RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597297.1

PDE4C-210, Transcript of phosphodiesterase 4C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4C, Length 1,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4C-210ENST00000597297 TSTD3H0UI37 97 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4C-210ENST00000597297 K7EMI3 77 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4C-210ENST00000597297 M0QY20 66 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4C-210ENST00000597297 NDUFAF3Q9BU61 184 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4C-210ENST00000597297 VAMP8Q9BV40 100 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4C-210ENST00000597297 CSTL1Q9H114 145 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4C-210ENST00000597297 ORMDL2Q53FV1 153 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4C-210ENST00000597297 UFSP1Q6NVU6 142 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4C-210ENST00000597297 EDA2RQ9HAV5 297 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4C-210ENST00000597297 TGP01266 2768 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4C-210ENST00000597297 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4C-210ENST00000597297 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4C-210ENST00000597297 RHODO00212 210 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4C-210ENST00000597297 RS1O15537 224 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4C-210ENST00000597297 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PDE4C-210ENST00000597297 CFAP126Q5VTH2 177 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4C-210ENST00000597297 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PDE4C-210ENST00000597297 KIR2DL5AQ8N109 375 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4C-210ENST00000597297 IFI27L1Q96BM0 104 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4C-210ENST00000597297 C16orf74Q96GX8 76 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4C-210ENST00000597297 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4C-210ENST00000597297 H0Y8G0 127 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4C-210ENST00000597297 H7C1H1 209 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4C-210ENST00000597297 NUDT3O95989 172 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4C-210ENST00000597297 LINC01545Q5VT33 79 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4C-210ENST00000597297 ATOH7Q8N100 152 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4C-210ENST00000597297 PAM16Q9Y3D7 125 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4C-210ENST00000597297 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4C-210ENST00000597297 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4C-210ENST00000597297 VCYO14598 125 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4C-210ENST00000597297 NEGR1Q7Z3B1 354 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4C-210ENST00000597297 C18orf15Q96N68 181 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4C-210ENST00000597297 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 LINC00587B1AMM8 73 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 RRN3P1Q2M238 152 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 DNAH9Q9NYC9 4486 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 PLAC8L1A1L4L8 177 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 ATP5LO75964 103 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 LGALS9BQ3B8N2 356 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 SPATA45Q537H7 98 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 LGALS9CQ6DKI2 356 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 ZFP2Q6ZN57 461 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 KIR2DL4Q99706 377 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 IGHV3-53P01767 116 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 DDTP30046 118 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 Q6ZSN1 163 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 Q6ZTI0 123 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 TOMM6Q96B49 74 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 PMCHL2Q9BQD1 86 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 MAJINQ3KP22 176 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 C2orf66Q6UXQ4 117 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 OR4C5Q8NGB2 326 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 OVOL2Q9BRP0 275 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 TRAV4A0A0B4J268 109 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 P0DMU3 169 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 FAM231AP0DMU4 169 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 FAM231CP0DMU5 169 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 G0S2P27469 103 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 APOC4P55056 127 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 B9D2Q9BPU9 175 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 I3L3M4 83 aa8.42□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 PRSS1P07477 247 aa8.42□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa8.42□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 RHOHQ15669 191 aa8.42□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 DNAJC30Q96LL9 226 aa8.42□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 SCGB3A1Q96QR1 104 aa8.42□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 CYSLTR1Q9Y271 337 aa8.42□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa8.42□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 hDV102S1A0JD36 115 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 SMIM9A6NGZ8 99 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 LINC01549A6NIU2 74 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 TSHBP01222 138 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 ZNF479Q96JC4 524 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 GAGE12BA1L429 117 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 HSBP1L1C9JCN9 74 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 GAGE7O76087 117 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 GAGE12FP0CL80 117 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 GAGE12GP0CL81 117 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 GAGE12IP0CL82 117 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 ODF1Q14990 250 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 Q6ZN92 141 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 SBSPONQ8IVN8 264 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 X6R8D5 127 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 COL7A1Q02388 2944 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4C-210ENST00000597297 A8MZ25 164 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4C-210ENST00000597297 ERASQ7Z444 233 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4C-210ENST00000597297 MIEN1Q9BRT3 115 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4C-210ENST00000597297 DKK2Q9UBU2 259 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4C-210ENST00000597297 TRGV2A0A075B6R0 118 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4C-210ENST00000597297 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4C-210ENST00000597297 K7EQD1 137 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4C-210ENST00000597297 CIDEAO60543 219 aa8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.9 ms