RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299238.6

HPS6-201, Transcript of HPS6, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene HPS6, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6-201ENST00000299238 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa14.96□□□□□ -0.02
HPS6-201ENST00000299238 EDA2RQ9HAV5 297 aa14.96□□□□□ -0.02
HPS6-201ENST00000299238 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS6-201ENST00000299238 JPT2Q9H910 190 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS6-201ENST00000299238 HERVK_113P61574 105 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS6-201ENST00000299238 C2orf82Q6UX34 121 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS6-201ENST00000299238 K7EMT4 169 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS6-201ENST00000299238 PMVKQ15126 192 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS6-201ENST00000299238 ORMDL2Q53FV1 153 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS6-201ENST00000299238 TRAV25A0A0B4J276 109 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS6-201ENST00000299238 KLLNB2CW77 178 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS6-201ENST00000299238 P0DMU3 169 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS6-201ENST00000299238 FAM231AP0DMU4 169 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS6-201ENST00000299238 FAM231CP0DMU5 169 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS6-201ENST00000299238 POM121L12Q8N7R1 296 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS6-201ENST00000299238 DCANP1Q8TF63 244 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS6-201ENST00000299238 NXPH4O95158 308 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS6-201ENST00000299238 AMELXQ99217 191 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS6-201ENST00000299238 CR1P17927 2039 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS6-201ENST00000299238 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS6-201ENST00000299238 IGKV3-20P01619 116 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS6-201ENST00000299238 ZNF843Q8N446 348 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS6-201ENST00000299238 H7C423 109 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS6-201ENST00000299238 TRIAP1O43715 76 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS6-201ENST00000299238 TMEM170BQ5T4T1 132 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS6-201ENST00000299238 C3orf22Q8N5N4 141 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS6-201ENST00000299238 TMEM101Q96IK0 257 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS6-201ENST00000299238 TSHBP01222 138 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS6-201ENST00000299238 MUSTN1Q8IVN3 82 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS6-201ENST00000299238 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS6-201ENST00000299238 TMEM89A2RUT3 159 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS6-201ENST00000299238 LINC00315P59091 139 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS6-201ENST00000299238 PTPN13Q12923 2485 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS6-201ENST00000299238 A0A087WWL8 130 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS6-201ENST00000299238 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS6-201ENST00000299238 J3KT08 172 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS6-201ENST00000299238 KRTAP10-9P60411 292 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS6-201ENST00000299238 FSHBP01225 129 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS6-201ENST00000299238 IGHV4-31P0DP07 118 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS6-201ENST00000299238 ABCA12Q86UK0 2595 aa14.87□□□□□ -0.03
HPS6-201ENST00000299238 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa14.87□□□□□ -0.03
HPS6-201ENST00000299238 ZNRF2Q8NHG8 242 aa14.87□□□□□ -0.03
HPS6-201ENST00000299238 MYO9AB2RTY4 2548 aa14.87□□□□□ -0.03
HPS6-201ENST00000299238 J3QQQ9 107 aa14.87□□□□□ -0.03
HPS6-201ENST00000299238 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa14.86□□□□□ -0.03
HPS6-201ENST00000299238 Q6YL49 198 aa14.86□□□□□ -0.03
HPS6-201ENST00000299238 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa14.86□□□□□ -0.03
HPS6-201ENST00000299238 PPP1R17O96001 155 aa14.86□□□□□ -0.03
HPS6-201ENST00000299238 CLEC2BQ92478 149 aa14.86□□□□□ -0.03
HPS6-201ENST00000299238 LINC01600Q96MT4 127 aa14.86□□□□□ -0.03
HPS6-201ENST00000299238 A0A0B4J2C4 111 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS6-201ENST00000299238 FAM74A4Q5TZK3 123 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS6-201ENST00000299238 ZNF702PQ9H963 129 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS6-201ENST00000299238 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS6-201ENST00000299238 A0A087WW49 117 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS6-201ENST00000299238 F5H697 171 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS6-201ENST00000299238 Q6ZSV7 163 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS6-201ENST00000299238 RPL39P62891 51 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HPS6-201ENST00000299238 DUX5Q96PT3 197 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS6-201ENST00000299238 NAV2Q8IVL1 2488 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS6-201ENST00000299238 UQCRQO14949 82 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS6-201ENST00000299238 WIPF1O43516 503 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS6-201ENST00000299238 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HPS6-201ENST00000299238 TLN2Q9Y4G6 2542 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS6-201ENST00000299238 SMCR5Q8TEV8 140 aa14.83□□□□□ -0.03
HPS6-201ENST00000299238 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa14.83□□□□□ -0.03
HPS6-201ENST00000299238 SYNJ2BPP57105 145 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS6-201ENST00000299238 SUMO4Q6EEV6 95 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS6-201ENST00000299238 LINC00526Q96FQ7 95 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS6-201ENST00000299238 CYSTM1Q9H1C7 97 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS6-201ENST00000299238 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
HPS6-201ENST00000299238 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS6-201ENST00000299238 DEFB113Q30KQ7 82 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS6-201ENST00000299238 TEX15Q9BXT5 2789 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS6-201ENST00000299238 A0A0J9YX75 114 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS6-201ENST00000299238 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS6-201ENST00000299238 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
HPS6-201ENST00000299238 K7EQG2 157 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS6-201ENST00000299238 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
HPS6-201ENST00000299238 C9orf85Q96MD7 179 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS6-201ENST00000299238 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS6-201ENST00000299238 A0A1B0GX51 115 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS6-201ENST00000299238 TMEM223A0PJW6 202 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS6-201ENST00000299238 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
HPS6-201ENST00000299238 SPINK13Q1W4C9 94 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS6-201ENST00000299238 UBE2E2Q96LR5 201 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS6-201ENST00000299238 IGIPA6NJ69 53 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS6-201ENST00000299238 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS6-201ENST00000299238 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
HPS6-201ENST00000299238 EPG5Q9HCE0 2579 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS6-201ENST00000299238 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS6-201ENST00000299238 ICOSQ9Y6W8 199 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS6-201ENST00000299238 SDHAF1A6NFY7 115 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS6-201ENST00000299238 H3BT86 120 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS6-201ENST00000299238 Q96MF0 132 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS6-201ENST00000299238 GAGE2AQ6NT46 116 aa14.77□□□□□ -0.04
HPS6-201ENST00000299238 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa14.77□□□□□ -0.05
HPS6-201ENST00000299238 OR13C6PQ8NH95 151 aa14.77□□□□□ -0.05
HPS6-201ENST00000299238 hADV29S1A0JD25 119 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS6-201ENST00000299238 DEFB121Q5J5C9 76 aa14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms