RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597259.1

HERC3-212, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 313 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-212ENST00000597259 LITAFQ99732 161 aa3.51□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 MED28Q9H204 178 aa3.51□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa3.5□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa3.5□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa3.5□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 K7EP13 123 aa3.5□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 PEX7O00628 323 aa3.5□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 MBP02144 154 aa3.5□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 UBE2G2P60604 165 aa3.5□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 ZNF674Q2M3X9 581 aa3.5□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 C14orf177Q52M58 125 aa3.5□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 FAM74A1Q5RGS3 127 aa3.5□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.5□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 LELP1Q5T871 98 aa3.5□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 Q6ZSA8 131 aa3.5□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 OR2T35Q8NGX2 323 aa3.5□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 TXNDC17Q9BRA2 123 aa3.5□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 TMEM167BQ9NRX6 74 aa3.5□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 IL36BQ9NZH7 164 aa3.5□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 UBR4Q5T4S7 5183 aa3.49□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa3.49□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 GRIFINA4D1Z8 144 aa3.49□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 H3BVH4 76 aa3.49□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 SH2D1AO60880 128 aa3.49□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 LTAP01374 205 aa3.49□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 IGHV3-30P01768 117 aa3.49□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 IGHV3-33P01772 117 aa3.49□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 ARMS2P0C7Q2 107 aa3.49□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa3.49□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa3.49□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 EVI2AP22794 236 aa3.49□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 RHOHQ15669 191 aa3.49□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa3.49□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 Q5VSD8 79 aa3.49□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 ZFP2Q6ZN57 461 aa3.49□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 Q8N814 137 aa3.49□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 GTSF1LQ9H1H1 148 aa3.49□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa3.48□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa3.48□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 FABP5P3A8MUU1 101 aa3.48□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 EPM2AB3EWF7 344 aa3.48□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 M0R036 132 aa3.48□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 ARPC5O15511 151 aa3.48□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 IGLV2-8P01709 118 aa3.48□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 MGST1P10620 155 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 RPL19P84098 196 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 PRR27Q6MZM9 219 aa3.48□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 SH2D6Q7Z4S9 175 aa3.48□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 KCNRGQ8N5I3 272 aa3.48□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 NHLRC2Q8NBF2 726 aa3.48□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa3.48□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 MBD3L1Q8WWY6 194 aa3.48□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 SFRP2Q96HF1 295 aa3.48□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 NDFIP1Q9BT67 221 aa3.48□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa3.48□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 Q9HAA7 133 aa3.48□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa3.48□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa3.47□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 A8MWV9 139 aa3.47□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 B4DEV8 164 aa3.47□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 INAFM2P0DMQ5 153 aa3.47□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 ASIPP42127 132 aa3.47□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 PPT1P50897 306 aa3.47□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 UBE2D3P61077 147 aa3.47□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 UBE2D2P62837 147 aa3.47□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 CCL20P78556 96 aa3.47□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 LAGE3Q14657 143 aa3.47□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 LINC01620Q4KN68 170 aa3.47□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 OR10J3Q5JRS4 329 aa3.47□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa3.47□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa3.47□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 NIT1Q86X76 327 aa3.47□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 C10orf126Q8N4M7 172 aa3.47□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 HIST1H2BAQ96A08 127 aa3.47□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 PRADC1Q9BSG0 188 aa3.47□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 TMEM70Q9BUB7 260 aa3.47□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 ZFP30Q9Y2G7 519 aa3.47□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa3.46□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa3.46□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 HMSDA8MTL9 139 aa3.46□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 K7EQM0 130 aa3.46□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 LECT2O14960 151 aa3.46□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 SNAI2O43623 268 aa3.46□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 IFNA7P01567 189 aa3.46□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 SEC11BP0C7V7 166 aa3.46□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 ZNF345Q14585 488 aa3.46□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 RGS21Q2M5E4 152 aa3.46□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 ZFP69Q49AA0 526 aa3.46□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa3.46□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 ATRAIDQ6UW56 229 aa3.46□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 ENHOQ6UWT2 76 aa3.46□□□□□ -1.86
HERC3-212ENST00000597259 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.6 ms