RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591990.5

ITGA2B-205, Transcript of integrin subunit alpha 2b, human

TSL 4

Gene ITGA2B, Length 565 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ITGA2B-205	ENST00000591990	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ITGA2B-205	ENST00000591990	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
ITGA2B-205	ENST00000591990	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ITGA2B-205	ENST00000591990	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ITGA2B-205	ENST00000591990		A0A087WWC5	75 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ITGA2B-205	ENST00000591990	FAM231B	A6NCW3	169 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ITGA2B-205	ENST00000591990	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ITGA2B-205	ENST00000591990		H7C1H1	209 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ITGA2B-205	ENST00000591990		A0A1B0GUT8	65 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ITGA2B-205	ENST00000591990		M0QY20	66 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ITGA2B-205	ENST00000591990	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ITGA2B-205	ENST00000591990	IGHV3-30	P01768	117 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ITGA2B-205	ENST00000591990	IGHV3-33	P01772	117 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ITGA2B-205	ENST00000591990	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ITGA2B-205	ENST00000591990	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ITGA2B-205	ENST00000591990	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
ITGA2B-205	ENST00000591990	RASL11A	Q6T310	242 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ITGA2B-205	ENST00000591990	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ITGA2B-205	ENST00000591990	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ITGA2B-205	ENST00000591990		K7EP13	123 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ITGA2B-205	ENST00000591990	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
ITGA2B-205	ENST00000591990	NUP35	Q8NFH5	326 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ITGA2B-205	ENST00000591990	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ITGA2B-205	ENST00000591990	PKHD1	P08F94	4074 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ITGA2B-205	ENST00000591990	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ITGA2B-205	ENST00000591990	TNP2	Q05952	138 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ITGA2B-205	ENST00000591990	RIG	Q13278	110 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ITGA2B-205	ENST00000591990	UQCC3	Q6UW78	93 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ITGA2B-205	ENST00000591990	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
ITGA2B-205	ENST00000591990	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
ITGA2B-205	ENST00000591990	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ITGA2B-205	ENST00000591990	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ITGA2B-205	ENST00000591990	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
ITGA2B-205	ENST00000591990		Q8N3U1	123 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ITGA2B-205	ENST00000591990	GATD1	Q8NB37	220 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ITGA2B-205	ENST00000591990	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ITGA2B-205	ENST00000591990	NFE4	Q86UQ8	179 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ITGA2B-205	ENST00000591990	COMMD7	Q86VX2	200 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ITGA2B-205	ENST00000591990	NIT2	Q9NQR4	276 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ITGA2B-205	ENST00000591990	PKD1	P98161	4303 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ITGA2B-205	ENST00000591990		A0A1B0GVY2	172 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ITGA2B-205	ENST00000591990	PPP1R2P9	O14990	202 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ITGA2B-205	ENST00000591990	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ITGA2B-205	ENST00000591990		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
ITGA2B-205	ENST00000591990	NIT1	Q86X76	327 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ITGA2B-205	ENST00000591990	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ITGA2B-205	ENST00000591990	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ITGA2B-205	ENST00000591990	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ITGA2B-205	ENST00000591990	TMEM218	A2RU14	115 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ITGA2B-205	ENST00000591990	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ITGA2B-205	ENST00000591990	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
ITGA2B-205	ENST00000591990		Q9HAA7	133 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ITGA2B-205	ENST00000591990		A0A087WX48	190 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ITGA2B-205	ENST00000591990	MT-ND4L	P03901	98 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ITGA2B-205	ENST00000591990	ADCYAP1	P18509	176 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ITGA2B-205	ENST00000591990	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ITGA2B-205	ENST00000591990	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ITGA2B-205	ENST00000591990	AMN1	Q8IY45	258 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ITGA2B-205	ENST00000591990	FRZB	Q92765	325 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ITGA2B-205	ENST00000591990	RNF185	Q96GF1	192 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ITGA2B-205	ENST00000591990	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ITGA2B-205	ENST00000591990	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ITGA2B-205	ENST00000591990	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ITGA2B-205	ENST00000591990	LINC00862	A6NCI5	91 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ITGA2B-205	ENST00000591990	TMEM262	E9PQX1	116 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ITGA2B-205	ENST00000591990		F8W036	122 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ITGA2B-205	ENST00000591990	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
ITGA2B-205	ENST00000591990	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ITGA2B-205	ENST00000591990		A0A1B0GW15	77 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ITGA2B-205	ENST00000591990	RAB4A	P20338	218 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ITGA2B-205	ENST00000591990	CAMP	P49913	170 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ITGA2B-205	ENST00000591990	LAGE3	Q14657	143 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ITGA2B-205	ENST00000591990	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ITGA2B-205	ENST00000591990	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ITGA2B-205	ENST00000591990	MRAP2	Q96G30	205 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ITGA2B-205	ENST00000591990	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
ITGA2B-205	ENST00000591990	PKIA	P61925	76 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ITGA2B-205	ENST00000591990	HBB	P68871	147 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ITGA2B-205	ENST00000591990	COTL1	Q14019	142 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ITGA2B-205	ENST00000591990	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ITGA2B-205	ENST00000591990	KLK12	Q9UKR0	248 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ITGA2B-205	ENST00000591990		A0A1B0GXF2	115 aa		10.05	□□□□□ -0.8
ITGA2B-205	ENST00000591990	GAS8-AS1	O95177	125 aa		10.05	□□□□□ -0.8
ITGA2B-205	ENST00000591990	NCR2	O95944	276 aa		10.05	□□□□□ -0.8
ITGA2B-205	ENST00000591990	S100A8	P05109	93 aa		10.05	□□□□□ -0.8
ITGA2B-205	ENST00000591990	GAGE6	Q13070	117 aa		10.05	□□□□□ -0.8
ITGA2B-205	ENST00000591990	MPV17L2	Q567V2	206 aa		10.05	□□□□□ -0.8
ITGA2B-205	ENST00000591990	TMEM243	Q9BU79	118 aa		10.05	□□□□□ -0.8
ITGA2B-205	ENST00000591990	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		10.04	□□□□□ -0.8
ITGA2B-205	ENST00000591990	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		10.04	□□□□□ -0.8
ITGA2B-205	ENST00000591990	SMKR1	H3BMG3	65 aa		10.04	□□□□□ -0.8
ITGA2B-205	ENST00000591990	PSCA	O43653	123 aa		10.04	□□□□□ -0.8
ITGA2B-205	ENST00000591990	AMT	P48728	403 aa		10.04	□□□□□ -0.8
ITGA2B-205	ENST00000591990	ELOB	Q15370	118 aa		10.04	□□□□□ -0.8
ITGA2B-205	ENST00000591990	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		10.04	□□□□□ -0.8
ITGA2B-205	ENST00000591990	SEC11C	Q9BY50	192 aa		10.04	□□□□□ -0.8
ITGA2B-205	ENST00000591990	ST20	Q9HBF5	79 aa		10.04	□□□□□ -0.8
ITGA2B-205	ENST00000591990	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ITGA2B-205	ENST00000591990	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
ITGA2B-205	ENST00000591990	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8

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