RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641281.1

CCDC196-208, Transcript of coiled-coil domain containing 196, human

Gene CCDC196, Length 1,018 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC196-208	ENST00000641281	IGLV7-43	P04211	117 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CCDC196-208	ENST00000641281	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CCDC196-208	ENST00000641281	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CCDC196-208	ENST00000641281	TAS2R30	P59541	319 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CCDC196-208	ENST00000641281	NEDD8	Q15843	81 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CCDC196-208	ENST00000641281	TPRXL	Q17RH7	258 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CCDC196-208	ENST00000641281	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CCDC196-208	ENST00000641281	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CCDC196-208	ENST00000641281	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CCDC196-208	ENST00000641281	C15orf56	Q8N910	161 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CCDC196-208	ENST00000641281	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CCDC196-208	ENST00000641281	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CCDC196-208	ENST00000641281	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CCDC196-208	ENST00000641281	RAB2A	P61019	212 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	SPCS2	Q15005	226 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	CST9LP1	Q5W188	147 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	FXYD5	Q96DB9	178 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	TVP23C	Q96ET8	276 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	HYLS1	Q96M11	299 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	MCUB	Q9NWR8	336 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	BAX	Q07812	192 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	SFT2D2	O95562	160 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	MITD1	Q8WV92	249 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281		A0A1W2PNN7	141 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	C7orf66	A4D0T2	115 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	OR7C2	O60412	319 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	GCG	P01275	180 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	PPP1R1A	Q13522	171 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	AP3S1	Q92572	193 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281		L7N2F9	121 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	4.11	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	CST7	O76096	145 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	FGF7	P21781	194 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	SULT1A2	P50226	295 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	BCAP31	P51572	246 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	ZFP69	Q49AA0	526 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	SFRP2	Q96HF1	295 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	DERL1	Q9BUN8	251 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	OTOR	Q9NRC9	128 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	IL36B	Q9NZH7	164 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281		A0A087WZ39	114 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	NCS1	P62166	190 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	SMUG1	Q53HV7	270 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	CARD19	Q96LW7	228 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281		H3BVH4	76 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	S100A11	P31949	105 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	TMBIM6	P55061	237 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	VBP1	P61758	197 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCDC196-208	ENST00000641281	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.09	□□□□□ -1.75

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