RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617928.4

CYFIP1-208, Transcript of cytoplasmic FMR1 interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CYFIP1, Length 6,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1-208ENST00000617928 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.64□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 MDFICQ9P1T7 246 aa6.64□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 A6NDX4 124 aa6.64□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 LY6G6CO95867 125 aa6.64□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.64□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 ZNF747Q9BV97 191 aa6.64□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 SIRPDQ9H106 197 aa6.64□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 H3BQ85 93 aa6.64□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.64□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.64□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 NACAE9PAV3 2078 aa6.64□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 ZGRF1Q86YA3 2104 aa6.64□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 CACNA1HO95180 2353 aa6.64□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 TMEM89A2RUT3 159 aa6.64□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 TAX1BP3O14907 124 aa6.64□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 LECT2O14960 151 aa6.63□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 IGLV3-1P01715 115 aa6.63□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa6.63□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 TEX22C9J3V5 150 aa6.63□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 ACYP1P07311 99 aa6.63□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 PSMB8P28062 276 aa6.63□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.63□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.63□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 GPR179Q6PRD1 2367 aa6.63□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 MT-ATP8P03928 68 aa6.63□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 C7orf33Q8WU49 177 aa6.63□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 COX7BP24311 80 aa6.63□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa6.63□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 TEN1Q86WV5 123 aa6.62□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.62□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.62□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 Q6ZUT4 128 aa6.62□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 LY6G6DO95868 133 aa6.62□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 REG3AQ06141 175 aa6.62□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 IL15RAQ13261 267 aa6.62□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 NOTCH3Q9UM47 2321 aa6.61□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 PATE2Q6UY27 113 aa6.61□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa6.61□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 ZNF843Q8N446 348 aa6.61□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa6.61□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 SIP14410 1827 aa6.61□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 Q8NA96 180 aa6.61□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A0B4J2C4 111 aa6.61□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 P0DMU3 169 aa6.61□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 FAM231AP0DMU4 169 aa6.61□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 FAM231CP0DMU5 169 aa6.61□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 Q6YL49 198 aa6.61□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa6.61□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 Q6ZTI0 123 aa6.61□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.61□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A0J9YX75 114 aa6.6□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.6□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC01545Q5VT33 79 aa6.6□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 TANC1Q9C0D5 1861 aa6.6□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC01620Q4KN68 170 aa6.6□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.6□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.6□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 CLEC2BQ92478 149 aa6.6□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 TOMM6Q96B49 74 aa6.6□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 PLCE1Q9P212 2302 aa6.6□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.59□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 UQCRQO14949 82 aa6.59□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.59□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.59□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 WISP2O76076 250 aa6.59□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 LGALS9O00182 355 aa6.59□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 PLXNA2O75051 1894 aa6.59□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 LYRM9A8MSI8 78 aa6.58□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 CRYGBP07316 175 aa6.58□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.58□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.58□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 PCNX1Q96RV3 2341 aa6.58□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC01548A6NM66 108 aa6.58□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 E7EUB6 86 aa6.58□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.58□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa6.58□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.58□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 IGLV1-47P01700 117 aa6.58□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 FAM236CP0DP71 79 aa6.58□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.58□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 NBASA2RRP1 2371 aa6.58□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa6.57□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.57□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.57□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 NFE4Q86UQ8 179 aa6.57□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 MED14OSP0DP75 135 aa6.57□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa6.57□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 CCDC179H3BU77 68 aa6.57□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 LYPD6Q86Y78 171 aa6.57□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.56□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.4 ms