UK08 70 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-655P-201ENST00000362858 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-655P-201ENST00000362858 MYH7P12883 1935 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-655P-201ENST00000362858 PI4KAP42356 2102 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-655P-201ENST00000362858 DOCK1Q14185 1865 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-655P-201ENST00000362858 NAV2Q8IVL1 2488 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-655P-201ENST00000362858 PATJQ8NI35 1801 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-655P-201ENST00000362858 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-655P-201ENST00000362858 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-655P-201ENST00000362858 BCE1O60756 84 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-655P-201ENST00000362858 S100A1P23297 94 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-655P-201ENST00000362858 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-655P-201ENST00000362858 HAMPP81172 84 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-655P-201ENST00000362858 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-655P-201ENST00000362858 TMEM170BQ5T4T1 132 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-655P-201ENST00000362858 C10orf71Q711Q0 1435 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-655P-201ENST00000362858 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-655P-201ENST00000362858 POLQO75417 2590 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-655P-201ENST00000362858 WDR7Q9Y4E6 1490 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-655P-201ENST00000362858 CACNA1CQ13936 2221 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-655P-201ENST00000362858 APOC3P02656 99 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-655P-201ENST00000362858 IFITM1P13164 125 aa0.12□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.8 ms