RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604081.1

HOXC-AS2-202, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

Gene HOXC-AS2, Length 2,090 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SORL1Q92673 2214 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CHAC1Q9BUX1 264 aa13.63□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CHD6Q8TD26 2715 aa13.63□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCDC168Q8NDH2 2452 aa13.63□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa13.63□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PMVKQ15126 192 aa13.63□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa13.63□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-202ENST00000604081 OR11H12B2RN74 326 aa13.62□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-202ENST00000604081 I3L3M4 83 aa13.62□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-202ENST00000604081 OR11H2Q8NH07 326 aa13.62□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-202ENST00000604081 H3BRM9 83 aa13.62□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCL25O15444 150 aa13.62□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TSHBP01222 138 aa13.62□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RPL39P62891 51 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ODF3L2Q3SX64 289 aa13.62□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-202ENST00000604081 STHQ8IWL8 128 aa13.62□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SPXQ9BT56 116 aa13.62□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SONP18583 2426 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa13.61□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa13.6□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-202ENST00000604081 E9PLD3 99 aa13.6□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa13.6□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CST9LQ9H4G1 147 aa13.6□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PDZD2O15018 2839 aa13.59□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HILS1P60008 231 aa13.59□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GCSHP23434 173 aa13.58□□□□□ -0.24
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TAL2Q16559 108 aa13.58□□□□□ -0.24
HOXC-AS2-202ENST00000604081 UFSP1Q6NVU6 142 aa13.58□□□□□ -0.24
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C11orf72Q8NBR9 251 aa13.58□□□□□ -0.24
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RHODO00212 210 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PRM2P04554 102 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C20orf203Q8NBC4 194 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C9orf118A6NHY6 69 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HERVK_113P61574 105 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXC-AS2-202ENST00000604081 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXC-AS2-202ENST00000604081 OR4C5Q8NGB2 326 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PRADC1Q9BSG0 188 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TM2D2Q9BX73 214 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXC-AS2-202ENST00000604081 XCL2Q9UBD3 114 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NDUFA7O95182 113 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS2-202ENST00000604081 P0DMU3 169 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FAM231AP0DMU4 169 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FAM231CP0DMU5 169 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BEAN1Q3B7T3 259 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CFAP126Q5VTH2 177 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CEND1Q8N111 149 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C11orf86A6NJI1 115 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SMIM13P0DJ93 91 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SAP30O75446 220 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PROK1P58294 105 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FXYD2P54710 66 aa13.53□□□□□ -0.24
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RS1O15537 224 aa13.52□□□□□ -0.24
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DNAJC30Q96LL9 226 aa13.52□□□□□ -0.24
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
HOXC-AS2-202ENST00000604081 AKAP9Q99996 3911 aa13.52□□□□□ -0.24
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C1orf158Q8N1D5 194 aa13.52□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HIST1H4GQ99525 98 aa13.52□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGHV3-53P01767 116 aa13.51□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-202ENST00000604081 EMP1P54849 157 aa13.51□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RAB37Q96AX2 223 aa13.51□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-202ENST00000604081 H3BUT2 72 aa13.51□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NFE4Q86UQ8 179 aa13.51□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FAM110AQ9BQ89 295 aa13.51□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa13.51□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF815PA8K554 130 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMEM170BQ5T4T1 132 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-202ENST00000604081 Q6ZSN1 163 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-202ENST00000604081 VCX2Q9H322 139 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGLV1-51P01701 117 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-202ENST00000604081 AZU1P20160 251 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GAGE10A6NGK3 116 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-202ENST00000604081 K7EP13 123 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNRF2Q8NHG8 242 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa13.48□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-202ENST00000604081 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-202ENST00000604081 UNC79Q9P2D8 2635 aa13.48□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa13.48□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa13.48□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CRYBA4P53673 196 aa13.48□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SCGB1D4Q6XE38 83 aa13.48□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IL17DQ8TAD2 202 aa13.48□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ACANP16112 2415 aa13.47□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ITPR2Q14571 2701 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SMR3AQ99954 134 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.1 ms